23 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rmar_0305  CDS  NC_013501  332933  333886  -  954  PKD domain containing protein  YP_003289598  unclonable  0.0000000757155  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0404  CDS  NC_013501  447868  448830  +  963  integrase family protein  YP_003289696  unclonable  0.0000000863146  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0686  CDS  NC_013501  786311  787264  -  954  transcriptional regulator, DeoR family  YP_003289972  unclonable  0.0000000719741  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0687  CDS  NC_013501  787456  790656  +  3201  TonB-dependent receptor plug  YP_003289973  unclonable  0.0000368549  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0746  CDS  NC_013501  869751  870236  +  486  single-strand binding protein  YP_003290032  unclonable  0.00000000549741  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1069  CDS  NC_013501  1224112  1227105  +  2994  glycoside hydrolase family 10  YP_003290349  unclonable  0.0000326536  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1101  CDS  NC_013501  1272860  1274056  +  1197  translation elongation factor Tu  YP_003290380  unclonable  0.000000113146  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1386  CDS  NC_013501  1617063  1619963  -  2901  hypothetical protein  YP_003290663  unclonable  0.0000313408  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1387  CDS  NC_013501  1620163  1621890  -  1728  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003290664  unclonable  0.000000830538  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1388  CDS  NC_013501  1621975  1623648  -  1674  mercuric reductase  YP_003290665  unclonable  0.000000433137  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1484  CDS  NC_013501  1734105  1734989  -  885  hypothetical protein  YP_003290759  unclonable  0.0000000295365  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1485  CDS  NC_013501  1735158  1735619  -  462  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_003290760  unclonable  0.00000000836968  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1756  CDS  NC_013501  2046446  2047480  -  1035  hypothetical protein  YP_003291028  unclonable  0.000000066418  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1916  CDS  NC_013501  2236283  2236924  -  642  hypothetical protein  YP_003291187  unclonable  0.0000000151039  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2307  CDS  NC_013501  2671698  2672312  -  615  YceI family protein  YP_003291574  unclonable  0.0000000152609  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2308  CDS  NC_013501  2672465  2673793  +  1329  FolC bifunctional protein  YP_003291575  unclonable  0.000000091683  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2525  CDS  NC_013501  2935428  2936618  -  1191  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  YP_003291789  unclonable  0.0000000796245  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2842  CDS  NC_013502  46430  47140  -  711  hypothetical protein  YP_003292097  unclonable  0.0000023578  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2843  CDS  NC_013502  47137  47619  -  483  hypothetical protein  YP_003292098  unclonable  0.00000164273  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2844  CDS  NC_013502  47622  48221  -  600  protein of unknown function DUF1130  YP_003292099  unclonable  0.00000271396  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_R0023  tRNA  NC_013501  1272522  1272608  +  87  tRNA-Tyr    unclonable  0.00000000432297  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_R0024  tRNA  NC_013501  1272616  1272691  +  76  tRNA-Gly    unclonable  0.00000000390894  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_R0025  tRNA  NC_013501  1272701  1272775  +  75  tRNA-Thr    unclonable  0.00000000411074  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>