27 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Aaci_0209  CDS  NC_013205  224143  225630  +  1488  lysyl-tRNA synthetase  YP_003183661  unclonable  0.000000164497  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0379  CDS  NC_013205  432196  432483  +  288  chaperonin Cpn10  YP_003183827  unclonable  0.00000000945621  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0472  CDS  NC_013205  537933  538172  +  240  transcriptional regulator, XRE family  YP_003183919  unclonable  0.0000000091739  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0473  CDS  NC_013205  538156  538326  +  171  hypothetical protein  YP_003183920  unclonable  0.00000000686024  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0474  CDS  NC_013205  538316  538432  +  117  hypothetical protein  YP_003183921  unclonable  0.00000000528795  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0475  CDS  NC_013205  538429  538671  +  243  hypothetical protein  YP_003183922  unclonable  0.0000000072142  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0558  CDS  NC_013205  610786  612012  +  1227  hypothetical protein  YP_003183996  unclonable  0.0000000667131  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0678  CDS  NC_013205  724969  725487  -  519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003184114  unclonable  0.000000011557  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0679  CDS  NC_013205  725836  726636  -  801  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  YP_003184115  unclonable  0.0000000247428  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_1355  CDS  NC_013205  1407183  1407716  +  534  16S rRNA processing protein RimM  YP_003184771  unclonable  0.0000000116768  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_1356  CDS  NC_013205  1407718  1408491  +  774  tRNA (guanine-N1)-methyltransferase  YP_003184772  unclonable  0.0000000265451  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_1472  CDS  NC_013205  1526231  1527856  +  1626  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_003184886  unclonable  0.000000440496  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_1473  CDS  NC_013205  1528087  1529154  +  1068  recA protein  YP_003184887  unclonable  0.000000112388  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_1500  CDS  NC_013205  1555842  1556564  +  723  DNA polymerase III, epsilon subunit  YP_003184913  unclonable  0.0000000153009  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2258  CDS  NC_013205  2316679  2318454  -  1776  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003185656  unclonable  0.000000752385  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2491  CDS  NC_013205  2560807  2562588  -  1782  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003185886  unclonable  0.00000117082  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2736  CDS  NC_013205  2800781  2801872  -  1092  PilT protein domain protein  YP_003186129  unclonable  0.0000000848618  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2844  CDS  NC_013205  2903421  2904488  -  1068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  YP_003186237  unclonable  0.0000000416569  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2845  CDS  NC_013205  2904672  2905460  -  789  ABC transporter related  YP_003186238  unclonable  0.0000000305436  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2952  CDS  NC_013206  1132  1836  -  705  hypothetical protein  YP_003186344  unclonable  0.00000000000689868  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2953  CDS  NC_013206  1850  3037  -  1188  hypothetical protein  YP_003186345  unclonable  0.0000000000832584  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2954  CDS  NC_013206  3420  4091  +  672  transcriptional regulator, XRE family  YP_003186346  unclonable  0.00000000000401895  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2987  CDS  NC_013206  29171  30403  +  1233  phosphoribosylglycinamide synthetase  YP_003186379  unclonable  0.0000000000875543  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2988  CDS  NC_013206  30497  31678  +  1182  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003186380  unclonable  0.0000000000335031  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_R0027  rRNA  NC_013205  296003  297528  +  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  0.000000250907  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_R0034  tRNA  NC_013205  725661  725736  -  76  tRNA-Pro    unclonable  0.00000000221471  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_R0049  rRNA  NC_013205  1408837  1410362  +  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  0.000000250907  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>