20 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mrub_0180  CDS  NC_013946  160030  160332  +  303  histone family protein DNA-binding protein  YP_003505980  unclonable  0.000000000456063  normal  0.670354  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0181  CDS  NC_013946  160572  161015  -  444  hypothetical protein  YP_003505981  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0905  CDS  NC_013946  891344  892231  -  888  response regulator receiver protein  YP_003506690  unclonable  0.00000000245258  normal  1  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1384  CDS  NC_013946  1420898  1421098  +  201  50S ribosomal protein L35  YP_003507166  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1385  CDS  NC_013946  1421115  1421462  +  348  50S ribosomal protein L20  YP_003507167  unclonable  0.00000000012054  normal  0.0978836  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1535  CDS  NC_013946  1571697  1571981  -  285  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  YP_003507317  unclonable  0.000000000224149  normal  0.214474  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1641  CDS  NC_013946  1672219  1673217  -  999  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_003507422  unclonable  0.00000000438606  normal  0.466828  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1779  CDS  NC_013946  1832329  1833432  -  1104  FAD dependent oxidoreductase  YP_003507559  unclonable  0.00000000510083  normal  1  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1804  CDS  NC_013946  1856205  1856879  +  675  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  YP_003507584  unclonable  0.000000000840168  normal  0.357592  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1932  CDS  NC_013946  1988669  1989847  +  1179  NusA antitermination factor  YP_003507709  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2015  CDS  NC_013946  2053963  2054949  -  987  extracellular solute-binding protein family 1  YP_003507791  unclonable  0.00000000268441  normal  1  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2249  CDS  NC_013946  2299782  2302229  -  2448  ATP-dependent protease La  YP_003508022  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2250  CDS  NC_013946  2302369  2303367  +  999  hypothetical protein  YP_003508023  unclonable  0.00000000129239  normal  0.0239779  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2278    NC_013946  2329236  2331110  -  1875      unclonable  0.0000000277608  unclonable  0.00000000000885534  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2524  CDS  NC_013946  2571044  2571784  +  741  single-strand binding protein  YP_003508295  unclonable  0.000000000823265  normal  0.0673427  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2649  CDS  NC_013946  2688501  2689661  +  1161  Extracellular ligand-binding receptor  YP_003508419  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2650  CDS  NC_013946  2689954  2690097  +  144  hypothetical protein  YP_003508420  unclonable  0.0000000000610287  normal  0.0124373  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2651  CDS  NC_013946  2690107  2691087  +  981  inner-membrane translocator  YP_003508421  unclonable  0.000000000892409  hitchhiker  0.00872106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2990  CDS  NC_013946  3025821  3028619  -  2799  S-layer domain-containing protein  YP_003508754  unclonable  0.00000140027  normal  1  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_R0006  tRNA  NC_013946  377362  377438  +  77  tRNA-Met    unclonable  0.0000000000568844  normal  1  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>