35 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ccur_00310  CDS  NC_013170  44311  44553  +  243  SSU ribosomal protein S16P  YP_003150446  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_01690  CDS  NC_013170  204214  205185  +  972  hypothetical protein  YP_003150582  unclonable  0.0000000277676  decreased coverage  0.0000000000000177257  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_01700  CDS  NC_013170  205731  207692  +  1962  Glucan-binding protein C  YP_003150583  unclonable  0.000000661624  hitchhiker  0.000000000000881459  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_01710  CDS  NC_013170  208158  208604  +  447  LSU ribosomal protein L13P  YP_003150584  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_01720  CDS  NC_013170  208608  209000  +  393  SSU ribosomal protein S9P  YP_003150585  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_02900  CDS  NC_013170  336729  337094  -  366  hypothetical protein  YP_003150699  unclonable  0.0000000307097  hitchhiker  5.1051199999999997e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_02910  CDS  NC_013170  337091  337447  -  357  hypothetical protein  YP_003150700  unclonable  0.0000000263758  hitchhiker  2.35026e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_02920  CDS  NC_013170  337444  338010  -  567  hypothetical protein  YP_003150701  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_02930  CDS  NC_013170  337985  338665  -  681  hypothetical protein  YP_003150702  unclonable  0.0000000699255  hitchhiker  4.4397000000000005e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_02940  CDS  NC_013170  338658  338885  -  228  hypothetical protein  YP_003150703  unclonable  0.0000000164383  hitchhiker  9.32115e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_02950  CDS  NC_013170  338895  339392  -  498  single stranded DNA-binding protein  YP_003150704  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_02960  CDS  NC_013170  339395  340069  -  675  phage recombination protein Bet  YP_003150705  unclonable  0.0000000371623  hitchhiker  1.14884e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_02970  CDS  NC_013170  340054  340323  -  270  hypothetical protein  YP_003150706  unclonable  0.00000000995625  hitchhiker  3.85375e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_02980  CDS  NC_013170  340324  341277  -  954  Protein of unknown function (DUF1351)  YP_003150707  unclonable  0.0000000544192  unclonable  5.1000699999999995e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_02990  CDS  NC_013170  341289  341576  -  288  hypothetical protein  YP_003150708  unclonable  0.00000000936321  hitchhiker  3.19503e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_03000  CDS  NC_013170  341853  342059  -  207  hypothetical protein  YP_003150709  unclonable  0.00000000533329  hitchhiker  9.98617e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_03010  CDS  NC_013170  342068  342436  -  369  hypothetical protein  YP_003150710  unclonable  0.00000000829272  hitchhiker  1.4330799999999998e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_03020  CDS  NC_013170  342448  342669  -  222  hypothetical protein  YP_003150711  unclonable  0.00000000589836  hitchhiker  6.6727599999999995e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_03030  CDS  NC_013170  342882  343568  +  687  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  YP_003150712  unclonable  0.0000000274718  hitchhiker  1.62281e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_03040  CDS  NC_013170  343586  344125  +  540  hypothetical protein  YP_003150713  unclonable  0.00000001782  hitchhiker  1.54923e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_03640  CDS  NC_013170  422233  423798  +  1566  Ykud domain-containing protein  YP_003150771  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_03650  CDS  NC_013170  423929  425719  +  1791  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  YP_003150772  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_03810  CDS  NC_013170  439845  443381  +  3537  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  YP_003150787  unclonable  0.000134486  normal  0.250195  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_05960  CDS  NC_013170  701609  701914  +  306  LSU ribosomal protein L21P  YP_003150995  unclonable  0.00000000829272  hitchhiker  0.000000000000252573  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_06230  CDS  NC_013170  729520  730719  +  1200  ribonuclease D  YP_003151021  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_06680  CDS  NC_013170  778490  780067  +  1578  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  YP_003151060  unclonable  0.000000372543  normal  0.255135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_06770  CDS  NC_013170  789103  791109  +  2007  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  YP_003151069  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_07410  CDS  NC_013170  853471  854109  +  639  SOS-response transcriptional repressor, LexA  YP_003151129  unclonable  0.0000000224442  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_07420  CDS  NC_013170  854355  855329  -  975  tRNA isopentenyltransferase MiaA  YP_003151130  unclonable  0.0000000782237  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_09460  CDS  NC_013170  1086106  1087224  -  1119  cell division protein FtsZ  YP_003151324  unclonable  0.000000159563  normal  0.0377238  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_12240  CDS  NC_013170  1389653  1390843  -  1191  transcriptional regulator  YP_003151591  unclonable  0.000000172976  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_12250  CDS  NC_013170  1391135  1392412  -  1278  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  YP_003151592  unclonable  0.000000220687  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_12260  CDS  NC_013170  1392665  1393531  -  867  translation elongation factor Ts  YP_003151593  unclonable  0.0000000728312  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_12270  CDS  NC_013170  1393610  1394494  -  885  SSU ribosomal protein S2P  YP_003151594  unclonable  0.0000000736157  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_13770  CDS  NC_013170  1565293  1569501  -  4209  putative collagen-binding protein  YP_003151734  unclonable  0.000835075  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>