50 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
SYO3AOP1_0046  CDS  NC_010730  55106  56395  -  1290  ammonium transporter  YP_001930249  unclonable  0.0000000000000652471  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0084  CDS  NC_010730  93056  94294  -  1239  oxidoreductase molybdopterin binding  YP_001930286  unclonable  0.000000000000111038  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0094  CDS  NC_010730  106981  107295  -  315  ribosomal protein S20  YP_001930295  unclonable  8.25858e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0095  CDS  NC_010730  107412  108614  +  1203  S-adenosylmethionine synthetase  YP_001930296  unclonable  0.0000000000000589385  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0229  CDS  NC_010730  246479  247084  -  606  hypothetical protein  YP_001930428  unclonable  8.00565e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0230  CDS  NC_010730  247085  247648  -  564  acetolactate synthase, small subunit  YP_001930429  unclonable  8.09057e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0344  CDS  NC_010730  352765  353127  +  363  hypothetical protein  YP_001930543  unclonable  6.67584e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0358  CDS  NC_010730  373491  375542  +  2052  DNA topoisomerase I  YP_001930557  unclonable  0.00000000000301729  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0367  CDS  NC_010730  384433  384639  -  207  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_001930565  unclonable  2.12569e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0368  CDS  NC_010730  384661  384867  -  207  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_001930566  unclonable  2.16983e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0369  CDS  NC_010730  385160  386125  +  966  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  YP_001930567  unclonable  0.00000000000001817  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0409  CDS  NC_010730  425587  426540  +  954  Polyprenyl synthetase  YP_001930606  unclonable  0.0000000000000164225  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0422  CDS  NC_010730  437165  438412  +  1248  cell division protein FtsA  YP_001930619  unclonable  0.000000000000203242  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0423  CDS  NC_010730  438433  439578  +  1146  cell division protein FtsZ  YP_001930620  unclonable  0.000000000000106624  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0429  CDS  NC_010730  442971  443771  +  801  cytochrome c assembly protein  YP_001930626  unclonable  0.000000000000010559  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0430  CDS  NC_010730  443768  444136  -  369  hypothetical protein  YP_001930627  unclonable  6.67584e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0431  CDS  NC_010730  444180  444503  -  324  cytochrome c class I  YP_001930628  unclonable  5.40538e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0445  CDS  NC_010730  459556  460023  +  468  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  YP_001930642  unclonable  4.29239e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0511  CDS  NC_010730  524223  524867  -  645  protein of unknown function DUF302  YP_001930705  unclonable  0.00000000000000589231  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0577  CDS  NC_010730  591662  592546  -  885  30S ribosomal protein S2  YP_001930769  unclonable  0.00000000000000845501  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0618  CDS  NC_010730  634265  636052  -  1788  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  YP_001930809  unclonable  0.00000000000111345  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0619  CDS  NC_010730  636256  637137  -  882  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  YP_001930810  unclonable  0.00000000000000506874  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0642  CDS  NC_010730  662705  663577  -  873  Polyferredoxin-like protein  YP_001930832  unclonable  0.00000000000000712923  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0747  CDS  NC_010730  776524  777831  +  1308  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  YP_001930934  unclonable  0.000000000000126668  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0763  CDS  NC_010730  796595  796885  +  291  50S ribosomal protein L21  YP_001930950  unclonable  9.31666e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0777  CDS  NC_010730  812438  813496  +  1059  Cytochrome-c peroxidase  YP_001930964  unclonable  0.0000000000000325432  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0813  CDS  NC_010730  853135  853842  -  708  hypothetical protein  YP_001931000  unclonable  0.0000000000000048673  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0828  CDS  NC_010730  867149  867871  +  723  NLP/P60 protein  YP_001931015  unclonable  0.00000000000000898283  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0867  CDS  NC_010730  902047  902325  +  279  histone family protein DNA-binding protein  YP_001931049  unclonable  2.6253e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0884  CDS  NC_010730  917944  918315  -  372  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 3  YP_001931066  unclonable  3.33925e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_0931  CDS  NC_010730  966832  967359  -  528  inorganic pyrophosphatase  YP_001931112  unclonable  0.00000000000000175221  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1011  CDS  NC_010730  1047943  1048353  -  411  hypothetical protein  YP_001931184  unclonable  6.60577e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1012  CDS  NC_010730  1048433  1048897  -  465  fimbrial protein  YP_001931185  unclonable  7.8428e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1137  CDS  NC_010730  1187102  1188016  +  915  Lytic transglycosylase catalytic  YP_001931305  unclonable  0.0000000000000172741  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1171  CDS  NC_010730  1219131  1220048  +  918  Rhodanese domain protein  YP_001931337  unclonable  0.00000000000000963951  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1383  CDS  NC_010730  1421782  1424826  -  3045  acriflavin resistance protein  YP_001931544  unclonable  0.00000000121579  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1384  CDS  NC_010730  1425227  1426213  +  987  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001931545  unclonable  0.0000000000000149924  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1429  CDS  NC_010730  1469589  1471595  +  2007  PDZ/DHR/GLGF domain protein  YP_001931585  unclonable  0.00000000000479067  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1453  CDS  NC_010730  1498067  1498573  +  507  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  YP_001931609  unclonable  0.00000000000000111602  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1486  CDS  NC_010730  1533629  1535002  -  1374  Phosphoglucomutase  YP_001931642  unclonable  0.000000000000122855  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1546  CDS  NC_010730  1589489  1589767  +  279  histone family protein DNA-binding protein  YP_001931698  unclonable  4.0402e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1606  CDS  NC_010730  1661638  1663728  +  2091  TonB-dependent receptor  YP_001931758  unclonable  0.00000000000872297  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1713  CDS  NC_010730  1773045  1774283  -  1239  hypothetical protein  YP_001931865  unclonable  0.0000000000000607675  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1729  CDS  NC_010730  1789602  1790054  +  453  50S ribosomal protein L13  YP_001931880  unclonable  0.0000000000000044906  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1730  CDS  NC_010730  1790069  1790497  +  429  30S ribosomal protein S9  YP_001931881  unclonable  0.00000000000000261544  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_1731  CDS  NC_010730  1790506  1791528  +  1023  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  YP_001931882  unclonable  0.0000000000000418565  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_R0035  tRNA  NC_010730  966534  966610  -  77  tRNA-Met    unclonable  1.84698e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_R0036  tRNA  NC_010730  966617  966690  -  74  tRNA-Arg    unclonable  1.49468e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_R0037  tRNA  NC_010730  966715  966790  -  76  tRNA-Pro    unclonable  1.47899e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
SYO3AOP1_R0038  tRNA  NC_010730  967399  967471  -  73  tRNA-Asn    unclonable  1.63633e-16  n/a    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>