184 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
GWCH70_0018  CDS  NC_012793  26534  27016  +  483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  YP_002948226  unclonable  0.00000000000222669  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0019  CDS  NC_012793  27453  29138  +  1686  DNA polymerase III subunits gamma and tau  YP_002948227  unclonable  0.00000000159056  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0020  CDS  NC_012793  29161  29487  +  327  hypothetical protein  YP_002948228  unclonable  0.00000000000261671  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0021  CDS  NC_012793  29499  30095  +  597  recombination protein RecR  YP_002948229  unclonable  0.0000000000073919  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0022  CDS  NC_012793  30113  30337  +  225  conserved hypothetical cytosolic protein  YP_002948230  unclonable  0.00000000000157824  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0023  CDS  NC_012793  30415  30681  +  267  pro-sigmaK processing inhibitor BofA  YP_002948231  unclonable  0.00000000000209525  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0058  CDS  NC_012793  68292  68690  +  399  hypothetical protein  YP_002948266  unclonable  0.00000000000238948  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0065  CDS  NC_012793  77888  78664  +  777  pantothenate kinase  YP_002948273  unclonable  0.0000000000107258  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0066  CDS  NC_012793  78679  79566  +  888  Hsp33-like chaperonin  YP_002948274  unclonable  0.0000000000194487  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0067  CDS  NC_012793  79644  80570  +  927  cysteine synthase A  YP_002948275  unclonable  0.0000000000200639  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0094  CDS  NC_012793  119822  120472  +  651  RNA polymerase factor sigma-70  YP_002948300  unclonable  0.0000000000196498  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0095  CDS  NC_012793  120562  120711  +  150  ribosomal protein L33  YP_002948301  unclonable  0.00000000000218198  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0096  CDS  NC_012793  120754  120936  +  183  preprotein translocase subunit SecE  YP_002948302  unclonable  0.00000000000178196  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0097  CDS  NC_012793  121065  121598  +  534  transcription antitermination protein NusG  YP_002948303  unclonable  0.00000000000931665  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0098  CDS  NC_012793  121846  122271  +  426  50S ribosomal protein L11  YP_002948304  unclonable  0.00000000000446948  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0099  CDS  NC_012793  122380  123081  +  702  50S ribosomal protein L1  YP_002948305  unclonable  0.0000000000132548  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0100  CDS  NC_012793  123327  123827  +  501  50S ribosomal protein L10  YP_002948306  unclonable  0.00000000000689021  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0104  CDS  NC_012793  128869  132468  +  3600  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  YP_002948310  unclonable  0.00000439156  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0105  CDS  NC_012793  132601  132849  +  249  putative ribosomal protein L7Ae-like  YP_002948311  unclonable  0.00000000000154657  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0106  CDS  NC_012793  132954  133376  +  423  30S ribosomal protein S12  YP_002948312  unclonable  0.00000000000499342  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0107  CDS  NC_012793  133414  133884  +  471  30S ribosomal protein S7  YP_002948313  unclonable  0.00000000000442376  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0108  CDS  NC_012793  134042  136120  +  2079  elongation factor G  YP_002948314  unclonable  0.00000000924117  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0109  CDS  NC_012793  136265  137452  +  1188  elongation factor Tu  YP_002948315  unclonable  0.000000000245051  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0110  CDS  NC_012793  137748  138056  +  309  30S ribosomal protein S10  YP_002948316  unclonable  0.00000000000437851  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0111  CDS  NC_012793  138077  138712  +  636  50S ribosomal protein L3  YP_002948317  unclonable  0.0000000000151121  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0112  CDS  NC_012793  138742  139365  +  624  50S ribosomal protein L4  YP_002948318  unclonable  0.0000000000123482  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0113  CDS  NC_012793  139365  139652  +  288  50S ribosomal protein L23  YP_002948319  unclonable  0.00000000000241418  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0114  CDS  NC_012793  139679  140509  +  831  50S ribosomal protein L2  YP_002948320  unclonable  0.0000000000290971  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0134  CDS  NC_012793  149761  149979  +  219  translation initiation factor IF-1  YP_002948340  unclonable  0.00000000000106677  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0135  CDS  NC_012793  150012  150125  +  114  50S ribosomal protein L36  YP_002948341  unclonable  0.000000000000544663  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0136  CDS  NC_012793  150146  150511  +  366  30S ribosomal protein S13  YP_002948342  unclonable  0.00000000000207382  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0137  CDS  NC_012793  150537  150926  +  390  30S ribosomal protein S11  YP_002948343  unclonable  0.00000000000197157  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0138  CDS  NC_012793  151101  152045  +  945  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  YP_002948344  unclonable  0.0000000000398199  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0139  CDS  NC_012793  152183  152545  +  363  50S ribosomal