24 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Amir_0839  CDS  NC_013093  923501  923893  +  393  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  YP_003098646  unclonable  0.00000000121321  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0840  CDS  NC_013093  923932  925077  +  1146  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  YP_003098647  unclonable  0.0000000157223  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0841  CDS  NC_013093  925074  925832  +  759  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  YP_003098648  unclonable  0.00000000619723  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0842  CDS  NC_013093  925944  926273  -  330  hypothetical protein  YP_003098649  unclonable  0.00000000157366  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_2245  CDS  NC_013093  2482116  2484986  -  2871  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003100031  unclonable  0.00000425814  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_2298  CDS  NC_013093  2555558  2556727  +  1170  ROK family protein  YP_003100084  unclonable  0.0000000166992  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_2380  CDS  NC_013093  2640465  2642477  +  2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_003100166  unclonable  0.000000186709  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_2413  CDS  NC_013093  2670845  2671405  +  561  hypothetical protein  YP_003100199  unclonable  0.00000000208245  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_2510  CDS  NC_013093  2816234  2821168  +  4935  hypothetical protein  YP_003100294  unclonable  0.00514736  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3453  CDS  NC_013093  4016788  4018710  +  1923  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  YP_003101196  unclonable  0.000000252279  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3864  CDS  NC_013093  4529109  4530809  +  1701  protein of unknown function DUF181  YP_003101589  unclonable  0.000000134117  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3865  CDS  NC_013093  4530818  4531948  +  1131  hypothetical protein  YP_003101590  unclonable  0.0000000212347  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3866  CDS  NC_013093  4531948  4533504  +  1557  hypothetical protein  YP_003101591  unclonable  0.0000000713597  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3867  CDS  NC_013093  4533480  4534139  -  660  putative transcriptional regulator, TetR family  YP_003101592  unclonable  0.00000000371985  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3868  CDS  NC_013093  4534228  4535076  +  849  putative esterase  YP_003101593  unclonable  0.00000000571996  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3869  CDS  NC_013093  4535465  4536478  -  1014  hypothetical protein  YP_003101594  unclonable  0.00000000820088  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_4166  CDS  NC_013093  4900890  4901810  +  921  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_003101867  unclonable  0.0000000109629  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_4167  CDS  NC_013093  4902799  4903947  -  1149  hypothetical protein  YP_003101868  unclonable  0.0000000267335  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_4911  CDS  NC_013093  5849711  5854111  -  4401  Beta-ketoacyl synthase  YP_003102583  unclonable  0.000703058  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_4950  CDS  NC_013093  5903864  5904598  -  735  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  YP_003102622  unclonable  0.0000000101187  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_5500  CDS  NC_013093  6530198  6531400  -  1203  helix-turn-helix domain protein  YP_003103164  unclonable  0.0000000165306  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_5501  CDS  NC_013093  6532862  6533632  +  771  protein of unknown function DUF540  YP_003103165  unclonable  0.00000000395042  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_5780  CDS  NC_013093  6817206  6818273  -  1068  hypothetical protein  YP_003103439  unclonable  0.0000000190201  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_5781  CDS  NC_013093  6818311  6819327  -  1017  hypothetical protein  YP_003103440  unclonable  0.0000000116441  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>