293 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BCAH187_A0015  CDS  NC_011658  17043  18359  +  1317  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacA  YP_002336132  unclonable  0.0000000109924  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0016  CDS  NC_011658  18521  19408  +  888  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_002336133  unclonable  0.00000000359602  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0017  CDS  NC_011658  19427  20017  +  591  glutamine amidotransferase subunit PdxT  YP_002336134  unclonable  0.00000000149279  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0070  CDS  NC_011658  63805  64287  +  483  hypothetical protein  YP_002336179  unclonable  0.00000000137683  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0124  CDS  NC_011658  108749  109405  +  657  RNA polymerase factor sigma-70  YP_002336213  unclonable  0.00000000124346  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0125  CDS  NC_011658  109716  109895  +  180  preprotein translocase subunit SecE  YP_002336214  unclonable  0.000000000332702  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0126  CDS  NC_011658  110027  110560  +  534  transcription antitermination protein NusG  YP_002336215  unclonable  0.000000000863076  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0127  CDS  NC_011658  110728  111153  +  426  50S ribosomal protein L11  YP_002336216  unclonable  0.000000000622779  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0128  CDS  NC_011658  111331  112023  +  693  50S ribosomal protein L1  YP_002336217  unclonable  0.00000000143327  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0130  CDS  NC_011658  112256  112756  +  501  50S ribosomal protein L10  YP_002336218  unclonable  0.00000000124346  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0135  CDS  NC_011658  121448  121696  +  249  hypothetical protein  YP_002336223  unclonable  0.000000000655713  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0138  CDS  NC_011658  122942  125020  +  2079  elongation factor G  YP_002336226  unclonable  0.0000000590247  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0139  CDS  NC_011658  125138  126325  +  1188  elongation factor Tu  YP_002336227  unclonable  0.00000000328194  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0140  CDS  NC_011658  126726  127034  +  309  30S ribosomal protein S10  YP_002336228  unclonable  0.000000000306915  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0141  CDS  NC_011658  127069  127701  +  633  50S ribosomal protein L3  YP_002336229  unclonable  0.000000000551418  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0142  CDS  NC_011658  127727  128350  +  624  50S ribosomal protein L4  YP_002336230  unclonable  0.000000000690155  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0143  CDS  NC_011658  128350  128640  +  291  50S ribosomal protein L23  YP_002336231  unclonable  0.000000000263853  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0144  CDS  NC_011658  128669  129499  +  831  50S ribosomal protein L2  YP_002336232  unclonable  0.00000000100516  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0145  CDS  NC_011658  129560  129838  +  279  30S ribosomal protein S19  YP_002336233  unclonable  0.00000000029175  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0146  CDS  NC_011658  129856  130197  +  342  50S ribosomal protein L22  YP_002336234  unclonable  0.000000000364158  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0147  CDS  NC_011658  130201  130860  +  660  30S ribosomal protein S3  YP_002336235  unclonable  0.00000000084584  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0163  CDS  NC_011658  137947  138657  +  711  methionine aminopeptidase  YP_002336251  unclonable  0.00000000161795  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0164  CDS  NC_011658  138726  138944  +  219  translation initiation factor IF-1  YP_002336252  unclonable  0.00000000048346  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0165  CDS  NC_011658  138980  139093  +  114  50S ribosomal protein L36  YP_002336253  unclonable  0.00000000041135  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0166  CDS  NC_011658  139115  139480  +  366  30S ribosomal protein S13  YP_002336254  unclonable  0.000000000872047  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0167  CDS  NC_011658  139505  139894  +  390  30S ribosomal protein S11  YP_002336255  unclonable  0.000000000803352  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0173  CDS  NC_011658  144002  144760  +  759  tRNA pseudouridine synthase A  YP_002336261  unclonable  0.00000000175513  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0175  CDS  NC_011658  144913  145350  +  438  50S ribosomal protein L13  YP_002336262  unclonable  0.000000000580183  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0293  tRNA  NC_011658  253839  253915  +  77  tRNA-Glu    unclonable  0.000000000258541  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0294  tRNA  NC_011658  253919  253994  +  76  tRNA-Val    unclonable  0.000000000261183  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0295  tRNA  NC_011658  254040  254117  +  78  tRNA-Asp    unclonable  0.000000000294732  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0296  tRNA  NC_011658  254204  254278  +  75  tRNA-Gln    unclonable  0.000000000266549  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0297  tRNA  NC_011658  254284  254359  +  76  tRNA-Lys    unclonable  0.000000000294732  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0315  