33 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Daud_0010  CDS  NC_010424  10949  11518  +  570  glutamine amidotransferase subunit PdxT  YP_001716211  unclonable  0.000000000532264  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0124  CDS  NC_010424  134594  135058  -  465  GreA/GreB family elongation factor  YP_001716324  unclonable  0.000000000349416  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0125  CDS  NC_010424  135205  136182  +  978  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  YP_001716325  unclonable  0.00000000298422  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0129  CDS  NC_010424  139194  140309  +  1116  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  YP_001716329  unclonable  0.00000000445979  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0130  CDS  NC_010424  140486  140977  +  492  transcription elongation factor GreA  YP_001716330  unclonable  0.000000000129551  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0131  CDS  NC_010424  141002  142474  +  1473  lysyl-tRNA synthetase  YP_001716331  unclonable  0.0000000275305  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0528  CDS  NC_010424  566044  566928  +  885  heat shock protein HtpX  YP_001716702  unclonable  0.0000000012228  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0635  CDS  NC_010424  672813  673994  -  1182  nucleoside recognition domain-containing protein  YP_001716801  unclonable  0.00000000395373  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0636  CDS  NC_010424  674139  674657  +  519  hypothetical protein  YP_001716802  unclonable  0.000000000112577  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0637  CDS  NC_010424  674658  674837  +  180  50S ribosomal protein L32  YP_001716803  unclonable  0.0000000000215733  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0638  CDS  NC_010424  674940  675947  +  1008  fatty acid/phospholipid synthesis protein PlsX  YP_001716804  unclonable  0.00000000304584  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0655  CDS  NC_010424  690777  692135  +  1359  signal recognition particle protein  YP_001716821  unclonable  0.0000000216081  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0702  CDS  NC_010424  736622  736927  +  306  hypothetical protein  YP_001716864  unclonable  0.0000000000842006  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0778  CDS  NC_010424  806444  809536  +  3093  hypothetical protein  YP_001716932  unclonable  0.0000807207  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0922  CDS  NC_010424  983717  984181  +  465  hypothetical protein  YP_001717067  unclonable  0.000000000356631  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1016  CDS  NC_010424  1067535  1068875  +  1341  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  YP_001717160  unclonable  0.0000000161184  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1059  CDS  NC_010424  1115606  1116199  -  594  superoxide dismutase  YP_001717203  unclonable  0.000000000300614  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1060  CDS  NC_010424  1116716  1116847  +  132  NifU domain-containing protein  YP_001717204  unclonable  0.0000000000236153  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1061  CDS  NC_010424  1117322  1118863  +  1542  phosphodiesterase  YP_001717205  unclonable  0.000000060823  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1154  CDS  NC_010424  1209155  1210891  -  1737  phosphotransferase domain-containing protein  YP_001717297  unclonable  0.000000251601  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1384  CDS  NC_010424  1465805  1467712  -  1908  threonyl-tRNA synthetase  YP_001717525  unclonable  0.000000717334  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1452  CDS  NC_010424  1534979  1535290  -  312  ribosomal protein L21  YP_001717590  unclonable  0.0000000000564167  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1473  CDS  NC_010424  1554215  1556860  -  2646  valyl-tRNA synthetase  YP_001717611  unclonable  0.000014278  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1480  CDS  NC_010424  1564967  1566283  -  1317  trigger factor  YP_001717618  unclonable  0.0000000182138  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1481  CDS  NC_010424  1566532  1567392  +  861  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001717619  unclonable  0.00000000220785  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1536  CDS  NC_010424  1620191  1620583  -  393  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  YP_001717671  unclonable  0.000000000169782  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1537  CDS  NC_010424  1620804  1621667  -  864  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001717672  unclonable  0.00000000218492  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1538  CDS  NC_010424  1621654  1622028  -  375  hypothetical protein  YP_001717673  unclonable  0.00000000021378  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2013  CDS  NC_010424  2119128  2119424  +  297  hypothetical protein  YP_001718136  unclonable  0.0000000000448055  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2030  CDS  NC_010424  2137247  2138584  -  1338  glutamate--ammonia ligase  YP_001718152  unclonable  0.0000000216081  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2031  CDS  NC_010424  2138729  2139325  -  597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  YP_001718153  unclonable  0.00000000027462  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2205  CDS  NC_010424  2318259  2319611  -  1353  peptidase M23B  YP_001718324  unclonable  0.0000000218447  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_R0024  tRNA  NC_010424  1116444  1116531  -  88  tRNA-Leu    unclonable  0.000000000016794  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>