32 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dtur_0019  CDS  NC_011661  22262  23353  -  1092  hypothetical protein  YP_002351974  unclonable  0.000000000182586  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0043  CDS  NC_011661  43913  44830  -  918  Peptidase M23  YP_002351995  unclonable  0.0000000000681555  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0064  CDS  NC_011661  63415  64650  -  1236  competence/damage-inducible protein CinA  YP_002352016  unclonable  0.000000000939052  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0162  CDS  NC_011661  150544  152406  -  1863  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002352107  unclonable  0.0000000359667  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0243  CDS  NC_011661  244575  245645  -  1071  Endo-1,4-beta-xylanase  YP_002352183  unclonable  0.000000000283811  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0305  CDS  NC_011661  312073  313641  +  1569  ferredoxin-dependent glutamate synthase  YP_002352241  unclonable  0.0000000055557  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0450  CDS  NC_011661  457446  458153  +  708  polysaccharide deacetylase  YP_002352365  unclonable  0.0000000000380571  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0863  CDS  NC_011661  888119  890203  +  2085  S-layer domain protein  YP_002352758  unclonable  0.000000121904  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0932  CDS  NC_011661  962551  963681  +  1131  Extracellular ligand-binding receptor  YP_002352827  unclonable  0.000000000568006  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_0973  CDS  NC_011661  1002028  1002300  +  273  protein of unknown function UPF0016  YP_002352867  unclonable  0.00000000000116489  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1003  CDS  NC_011661  1025867  1026118  +  252  translation initiation factor IF-1  YP_002352897  unclonable  0.00000000000130105  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1004  CDS  NC_011661  1026108  1026221  +  114  50S ribosomal protein L36  YP_002352898  unclonable  0.000000000000566406  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1005  CDS  NC_011661  1026236  1026610  +  375  30S ribosomal protein S13  YP_002352899  unclonable  0.00000000000343576  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1065  CDS  NC_011661  1081941  1084046  -  2106  oligopeptide binding protein, putative  YP_002352959  unclonable  0.000000159871  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1101  CDS  NC_011661  1121141  1122268  +  1128  Peptidase M23  YP_002352994  unclonable  0.000000000152343  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1137  CDS  NC_011661  1155627  1156508  +  882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002353030  unclonable  0.0000000000296229  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1204  CDS  NC_011661  1222380  1222676  +  297  hypothetical protein  YP_002353097  unclonable  0.0000000000029262  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1205  CDS  NC_011661  1222827  1223297  +  471  protein of unknown function DUF150  YP_002353098  unclonable  0.00000000000854014  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1331  CDS  NC_011661  1349552  1350805  -  1254  MiaB-like tRNA modifying enzyme  YP_002353219  unclonable  0.000000000562047  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1377  CDS  NC_011661  1389102  1389251  -  150  ribosomal protein L33  YP_002353265  unclonable  0.000000000000360963  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1378  CDS  NC_011661  1389276  1390493  -  1218  elongation factor Tu  YP_002353266  unclonable  0.000000000857759  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1384  CDS  NC_011661  1397457  1400069  -  2613  TPR repeat-containing protein  YP_002353272  unclonable  0.00000149301  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1416  CDS  NC_011661  1429336  1430577  -  1242  phosphoribosylamine/glycine ligase  YP_002353304  unclonable  0.000000000507728  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1538  CDS  NC_011661  1547502  1548812  -  1311  signal recognition particle protein  YP_002353426  unclonable  0.0000000016303  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1642  CDS  NC_011661  1657827  1658780  +  954  Monosaccharide-transporting ATPase  YP_002353529  unclonable  0.0000000000622557  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1708  CDS  NC_011661  1726057  1727085  +  1029  transcriptional regulator, LacI family  YP_002353594  unclonable  0.0000000000920501  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1724  CDS  NC_011661  1745639  1747516  -  1878  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002353610  unclonable  0.0000000147125  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1732  CDS  NC_011661  1755212  1756459  -  1248  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002353618  unclonable  0.000000000368486  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1736  CDS  NC_011661  1760449  1761450  -  1002  transcriptional regulator, LacI family  YP_002353622  unclonable  0.00000000004003  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1737  CDS  NC_011661  1761585  1762340  -  756  hypothetical protein  YP_002353623  unclonable  0.0000000000179479  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1761  CDS  NC_011661  1797509  1797799  -  291  RNP-1 like RNA-binding protein  YP_002353647  unclonable  0.00000000000106406  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Dtur_1762  CDS  NC_011661  1797864  1799585  -  1722  hypothetical protein  YP_002353648  unclonable  0.0000000211231  n/a    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>