CDS  NC_011658  265996  266745  -  750  CAAX amino terminal protease family protein  YP_002336368  unclonable  0.00000000181046  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0316  CDS  NC_011658  267147  267431  +  285  co-chaperonin GroES  YP_002336369  unclonable  0.000000000403137  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0471  CDS  NC_011658  441092  442729  +  1638  PTS system, IIBC component  YP_002336498  unclonable  0.0000000276266  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0578  CDS  NC_011658  547417  548514  +  1098  A/G-specific adenine glycosylase  YP_002336603  unclonable  0.00000000608246  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0596  rRNA  NC_011658  566747  569655  +  2909  23S ribosomal RNA    unclonable  0.000000424077  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0599  rRNA  NC_011658  569756  569871  +  116  5S ribosomal RNA    unclonable  0.00000000037531  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0600  tRNA  NC_011658  569879  569955  +  77  tRNA-Asn    unclonable  0.000000000379275  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0601  tRNA  NC_011658  569956  570049  +  94  tRNA-Ser    unclonable  0.00000000039109  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0683  CDS  NC_011658  628264  629814  -  1551  glycine betaine transporter  YP_002336686  unclonable  0.0000000113352  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0739  CDS  NC_011658  690539  692158  -  1620  L-lactate permease  YP_002336742  unclonable  0.0000000128008  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0804  CDS  NC_011658  761258  762109  +  852  phospholipase C  YP_002336807  unclonable  0.00000000554633  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0854  tRNA  NC_011658  815083  815166  +  84  tRNA-Tyr    unclonable  0.000000000540408  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0855  tRNA  NC_011658  815178  815252  +  75  tRNA-Gln    unclonable  0.000000000488484  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0856  tRNA  NC_011658  815257  815332  +  76  tRNA-Lys    unclonable  0.000000000473646  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0857  tRNA  NC_011658  815346  815431  +  86  tRNA-Leu    unclonable  0.000000000493478  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0858  tRNA  NC_011658  815457  815531  +  75  tRNA-Gly    unclonable  0.000000000473646  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0859  tRNA  NC_011658  815547  815637  +  91  tRNA-Leu    unclonable  0.000000000493478  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0860  tRNA  NC_011658  815639  815717  +  79  tRNA-Arg    unclonable  0.00000000046411  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0873  CDS  NC_011658  817657  818808  +  1152  hypothetical protein  YP_002336852  unclonable  0.00000000608246  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0874  CDS  NC_011658  818863  819018  -  156  hypothetical protein  YP_002336853  unclonable  0.000000000669301  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0875  CDS  NC_011658  819033  819239  -  207  hypothetical protein  YP_002336854  unclonable  0.000000000755923  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0876  CDS  NC_011658  819377  820537  -  1161  peptidase, M23/M37 family  YP_002336855  unclonable  0.0000000105464  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0935  CDS  NC_011658  872915  874579  +  1665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  YP_002336909  unclonable  0.0000000203969  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0936  CDS  NC_011658  874765  875028  +  264  hypothetical protein  YP_002336910  unclonable  0.000000000387132  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0937  CDS  NC_011658  875117  875677  +  561  rhodanese domain protein  YP_002336911  unclonable  0.000000000726035  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0938  CDS  NC_011658  875716  876846  +  1131  metallo-beta-lactamase family protein  YP_002336912  unclonable  0.00000000331666  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0939  CDS  NC_011658  876885  877112  +  228  hypothetical protein  YP_002336913  unclonable  0.000000000269274  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0948  CDS  NC_011658  882982  884637  -  1656  Na/Pi-cotransporter family protein  YP_002336922  unclonable  0.0000000188119  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0949  CDS  NC_011658  884803  884925  -  123  hypothetical protein  YP_002336923  unclonable  0.000000000326004  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0966  CDS  NC_011658  901232  902548  -  1317  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  YP_002336940  unclonable  0.0000000062732  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0967  CDS  NC_011658  902767  903336  -  570  cotJC protein  YP_002336941  unclonable  0.000000000889969  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0968  CDS  NC_011658  903349  903612  -  264  cotJB protein  YP_002336942  unclonable  0.00000000037531  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0969  CDS  NC_011658  903621  903836  -  216  cotJA protein  YP_002336943  unclonable  0.000000000310052  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0970  CDS  NC_011658  903937  904290  +  354  hypothetical protein  YP_002336944  unclonable  0.000000000478568  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0971  CDS  NC_011658  904305  905084  +  780  hypothetical protein  YP_002336945  unclonable  0.00000000184767  