33 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ndas_0001  CDS  NC_014210  308  2266  +  1959  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003677960  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_0593  CDS  NC_014210  734704  736044  +  1341  cell division protein FtsK/SpoIIIE  YP_003678546  unclonable  0.000000762932  normal  1  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1959  CDS  NC_014210  2383054  2385186  +  2133  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003679892  unclonable  0.00000363453  hitchhiker  0.00000721686  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1960  CDS  NC_014210  2385427  2386074  -  648  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_003679893  unclonable  0.0000000329107  hitchhiker  0.00000396613  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1961  CDS  NC_014210  2386026  2387360  -  1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_003679894  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1962  CDS  NC_014210  2387536  2388474  -  939  hypothetical protein  YP_003679895  unclonable  0.0000000990446  hitchhiker  0.000000470282  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1963  CDS  NC_014210  2388640  2389083  +  444  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  YP_003679896  unclonable  0.0000000201512  hitchhiker  0.000000483904  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1964  CDS  NC_014210  2389104  2389763  +  660  peptide deformylase  YP_003679897  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1965  CDS  NC_014210  2389972  2390454  +  483  ribonuclease H  YP_003679898  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1966  CDS  NC_014210  2390508  2390975  -  468  transcriptional regulator, MerR family  YP_003679899  unclonable  0.0000000297683  unclonable  0.0000000258793  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1967  CDS  NC_014210  2390980  2391690  -  711  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter  YP_003679900  unclonable  0.0000000802413  unclonable  0.0000000310051  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1968  CDS  NC_014210  2391946  2392932  +  987  protein of unknown function UCP012608  YP_003679901  unclonable  0.000000182349  unclonable  0.0000000414728  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1969  CDS  NC_014210  2393052  2394041  -  990  adenosine deaminase  YP_003679902  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1970  CDS  NC_014210  2394192  2394542  -  351  Protein of unknown function DUF2078, membrane  YP_003679903  unclonable  0.0000000390161  unclonable  0.0000000269402  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1971  CDS  NC_014210  2394666  2395847  +  1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_003679904  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1972  CDS  NC_014210  2395844  2396497  +  654  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_003679905  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1973  CDS  NC_014210  2396558  2397724  +  1167  aminotransferase class V  YP_003679906  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1974  CDS  NC_014210  2397865  2398716  +  852  transcriptional regulator, MerR family  YP_003679907  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1975  CDS  NC_014210  2398713  2399606  +  894  transglutaminase domain protein  YP_003679908  hitchhiker  0.00000288031  unclonable  0.0000000394362  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1976  CDS  NC_014210  2399642  2399881  -  240  hypothetical protein  YP_003679909  hitchhiker  0.00000465381  unclonable  0.0000000269402  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_1977  CDS  NC_014210  2400179  2401360  -  1182  monooxygenase FAD-binding protein  YP_003679910  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_2181  CDS  NC_014210  2605453  2606172  +  720  rare lipoprotein A  YP_003680109  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_2182  CDS  NC_014210  2606406  2610002  +  3597  RecB family nuclease, putative  YP_003680110  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_2189  CDS  NC_014210  2616442  2617932  +  1491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_003680117  unclonable  0.000000683339  hitchhiker  0.000292513  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_2190  CDS  NC_014210  2617929  2618585  +  657  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_003680118  unclonable  0.0000000643495  hitchhiker  0.000215707  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_2191  CDS  NC_014210  2618691  2619401  +  711  hypothetical protein  YP_003680119  unclonable  0.0000000770677  hitchhiker  0.000224461  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_2192  CDS  NC_014210  2619457  2620203  -  747  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_003680120  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_2193  CDS  NC_014210  2620216  2621019  -  804  exodeoxyribonuclease III Xth  YP_003680121  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.000239022  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_2216  CDS  NC_014210  2646157  2648019  -  1863  serine/threonine protein kinase  YP_003680144  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_2217  CDS  NC_014210  2648485  2649738  +  1254  cytochrome P450  YP_003680145  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_2218  CDS  NC_014210  2649757  2650878  +  1122  Endo-1,4-beta-xylanase  YP_003680146  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_2219  CDS  NC_014210  2651020  2651943  +  924  6-kinase  YP_003680147  unclonable  0.000000195606  decreased coverage  0.000000830578  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Ndas_R0070  rRNA  NC_014211  392741  395832  +  3092  23S ribosomal RNA    normal  1  unclonable  0.0000000303857  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>