43 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dbac_0014  CDS  NC_013173  29597  29758  -  162  hypothetical protein  YP_003156560  unclonable  0.000000000200541  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0015  CDS  NC_013173  30060  30398  -  339  hypothetical protein  YP_003156561  unclonable  0.000000000351673  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0053  CDS  NC_013173  75146  77560  -  2415  ATP-dependent protease La  YP_003156599  unclonable  0.000000930171  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0054  CDS  NC_013173  77688  78368  -  681  DNA repair protein RadC  YP_003156600  unclonable  0.00000000185738  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0301  CDS  NC_013173  354799  355776  -  978  carbonic anhydrase  YP_003156844  unclonable  0.00000000471687  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0302  CDS  NC_013173  356000  356818  -  819  hypothetical protein  YP_003156845  unclonable  0.00000000256002  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0310  CDS  NC_013173  363236  364555  -  1320  hypothetical protein  YP_003156853  unclonable  0.0000000163597  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0452  CDS  NC_013173  529157  530209  -  1053  RelA/SpoT domain protein  YP_003156993  unclonable  0.00000000576608  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0513  CDS  NC_013173  594171  594563  -  393  transcriptional regulator, MucR family  YP_003157053  unclonable  0.000000000475378  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0589  CDS  NC_013173  662072  662611  +  540  peptidoglycan-associated lipoprotein  YP_003157129  unclonable  0.00000000303526  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0590  CDS  NC_013173  662780  662923  +  144  hypothetical protein  YP_003157130  unclonable  0.000000000661607  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0591  CDS  NC_013173  662910  665006  -  2097  glucosyltransferase MdoH  YP_003157131  unclonable  0.000000396207  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0592  CDS  NC_013173  665124  665618  -  495  hypothetical protein  YP_003157132  unclonable  0.00000000148932  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0633  CDS  NC_013173  707431  708027  -  597  OmpA/MotB domain protein  YP_003157172  unclonable  0.00000000132054  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0634  CDS  NC_013173  708027  708467  -  441  hypothetical protein  YP_003157173  unclonable  0.000000000800273  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0677  CDS  NC_013173  751290  752537  +  1248  transcription termination factor Rho  YP_003157216  unclonable  0.0000000284119  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0886  CDS  NC_013173  968472  968729  -  258  hypothetical protein  YP_003157419  unclonable  0.000000000515114  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0887  CDS  NC_013173  969445  970143  +  699  hypothetical protein  YP_003157420  unclonable  0.0000000023856  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_1044  CDS  NC_013173  1134950  1138597  +  3648  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_003157573  unclonable  0.000118748  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_1588  CDS  NC_013173  1804308  1805315  +  1008  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  YP_003158097  unclonable  0.00000000466861  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_1814  CDS  NC_013173  2068854  2069984  -  1131  OmpA/MotB domain protein  YP_003158321  unclonable  0.0000000102046  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2231  CDS  NC_013173  2572577  2573368  -  792  protein of unknown function DUF1555  YP_003158729  unclonable  0.00000000471687  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2256  CDS  NC_013173  2598091  2600904  +  2814  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  YP_003158754  unclonable  0.00000277534  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2257  CDS  NC_013173  2601102  2601350  +  249  prevent-host-death family protein  YP_003158755  unclonable  0.000000000344614  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2258  CDS  NC_013173  2601340  2601627  +  288  addiction module toxin, RelE/StbE family  YP_003158756  unclonable  0.000000000447442  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2259  CDS  NC_013173  2601781  2601969  +  189  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  YP_003158757  unclonable  0.000000000334335  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2260  CDS  NC_013173  2602293  2602874  +  582  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_003158758  unclonable  0.0000000016305  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2291  CDS  NC_013173  2629899  2630390  -  492  putative nucleotide-binding protein  YP_003158788  unclonable  0.000000000470515  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2292  CDS  NC_013173  2630693  2631097  +  405  transcriptional regulator, MucR family  YP_003158789  unclonable  0.000000000355308  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2354  CDS  NC_013173  2708924  2709901  -  978  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  YP_003158850  unclonable  0.00000000506174  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2364  CDS  NC_013173  2720545  2720814  -  270  RNP-1 like RNA-binding protein  YP_003158860  unclonable  0.000000000400721  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2593  CDS  NC_013173  2954050  2954580  -  531  peptidoglycan-associated lipoprotein  YP_003159086  unclonable  0.00000000155055  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2764  CDS  NC_013173  3146909  3147277  -  369  ribosomal protein L14  YP_003159256  unclonable  0.000000000816669  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2799  CDS  NC_013173  3178479  3179786  -  1308  outer membrane efflux protein  YP_003159291  unclonable  0.0000000194078  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2800  CDS  NC_013173  3179970  3180068  +  99  hypothetical protein  YP_003159292  unclonable  0.000000000240159  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2963  CDS  NC_013173  3351383  3353164  -  1782  30S ribosomal protein S1  YP_003159454  unclonable  0.000000174303  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_3036  CDS  NC_013173  3434349  3434879  +  531  hypothetical protein  YP_003159527  unclonable  0.0000000011477  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_3145  CDS  NC_013173  3559069  3560376  +  1308  hypothetical protein  YP_003159636  unclonable  0.0000000246792  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_3146  CDS  NC_013173  3560539  3561264  +  726  regulatory protein GntR HTH  YP_003159637  unclonable  0.0000000023856  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_3196  CDS  NC_013173  3619190  3620458  +  1269  sulfate adenylyltransferase  YP_003159687  unclonable  0.0000000304807  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_3197  CDS  NC_013173  3620669  3621157  +  489  adenylylsulfate reductase, beta subunit  YP_003159688  unclonable  0.00000000312858  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_R0059  tRNA  NC_013173  3180078  3180154  +  77  tRNA-Arg    unclonable  0.000000000245079  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_R0060  tRNA  NC_013173  3180313  3180388  +  76  tRNA-Phe    unclonable  0.000000000308543  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>