231 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Sterm_0022  CDS  NC_013517  27446  27913  -  468  protein of unknown function DUF163  YP_003306841  unclonable  0.000000000120768  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0043  CDS  NC_013517  51123  51767  +  645  hypothetical protein  YP_003306862  unclonable  0.000000000215417  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0080  CDS  NC_013517  84024  84815  -  792  ribosomal protein S2  YP_003306896  unclonable  0.000000000155744  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0090  CDS  NC_013517  97159  100113  +  2955  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_003306906  unclonable  0.00000165147  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0091  CDS  NC_013517  100123  101043  +  921  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_003306907  unclonable  0.000000000878302  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0092  CDS  NC_013517  101366  102703  +  1338  hypothetical protein  YP_003306908  unclonable  0.00000000278192  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0093  CDS  NC_013517  102709  102957  +  249  RNA-binding S4 domain protein  YP_003306909  unclonable  0.0000000000415805  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0094  CDS  NC_013517  102954  103811  +  858  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  YP_003306910  unclonable  0.000000000449957  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0095  CDS  NC_013517  104012  104311  +  300  SpoVG family protein  YP_003306911  unclonable  0.0000000000535808  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0096  CDS  NC_013517  104480  105043  +  564  transferase hexapeptide repeat containing protein  YP_003306912  unclonable  0.000000000143526  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0097  CDS  NC_013517  105127  105699  +  573  peptidyl-tRNA hydrolase  YP_003306913  unclonable  0.00000000012965  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0226  CDS  NC_013517  236691  237161  +  471  transcriptional regulator, MarR family  YP_003307042  unclonable  0.0000000000277932  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0256  CDS  NC_013517  281449  282087  +  639  hypothetical protein  YP_003307072  unclonable  0.000000000350084  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0285  CDS  NC_013517  315326  315856  +  531  hypothetical protein  YP_003307100  unclonable  0.000000000100535  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0286  CDS  NC_013517  316287  318629  +  2343  hypothetical protein  YP_003307101  unclonable  0.0000000987796  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0287  CDS  NC_013517  318610  319161  +  552  hypothetical protein  YP_003307102  unclonable  0.000000000128328  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0295  CDS  NC_013517  325726  326199  +  474  protein of unknown function DUF336  YP_003307110  unclonable  0.000000000114767  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0296  CDS  NC_013517  326347  326472  +  126  hypothetical protein  YP_003307111  unclonable  0.0000000000450971  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0297  CDS  NC_013517  326526  327602  +  1077  ribosome small subunit-dependent GTPase A  YP_003307112  unclonable  0.00000000176326  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0298  CDS  NC_013517  327721  328101  -  381  hypothetical protein  YP_003307113  unclonable  0.000000000110187  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0299  CDS  NC_013517  328194  329426  -  1233  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  YP_003307114  unclonable  0.00000000426165  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0300  CDS  NC_013517  329427  329981  -  555  transcriptional regulator, TetR family  YP_003307115  unclonable  0.000000000186865  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0301  CDS  NC_013517  330175  330969  +  795  Beta-lactamase  YP_003307116  unclonable  0.00000000029774  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0302  CDS  NC_013517  331244  331594  +  351  ribosomal protein L19  YP_003307117  unclonable  0.0000000000399217  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0442  CDS  NC_013517  490656  491450  +  795  hypothetical protein  YP_003307253  unclonable  0.000000000473373  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0443  CDS  NC_013517  491467  492429  +  963  hypothetical protein  YP_003307254  unclonable  0.000000000655262  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0606  CDS  NC_013517  655915  657126  -  1212  uracil-xanthine permease  YP_003307410  unclonable  0.0000000016937  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0627  CDS  NC_013517  680887  681312  +  426  hypothetical protein  YP_003307431  unclonable  0.0000000000399217  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0628  CDS  NC_013517  681347  681730  +  384  hypothetical protein  YP_003307432  unclonable  0.0000000000424406  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0629  CDS  NC_013517  681841  682689  +  849  hypothetical protein  YP_003307433  unclonable  0.000000000266466  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0630  CDS  NC_013517  682847  683056  +  210  hypothetical protein  YP_003307434  unclonable  0.0000000000138912  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0631  CDS  NC_013517  683066  683356  +  291  hypothetical protein  YP_003307435  unclonable  0.0000000000155138  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0632  CDS  NC_013517  683369  683638  +  270  hypothetical protein  YP_003307436  unclonable  0.0000000000166465  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0633  CDS  NC_013517  683855  684307  +  453  