protein L17  YP_002948345  unclonable  0.00000000000316871  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0140  CDS  NC_012793  152664  153506  +  843  cobalt transporter ATP-binding subunit  YP_002948346  unclonable  0.0000000000287993  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0141  CDS  NC_012793  153482  154357  +  876  cobalt transporter ATP-binding subunit  YP_002948347  unclonable  0.0000000000352159  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0142  CDS  NC_012793  154347  155144  +  798  cobalt transport protein  YP_002948348  unclonable  0.0000000000226284  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0143  CDS  NC_012793  155158  155904  +  747  tRNA pseudouridine synthase A  YP_002948349  unclonable  0.0000000000160558  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0144  CDS  NC_012793  156050  156487  +  438  50S ribosomal protein L13  YP_002948350  unclonable  0.00000000000514694  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0229  CDS  NC_012793  253353  254087  -  735  Abortive infection protein  YP_002948426  unclonable  0.0000000000154218  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0285  CDS  NC_012793  323528  324109  -  582  hypothetical protein  YP_002948478  unclonable  0.00000000000769793  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0286  CDS  NC_012793  324303  324593  +  291  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  YP_002948479  unclonable  0.00000000000201197  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0314  CDS  NC_012793  362930  364243  +  1314  CRISPR-associated protein, TM1812 family  YP_002948507  unclonable  0.000000000212664  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0352  CDS  NC_012793  400643  401923  +  1281  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_002948543  unclonable  0.000000000129716  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0468  CDS  NC_012793  520936  522036  +  1101  A/G-specific adenine glycosylase  YP_002948645  unclonable  0.0000000000736881  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0476  CDS  NC_012793  528318  529691  -  1374  transposase IS4 family protein  YP_002948653  unclonable  0.000000000219205  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0477  CDS  NC_012793  529914  530939  +  1026  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002948654  unclonable  0.0000000000893655  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0508  CDS  NC_012793  577639  579012  -  1374  transposase IS4 family protein  YP_002948684  unclonable  0.00000000016026  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0539  CDS  NC_012793  608836  610272  -  1437  transposase  YP_002948709  unclonable  0.000000000512999  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0602  CDS  NC_012793  668987  669517  +  531  metal-dependent hydrolase  YP_002948765  unclonable  0.00000000000384041  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0603  CDS  NC_012793  669655  670830  +  1176  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002948766  unclonable  0.0000000000645746  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0604  CDS  NC_012793  670893  672077  -  1185  protein of unknown function Met10  YP_002948767  unclonable  0.0000000000482493  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0629  CDS  NC_012793  692233  692586  +  354  hypothetical protein  YP_002948788  unclonable  0.00000000000167631  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0632  CDS  NC_012793  695429  696511  -  1083  transposase, IS605 OrfB family  YP_002948791  unclonable  0.0000000000767619  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0633  CDS  NC_012793  696832  697017  -  186  hypothetical protein  YP_002948792  unclonable  0.00000000000112178  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0634  CDS  NC_012793  697160  698059  +  900  ABC transporter related  YP_002948793  unclonable  0.00000000003558  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0635  CDS  NC_012793  698052  699290  +  1239  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  YP_002948794  unclonable  0.000000000153887  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0636  CDS  NC_012793  699380  700354  +  975  3'-5' exoribonuclease YhaM  YP_002948795  unclonable  0.000000000053339  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0637  CDS  NC_012793  700548  700733  +  186  hypothetical protein  YP_002948796  unclonable  0.00000000000122845  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0638  CDS  NC_012793  700842  701924  +  1083  phosphoserine aminotransferase  YP_002948797  unclonable  0.0000000000707375  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0654  CDS  NC_012793  717471  717608  -  138  hypothetical protein  YP_002948813  unclonable  0.000000000000983935  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0655  CDS  NC_012793  717758  718492  +  735  beta-lactamase domain protein  YP_002948814  unclonable  0.0000000000122219  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0694  CDS  NC_012793  762660  764096  -  1437  transposase  YP_002948853  unclonable  0.000000000208331  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0711  CDS  NC_012793  788078  788569  -  492  putative nucleotide-binding protein  YP_002948866  unclonable  0.00000000000320146  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0728  CDS  NC_012793  803700  804980  +  1281  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_002948880  unclonable  0.000000000210486  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0729  CDS  NC_012793  805378  806400  +  1023  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  YP_002948881  unclonable  0.000000000041068  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0730  CDS  NC_012793  806451  807161  -  711  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  