53 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CBUD_0210  CDS  NC_009727  194260  195126  -  867  RNA polymerase factor sigma-32  YP_001423635  unclonable  0.000000219279  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0423  CDS  NC_009727  405184  407016  -  1833  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001423843  unclonable  0.00000968757  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0509  CDS  NC_009727  486459  486917  +  459  hypothetical protein  YP_001423923  unclonable  0.0000000393887  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0515  CDS  NC_009727  493659  494717  -  1059  rod shape-determining protein MreB  YP_001423929  unclonable  0.000000344491  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0571  CDS  NC_009727  552827  552940  -  114  hypothetical protein  YP_001423980  unclonable  0.00000000631982  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0572  CDS  NC_009727  552925  553377  +  453  17 kDa common-antigen  YP_001423981  unclonable  0.0000000192664  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0623  CDS  NC_009727  605533  607944  +  2412  outer membrane protein assembly factor  YP_001424030  unclonable  0.0000661464  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0624  CDS  NC_009727  608022  608519  +  498  outer membrane protein  YP_001424031  unclonable  0.0000000291301  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0625  CDS  NC_009727  608529  609557  +  1029  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  YP_001424032  unclonable  0.000000421673  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0646  CDS  NC_009727  632015  633505  +  1491  hypothetical membrane spanning protein  YP_001424052  unclonable  0.00000305005  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0991  CDS  NC_009727  974401  975630  +  1230  aspartokinase  YP_001424371  unclonable  0.000000471315  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1182  CDS  NC_009727  1154327  1154809  -  483  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001424546  unclonable  0.0000000309577  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1183  CDS  NC_009727  1154882  1155220  -  339  hypothetical protein  YP_001424547  unclonable  0.0000000224129  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1185  CDS  NC_009727  1155402  1156415  -  1014  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  YP_001424549  unclonable  0.000000351603  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1256  CDS  NC_009727  1236674  1238041  +  1368  sterol delta-7-reductase  YP_001424615  unclonable  0.00000127228  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1273  CDS  NC_009727  1256582  1257724  -  1143  cysteine desulfhydrase  YP_001424628  unclonable  0.000000190468  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1274  CDS  NC_009727  1257953  1258291  +  339  glycine-rich RNA-binding protein  YP_001424629  unclonable  0.00000000837257  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1275  CDS  NC_009727  1258362  1259090  -  729  acyltransferase family protein  YP_001424630  unclonable  0.0000000338877  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1309  CDS  NC_009727  1300061  1301380  +  1320  RmuC family protein  YP_001424662  unclonable  0.00000109458  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1310  CDS  NC_009727  1301794  1302702  -  909  haloalkane dehalogenase  YP_001424663  unclonable  0.00000017212  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1313  CDS  NC_009727  1308462  1309898  +  1437  sensor protein  YP_001424666  unclonable  0.00000254318  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1343  CDS  NC_009727  1339526  1341124  +  1599  Na+/H+ antiporter  YP_001424696  unclonable  0.00000220901  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1344  CDS  NC_009727  1341577  1342323  +  747  OmpA-like transmembrane domain protein  YP_001424697  unclonable  0.0000000532147  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1388  CDS  NC_009727  1386869  1387216  -  348  hypothetical protein  YP_001424740  unclonable  0.0000000192664  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1414  CDS  NC_009727  1404945  1405454  -  510  translation initiation factor IF-3  YP_001424762  unclonable  0.000000028541  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1415  CDS  NC_009727  1405537  1407519  -  1983  threonyl-tRNA synthetase  YP_001424763  unclonable  0.00000939714  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1511  CDS  NC_009727  1506886  1507236  +  351  iojap protein family  YP_001424855  unclonable  0.0000000252813  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1536  CDS  NC_009727  1535969  1536682  -  714  cytidylate kinase  YP_001424880  unclonable  0.0000000588366  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1618  CDS  NC_009727  1621094  1621498  +  405  histone H1 homolog  YP_001424956  unclonable  0.0000000181367  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1631  CDS  NC_009727  1630386  1631126  +  741  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001424969  unclonable  0.000000108471  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1632  CDS  NC_009727  1631123  1631470  +  348  50S ribosomal protein L19  YP_001424970  unclonable  0.0000000160789  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1683  CDS  NC_009727  1675570  1675917  -  348  50S ribosomal protein L21  YP_001425019  unclonable  0.0000000196723  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1742  CDS  NC_009727  1740331  1740642  +  312  DNA-binding protein fis  YP_001425075  unclonable  0.00000000872165  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1769  CDS  NC_009727  1766982  1767701  -  720  outer membrane porin P1  YP_001425101  unclonable  0.0000000980639  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1770  CDS  NC_009727  1767676  1767792  +  117  hypothetical protein  YP_001425102  unclonable  0.0000000100365  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1771  CDS  NC_009727  1767965  1769866  -  1902  heat shock protein 90  YP_001425103  unclonable  0.0000171528  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1773  CDS  NC_009727  1769921  1770196  +  276  hypothetical protein  YP_001425105  unclonable  0.0000000279639  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1774  CDS  NC_009727  1770286  1770981  -  696  outer membrane protein  YP_001425106  unclonable  0.000000106277  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1775  CDS  NC_009727  1770981  1771100  -  120  hypothetical protein  YP_001425107  unclonable  0.0000000084603  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1823  CDS  NC_009727  1813908  1814384  +  477  single-strand DNA binding protein  YP_001425151  unclonable  0.0000000500943  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1832  CDS  NC_009727  1820797  1821156  -  360  30S ribosomal protein S13  YP_001425160  unclonable  0.0000000154353  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1832a  CDS  NC_009727  1821161  1821256  -  96  hypothetical protein  YP_002268369  unclonable  0.00000000506962  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1859  CDS  NC_009727  1836095  1836517  -  423  30S ribosomal protein S12  YP_001425187  unclonable  0.0000000297311  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1913  CDS  NC_009727  1889333  1889806  -  474  homing endonuclease, 23S rRNA intron  YP_001425231  unclonable  0.0000000154353  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1915  tRNA  NC_009727  1892892  1892967  -  76  tRNA-Ala    unclonable  0.00000000764546  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1916  tRNA  NC_009727  1892972  1893048  -  77  tRNA-Ile    unclonable  0.00000000828574  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1917  rRNA  NC_009727  1893237  1894693  -  1457  Small Subunit Ribosomal RNA; ssuRNA; 16S ribosomal RNA    unclonable  0.00000207946  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1965  CDS  NC_009727  1945427  1946338  -  912  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001425275  unclonable  0.000000162027  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1966  CDS  NC_009727  1946498  1947679  -  1182  cell division protein FtsZ  YP_001425276  unclonable  0.000000388917  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1967  CDS  NC_009727  1947680  1948921  -  1242  cell division protein  YP_001425277  unclonable  0.000000443484  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_2058  CDS  NC_009727  2033062  2033817  -  756  hypothetical protein  YP_001425364  unclonable  0.000000064405  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_2059  CDS  NC_009727  2033927  2034529  -  603  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  YP_001425365  unclonable  0.0000000252813  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_2184  CDS  NC_009727  2149437  2150693  -  1257  transcription termination factor Rho  YP_001425486  unclonable  0.000000392995  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>