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  YP_003307437  unclonable  0.000000000048911  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0634  CDS  NC_013517  684380  684940  +  561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_003307438  unclonable  0.0000000000563815  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0635  CDS  NC_013517  685073  685903  +  831  PP-loop domain protein  YP_003307439  unclonable  0.000000000208948  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0636  CDS  NC_013517  686221  686436  +  216  FeoA family protein  YP_003307440  unclonable  0.0000000000256503  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0637  CDS  NC_013517  686438  688657  +  2220  ferrous iron transport protein B  YP_003307441  unclonable  0.0000000736261  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0645    NC_013517  694419  695607  +  1189      unclonable  0.00000000147061  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0646  CDS  NC_013517  695704  696723  +  1020  hypothetical protein  YP_003307449  unclonable  0.000000000597249  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0647  CDS  NC_013517  697766  698086  +  321  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  YP_003307450  unclonable  0.000000000033306  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0667  CDS  NC_013517  718581  719117  +  537  hypothetical protein  YP_003307470  unclonable  0.000000000120768  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0683  CDS  NC_013517  735766  736260  +  495  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  YP_003307486  unclonable  0.0000000000630574  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0684  CDS  NC_013517  736390  736764  +  375  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  YP_003307487  unclonable  0.0000000000433082  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0685  CDS  NC_013517  736959  737420  +  462  hypothetical protein  YP_003307488  unclonable  0.0000000000765075  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0686  CDS  NC_013517  737420  737794  +  375  hypothetical protein  YP_003307489  unclonable  0.0000000000541321  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0687  CDS  NC_013517  738011  738928  +  918  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  YP_003307490  unclonable  0.000000000215417  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0847  CDS  NC_013517  905087  905719  +  633  hypothetical protein  YP_003307650  unclonable  0.000000000160526  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0848  CDS  NC_013517  905755  906243  +  489  hypothetical protein  YP_003307651  unclonable  0.0000000000946347  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0849  CDS  NC_013517  906926  907060  +  135  hypothetical protein  YP_003307652  unclonable  0.0000000000246329  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0885  CDS  NC_013517  933060  933578  +  519  hypothetical protein  YP_003307687  unclonable  0.0000000000630574  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0886    NC_013517  933669  935000  -  1332      unclonable  0.00000000130301  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0887  CDS  NC_013517  935077  935478  -  402  hypothetical protein  YP_003307688  unclonable  0.0000000000484129  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0888  CDS  NC_013517  935417  935941  -  525  hypothetical protein  YP_003307689  unclonable  0.0000000000726893  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0889  CDS  NC_013517  936038  936223  +  186  hypothetical protein  YP_003307690  unclonable  0.0000000000295259  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0890  CDS  NC_013517  936181  936414  +  234  hypothetical protein  YP_003307691  unclonable  0.0000000000343284  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0891  CDS  NC_013517  936490  936717  +  228  hypothetical protein  YP_003307692  unclonable  0.0000000000220462  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0892  CDS  NC_013517  936816  937808  +  993  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_003307693  unclonable  0.000000000556598  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0893  CDS  NC_013517  937862  938593  +  732  hypothetical protein  YP_003307694  unclonable  0.000000000236104  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0894  CDS  NC_013517  938687  939322  +  636  hypothetical protein  YP_003307695  unclonable  0.00000000022896  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0907  CDS  NC_013517  956185  958881  +  2697  calcium-translocating P-type ATPase, PMCA-type  YP_003307706  unclonable  0.000000623428  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0918  CDS  NC_013517  969675  970226  +  552  hypothetical protein  YP_003307717  unclonable  0.000000000107954  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0919  CDS  NC_013517  970596  971054  +  459  hypothetical protein  YP_003307718  unclonable  0.0000000000927385  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0920  CDS  NC_013517  971428  972099  +  672  hypothetical protein  YP_003307719  unclonable  0.000000000162179  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0978  CDS  NC_013517  1041190  1041903  +  714  transcriptional regulator, GntR family  YP_003307777  unclonable  0.000000000622691  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1108  CDS  NC_013517  1214404  1215450  -  1047  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  YP_003307907  unclonable  0.000000000971871  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1109  CDS  NC_013517  1215749  1216234  +  486  hypothetical protein  YP_003307908  unclonable  0.000000000082959  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1110  CDS  NC_013517  