19 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bcenmc03_0289  CDS  NC_010508  317548  318831  -  1284  major facilitator transporter  YP_001763591  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0290  CDS  NC_010508  318926  319855  +  930  LysR family transcriptional regulator  YP_001763592  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0291  CDS  NC_010508  320041  320874  -  834  OmpW family protein  YP_001763593  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0292  CDS  NC_010508  320893  322134  -  1242  hypothetical protein  YP_001763594  hitchhiker  0.00023062  unclonable  0.0000000000623109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0293  CDS  NC_010508  322283  323704  -  1422  hypothetical protein  YP_001763595  normal  0.0932383  unclonable  0.0000000000716846  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0431  CDS  NC_010508  463579  464247  -  669  hypothetical protein  YP_001763731  normal  0.0528081  unclonable  0.000000000073878  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0965  CDS  NC_010508  1065482  1065685  +  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001764264  unclonable  0.00000000000119944  normal  0.392298  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_1058  CDS  NC_010508  1163480  1163803  -  324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001764357  unclonable  0.000000000000888322  normal  0.523648  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_1548  CDS  NC_010508  1713397  1714209  +  813  curculin domain-containing protein  YP_001764845  unclonable  0.0000000000088677  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_1893  CDS  NC_010508  2103328  2105751  -  2424  DnaB domain-containing protein  YP_001765176  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3784  CDS  NC_010515  697744  699540  -  1797  hypothetical protein  YP_001777425  unclonable  0.000000000199073  decreased coverage  0.00029228  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_4266  CDS  NC_010515  1221268  1221603  +  336  XRE family transcriptional regulator  YP_001777904  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_4633  CDS  NC_010515  1629052  1629357  +  306  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  YP_001778261  unclonable  0.000000000000292632  decreased coverage  0.0000243295  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_4687  CDS  NC_010515  1691682  1692227  +  546  hypothetical protein  YP_001778311  hitchhiker  0.00000147737  unclonable  0.00000000000186083  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_4688  CDS  NC_010515  1692696  1695206  +  2511  hypothetical protein  YP_001778312  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6699  CDS  NC_010512  779823  780347  +  525  metal dependent phosphohydrolase  YP_001774308  unclonable  0.00000000000101178  normal  0.0898754  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6700  CDS  NC_010512  780357  781034  +  678  hypothetical protein  YP_001774309  unclonable  0.00000000000256546  normal  0.135394  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6701  CDS  NC_010512  781188  781658  -  471  hypothetical protein  YP_001774310  unclonable  0.00000000000056634  normal  0.0829425  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_R0058  tRNA  NC_010508  2307036  2307111  -  76  tRNA-Ala    unclonable  0.000000000000357472  normal  0.478437  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>