50 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Elen_0006  CDS  NC_013204  6356  8302  +  1947  DNA gyrase, B subunit  YP_003180390  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0207  CDS  NC_013204  287674  288189  -  516  Rhodanese domain protein  YP_003180590  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0345  CDS  NC_013204  447911  448111  -  201  prevent-host-death family protein  YP_003180725  unclonable  0.00000000320944  normal  1  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0614  CDS  NC_013204  782023  783141  +  1119  hypothetical protein  YP_003180988  unclonable  0.0000000406094  normal  1  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0615  CDS  NC_013204  783411  784799  -  1389  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003180989  unclonable  0.000000110739  normal  1  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0669  CDS  NC_013204  846258  846923  -  666  hypothetical protein  YP_003181040  unclonable  0.00000000996986  hitchhiker  0.0000110062  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0721  CDS  NC_013204  907935  909671  +  1737  protein of unknown function DUF344  YP_003181089  unclonable  0.00000055361  normal  1  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0722  CDS  NC_013204  909752  909868  +  117  hypothetical protein  YP_003181090  unclonable  0.00000000192544  normal  1  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0943  CDS  NC_013204  1147528  1149225  +  1698  hypothetical protein  YP_003181304  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1050  CDS  NC_013204  1267027  1270488  +  3462  DNA polymerase III, alpha subunit  YP_003181410  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1053  CDS  NC_013204  1272306  1274255  -  1950  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  YP_003181413  unclonable  0.00000122454  hitchhiker  0.00273706  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1097  CDS  NC_013204  1327668  1327946  +  279  hypothetical protein  YP_003181457  unclonable  0.00000000145384  hitchhiker  0.0000000000000135193  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1103  CDS  NC_013204  1334459  1335295  +  837  ribosomal protein S2  YP_003181463  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1104  CDS  NC_013204  1335407  1336267  +  861  translation elongation factor Ts  YP_003181464  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1105  CDS  NC_013204  1336616  1337905  +  1290  UDP-N-acetylglucosamine1- carboxyvinyltransferase  YP_003181465  hitchhiker  0.00159762  unclonable  0.00000000000000149564  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1115  CDS  NC_013204  1344454  1345926  +  1473  pyruvate kinase  YP_003181474  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1116  CDS  NC_013204  1345995  1346900  +  906  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  YP_003181475  unclonable  0.0000000171192  hitchhiker  0.000000000000494113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1117  CDS  NC_013204  1347009  1347470  +  462  ribosomal protein L31  YP_003181476  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1216  CDS  NC_013204  1457898  1458674  -  777  ABC transporter related  YP_003181575  unclonable  0.00000000901825  normal  0.0692557  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1232  CDS  NC_013204  1478852  1479265  -  414  protein of unknown function DUF454  YP_003181591  unclonable  0.00000000574666  normal  0.065274  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1245  CDS  NC_013204  1496413  1497387  -  975  glycosyl transferase family 2  YP_003181604  unclonable  0.0000000219954  normal  1  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1351  CDS  NC_013204  1618180  1618371  -  192  ribosomal protein L28  YP_003181709  unclonable  0.0000000031136  normal  0.416635  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1363  CDS  NC_013204  1628915  1630825  +  1911  ABC transporter related  YP_003181721  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1364  CDS  NC_013204  1630966  1631145  +  180  ribosomal protein L32  YP_003181722  unclonable  0.00000000136875  normal  0.339824  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1378  CDS  NC_013204  1646403  1646648  +  246  ribosomal protein S16  YP_003181736  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1379  CDS  NC_013204  1646654  1646908  +  255  KH domain protein  YP_003181737  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1380  CDS  NC_013204  1646909  1647430  +  522  PRC-barrel domain protein  YP_003181738  unclonable  0.00000000425186  normal  0.828358  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1611  CDS  NC_013204  1908816  1909454  +  639  SOS-response transcriptional repressor, LexA  YP_003181968  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1612  CDS  NC_013204  1909688  1910998  -  1311  GTP-binding proten HflX  YP_003181969  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1613  CDS  NC_013204  1911192  1912172  -  981  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  YP_003181970  hitchhiker  0.00176611  unclonable  4.27833e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1614  CDS  NC_013204  1912153  1913532  -  1380  RNA modification enzyme, MiaB family  YP_003181971  hitchhiker  0.00466996  unclonable  5.55218e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1624  CDS  NC_013204  1923324  1925852  -  2529  cell divisionFtsK/SpoIIIE  YP_003181981  unclonable  0.00000457082  hitchhiker  0.00000117661  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1893  CDS  NC_013204  2223654  2224871  +  1218  methionine-R-sulfoxide reductase  YP_003182246  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1894  CDS  NC_013204  2225010  2226353  -  1344  MATE efflux family protein  YP_003182247  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_1895  CDS  NC_013204  2226487  2227269  +  783  transcriptional regulator, MerR family  YP_003182248  hitchhiker  0.0000198345  unclonable  1.71834e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2012  CDS  NC_013204  2358651  2358902  -  252  ribosomal protein L27  YP_003182365  hitchhiker  0.0000000441981  unclonable  3.43128e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2013  CDS  NC_013204  2358921  2359337  -  417  ribosomal protein L21  YP_003182366  unclonable  0.00000000281642  unclonable  3.79334e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2014  CDS  NC_013204  2359599  2362226  -  2628  DNA polymerase I  YP_003182367  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2057  CDS  NC_013204  2421666  2423063  +  1398  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  YP_003182409  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2058  CDS  NC_013204  2423174  2423914  +  741  zinc finger CDGSH-type domain protein  YP_003182410  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2059  CDS  NC_013204  2424452  2425504  +  1053  beta-lactamase domain protein  YP_003182411  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2086  CDS  NC_013204  2452980  2454101  -  1122  cell division protein FtsZ  YP_003182438  unclonable  0.000000020916  unclonable  1.82517e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2114  CDS  NC_013204  2487987  2488562  -  576  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003182466  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2134  CDS  NC_013204  2509538  2510059  -  522  hypothetical protein  YP_003182486  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2805  CDS  NC_013204  3254586  3255212  -  627  ribosomal protein S4  YP_003183141  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2806  CDS  NC_013204  3255232  3255630  -  399  ribosomal protein S11  YP_003183142  unclonable  0.00000000365846  decreased coverage  0.00000000490593  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_2807  CDS  NC_013204  3255642  3256010  -  369  ribosomal protein S13  YP_003183143  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_3112  CDS  NC_013204  3619594  3622494  -  2901  DNA polymerase III, epsilon subunit  YP_003183443  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_R0040  tRNA  NC_013204  2424089  2424162  +  74  tRNA-Gln    unclonable  0.000000000983405  normal  0.398692  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_R0041  tRNA  NC_013204  2424194  2424270  +  77  tRNA-Glu    unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>