1216305  1216943  +  639  hypothetical protein  YP_003307909  unclonable  0.00000000014203  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1120  CDS  NC_013517  1226274  1227866  +  1593  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_003307919  unclonable  0.00000000341148  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1121  CDS  NC_013517  1228060  1228539  +  480  hypothetical protein  YP_003307920  unclonable  0.0000000000357379  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1157  CDS  NC_013517  1261317  1261844  -  528  hypothetical protein  YP_003307956  unclonable  0.000000000119479  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1158  CDS  NC_013517  1261923  1262885  -  963  DNA binding domain protein, excisionase family  YP_003307957  unclonable  0.000000000597249  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1159  CDS  NC_013517  1263081  1263755  +  675  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  YP_003307958  unclonable  0.000000000255894  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1160  CDS  NC_013517  1263796  1264590  +  795  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  YP_003307959  unclonable  0.000000000579456  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1186  CDS  NC_013517  1288953  1291118  +  2166  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  YP_003307985  unclonable  0.0000000400543  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1229  CDS  NC_013517  1338053  1338766  +  714  hypothetical protein  YP_003308028  unclonable  0.000000000200658  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1290  CDS  NC_013517  1389359  1389877  +  519  transcriptional regulator, MarR family  YP_003308087  unclonable  0.000000000103671  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1291  CDS  NC_013517  1390008  1390313  +  306  hypothetical protein  YP_003308088  unclonable  0.0000000000323141  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1292  CDS  NC_013517  1390643  1392613  +  1971  beta-lactamase domain protein  YP_003308089  unclonable  0.0000000152038  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1293  CDS  NC_013517  1392792  1392929  +  138  hypothetical protein  YP_003308090  unclonable  0.0000000000141752  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1294  CDS  NC_013517  1393175  1393357  +  183  hypothetical protein  YP_003308091  unclonable  0.0000000000209611  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1295  CDS  NC_013517  1394048  1394290  +  243  hypothetical protein  YP_003308092  unclonable  0.0000000000225022  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1296  CDS  NC_013517  1394314  1394967  -  654  protein of unknown function DUF421  YP_003308093  unclonable  0.000000000143526  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1297  CDS  NC_013517  1394977  1395423  -  447  hypothetical protein  YP_003308094  unclonable  0.0000000000684072  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1315  CDS  NC_013517  1411179  1411610  +  432  hypothetical protein  YP_003308112  unclonable  0.0000000000617647  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1316  CDS  NC_013517  1411651  1412295  +  645  hypothetical protein  YP_003308113  unclonable  0.000000000132332  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1317  CDS  NC_013517  1412314  1412721  +  408  TPR repeat-containing protein  YP_003308114  unclonable  0.0000000000469709  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1318  CDS  NC_013517  1412702  1414306  +  1605  TPR repeat-containing protein  YP_003308115  unclonable  0.00000000693072  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1319  CDS  NC_013517  1414401  1414565  +  165  hypothetical protein  YP_003308116  unclonable  0.0000000000182184  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1320  CDS  NC_013517  1414610  1414987  +  378  hypothetical protein  YP_003308117  unclonable  0.0000000000391219  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1321  CDS  NC_013517  1416136  1416681  -  546  TPR repeat-containing protein  YP_003308118  unclonable  0.0000000000464925  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1371  CDS  NC_013517  1453450  1454214  -  765  putative esterase  YP_003308166  unclonable  0.000000000125757  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1502  CDS  NC_013517  1589446  1589664  -  219  hypothetical protein  YP_003308293  unclonable  0.0000000000387236  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1517  CDS  NC_013517  1605666  1606049  -  384  rare lipoprotein A  YP_003308307  unclonable  0.0000000000581263  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1538  CDS  NC_013517  1637184  1638086  -  903  hypothetical protein  YP_003308328  unclonable  0.000000000540016  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1558  CDS  NC_013517  1661262  1661537  +  276  histone family protein DNA-binding protein  YP_003308348  unclonable  0.0000000000749747  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1582  CDS  NC_013517  1680472  1681056  -  585  transcriptional regulator, TetR family  YP_003308372  unclonable  0.000000000313158  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1759  CDS  NC_013517  1893138  1893641  -  504  hypothetical protein  YP_003308548  unclonable  0.000000000167239  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1760  CDS  NC_013517  1893825  1894268  +  444  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003308549  unclonable  0.000000000079668  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1771  CDS  NC_013517  1901536  1902192  +  657  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  YP_003308560  unclonable  0.0000000000650244  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>