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0972  CDS  NC_011658  905102  905914  -  813  Ku protein  YP_002336946  unclonable  0.00000000223662  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0974  CDS  NC_011658  906255  906536  +  282  hypothetical protein  YP_002336947  unclonable  0.000000000836995  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0995  CDS  NC_011658  924544  924999  +  456  acetyltransferase  YP_002336968  unclonable  0.00000000100516  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0996  CDS  NC_011658  925353  925697  +  345  putative sugE protein  YP_002336969  unclonable  0.000000000683055  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0997  CDS  NC_011658  925700  926014  +  315  putative sugE protein  YP_002336970  unclonable  0.00000000051913  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1042  CDS  NC_011658  969719  970855  +  1137  hypothetical protein  YP_002337013  unclonable  0.0000000115662  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1059  CDS  NC_011658  990917  991288  +  372  hypothetical protein  YP_002337029  unclonable  0.00000000219196  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1060  CDS  NC_011658  991390  992271  -  882  hypothetical protein  YP_002337030  unclonable  0.00000000877189  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1061  CDS  NC_011658  992286  994652  -  2367  preprotein translocase subunit SecA  YP_002337031  unclonable  0.000000383291  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1062  CDS  NC_011658  994935  996455  +  1521  polysaccharide synthase family protein  YP_002337032  unclonable  0.0000000239702  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1079  CDS  NC_011658  1016747  1018336  +  1590  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_002337049  unclonable  0.0000000334554  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1103  CDS  NC_011658  1045895  1047202  +  1308  hypothetical protein  YP_002337073  unclonable  0.0000000133351  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1144  CDS  NC_011658  1077401  1079137  +  1737  S-layer protein  YP_002337114  unclonable  0.0000000385936  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1192  CDS  NC_011658  1118364  1118558  +  195  dna-binding protein  YP_002337162  unclonable  0.000000000592004  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1193  CDS  NC_011658  1118624  1119184  +  561  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  YP_002337163  unclonable  0.00000000179213  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1194  CDS  NC_011658  1119413  1120234  +  822  glycerol uptake facilitator protein  YP_002337164  unclonable  0.00000000435303  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1195  CDS  NC_011658  1120248  1121738  +  1491  glycerol kinase  YP_002337165  unclonable  0.0000000355688  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1288  CDS  NC_011658  1210531  1211322  -  792  trifolitoxin immunity domain protein  YP_002337258  unclonable  0.00000000214818  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1314  CDS  NC_011658  1236306  1237601  +  1296  alpha-amylase family protein  YP_002337284  unclonable  0.0000000103321  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1437  CDS  NC_011658  1345536  1347923  +  2388  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  YP_002337406  unclonable  0.0000000866869  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1506  CDS  NC_011658  1408737  1408931  +  195  hypothetical protein  YP_002337473  unclonable  0.000000000503702  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1592  CDS  NC_011658  1476682  1477953  -  1272  peptidase, M23/M37 family  YP_002337556  unclonable  0.00000000620859  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1593  CDS  NC_011658  1478448  1479719  +  1272  proton/glutamate symporter family protein  YP_002337557  unclonable  0.00000000481335  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1594  CDS  NC_011658  1479786  1480304  +  519  hypothetical protein  YP_002337558  unclonable  0.000000000828525  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1596  CDS  NC_011658  1480625  1481941  +  1317  Na+/H+ antiporter family protein  YP_002337559  unclonable  0.00000000572024  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1601  CDS  NC_011658  1485133  1485765  +  633  DNA-binding response regulator  YP_002337564  unclonable  0.00000000136266  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1602  CDS  NC_011658  1485896  1486159  +  264  hypothetical protein  YP_002337565  unclonable  0.000000000436861  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1605  CDS  NC_011658  1488372  1489148  -  777  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  YP_002337568  unclonable  0.00000000158565  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1606  CDS  NC_011658  1489257  1490108  +  852  ribosomal protein L5 domain protein  YP_002337569  unclonable  0.0000000026566  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1640  CDS  NC_011658  1525167  1525781  +  615  peptidase, M23/M37 family  YP_002337603  unclonable  0.000000000676143  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1641  CDS  NC_011658  1525811  1526497  -  687  hypothetical protein  YP_002337604  unclonable  0.000000000648968  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1643  CDS  NC_011658  1527044  1527622  +  579  hypothetical protein  YP_002337605  unclonable  0.000000000917387  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>