YP_002948882  unclonable  0.0000000000123482  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0848  CDS  NC_012793  912744  913559  -  816  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_002948994  unclonable  0.0000000000196498  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0849  CDS  NC_012793  913660  914832  +  1173  transaminase  YP_002948995  unclonable  0.00000000011377  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0866    NC_012793  932066  932446  +  381      unclonable  0.00000000000278087  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0867    NC_012793  932455  932892  +  438      unclonable  0.0000000000039191  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0961  CDS  NC_012793  1017656  1017958  +  303  hypothetical protein  YP_002949089  unclonable  0.00000000000104536  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0962  CDS  NC_012793  1018094  1018219  +  126  uncharacterized conserved protein, contains two CXXC motifs  YP_002949090  unclonable  0.000000000000487521  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0963  CDS  NC_012793  1018368  1019840  -  1473  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  YP_002949091  unclonable  0.000000000204147  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1027  CDS  NC_012793  1077812  1079086  +  1275  cell division protein FtsA  YP_002949153  unclonable  0.000000000184559  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1028  CDS  NC_012793  1079112  1080245  +  1134  cell division protein FtsZ  YP_002949154  unclonable  0.0000000000823516  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1029  CDS  NC_012793  1080644  1081570  +  927  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  YP_002949155  unclonable  0.0000000000260513  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1030  CDS  NC_012793  1081622  1082341  +  720  sporulation sigma factor SigE  YP_002949156  unclonable  0.0000000000129886  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1031  CDS  NC_012793  1082461  1083240  +  780  sporulation sigma factor SigG  YP_002949157  unclonable  0.0000000000174079  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1041  CDS  NC_012793  1091023  1091937  +  915  pseudouridine synthase, RluA family  YP_002949167  unclonable  0.0000000000866742  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1056  CDS  NC_012793  1110798  1111673  +  876  hypothetical protein  YP_002949182  unclonable  0.0000000000165495  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1087  CDS  NC_012793  1141530  1142870  +  1341  signal recognition particle protein  YP_002949213  unclonable  0.000000000240128  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1088  CDS  NC_012793  1142965  1143237  +  273  30S ribosomal protein S16  YP_002949214  unclonable  0.000000000001932  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1089  CDS  NC_012793  1143237  1143488  +  252  nucleic acid binding protein  YP_002949215  unclonable  0.00000000000185572  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1090  CDS  NC_012793  1143541  1143927  +  387  hypothetical protein  YP_002949216  unclonable  0.00000000000354215  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1091  CDS  NC_012793  1143942  1144460  +  519  16S rRNA-processing protein RimM  YP_002949217  unclonable  0.00000000000655231  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1092  CDS  NC_012793  1144457  1145194  +  738  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_002949218  unclonable  0.0000000000136624  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1093  CDS  NC_012793  1145329  1145679  +  351  ribosomal protein L19  YP_002949219  unclonable  0.00000000000484447  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1141  CDS  NC_012793  1187414  1188121  +  708  30S ribosomal protein S2  YP_002949267  unclonable  0.0000000000168885  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1174  CDS  NC_012793  1222957  1225257  +  2301  cell divisionFtsK/SpoIIIE  YP_002949300  unclonable  0.0000000151723  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1192  CDS  NC_012793  1244716  1245510  +  795  metallophosphoesterase  YP_002949318  unclonable  0.0000000000374794  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1235  CDS  NC_012793  1288838  1290172  +  1335  glutamine synthetase, type I  YP_002949354  unclonable  0.00000000016519  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1236  CDS  NC_012793  1290226  1290849  -  624  LexA repressor  YP_002949355  unclonable  0.00000000000635507  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1237  CDS  NC_012793  1291002  1291307  +  306  cell division suppressor protein YneA  YP_002949356  unclonable  0.00000000000253866  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1238  CDS  NC_012793  1291326  1291979  +  654  Resolvase domain protein  YP_002949357  unclonable  0.0000000000100955  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1239  CDS  NC_012793  1292186  1292416  +  231  protein of unknown function DUF896  YP_002949358  unclonable  0.00000000000174569  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1240  CDS  NC_012793  1292587  1293834  +  1248  transposase, IS605 OrfB family  YP_002949359  unclonable  0.000000000274025  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1241  CDS  NC_012793  1293983  1295989  +  2007  transketolase  YP_002949360  unclonable  0.00000000546415  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1242  CDS  NC_012793  1296146  1296583  +  438  hypothetical protein  YP_002949361  unclonable  0.00000000000326705  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1243  CDS  NC_012793  1296671  1296883  +  213  protein of unknown function UPF0154  YP_002949362  unclonable  0.00000000000114476  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>