39 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pmob_0001  CDS  NC_010003  53  1417  +  1365  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001567073  unclonable  0.000000297027  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0007  CDS  NC_010003  4112  5650  -  1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001567079  unclonable  0.000000649932  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0008  CDS  NC_010003  5655  6632  -  978  ABC transporter periplasmic-binding protein  YP_001567080  unclonable  0.0000000406397  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0009  CDS  NC_010003  6976  7725  +  750  deoxyribose-phosphate aldolase  YP_001567081  unclonable  0.00000000986742  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0010  CDS  NC_010003  7792  7989  -  198  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001567082  unclonable  0.00000000102405  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0011  CDS  NC_010003  8317  8874  +  558  elongation factor P  YP_001567083  unclonable  0.00000000591354  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0027  CDS  NC_010003  23726  24967  +  1242  extracellular solute-binding protein  YP_001567099  unclonable  0.0000000908101  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0028  CDS  NC_010003  25072  25974  +  903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001567100  unclonable  0.0000000378352  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0029  CDS  NC_010003  25988  26839  +  852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001567101  unclonable  0.0000000511748  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0037  CDS  NC_010003  34069  34368  -  300  stage V sporulation protein S  YP_001567109  unclonable  0.00000000556639  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0038  CDS  NC_010003  34762  35640  +  879  periplasmic binding protein  YP_001567110  unclonable  0.000000039007  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0056  CDS  NC_010003  50651  51985  -  1335  hypothetical protein  YP_001567128  unclonable  0.000000321928  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0057  CDS  NC_010003  52090  53046  -  957  S-layer domain-containing protein  YP_001567129  unclonable  0.0000000566138  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0150  CDS  NC_010003  154121  154393  +  273  stage V sporulation protein S  YP_001567220  unclonable  0.00000000295872  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0265  CDS  NC_010003  281796  282926  +  1131  extracellular ligand-binding receptor  YP_001567332  unclonable  0.0000000854786  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0289  CDS  NC_010003  306902  308215  -  1314  extracellular solute-binding protein  YP_001567354  unclonable  0.00000019091  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0314  CDS  NC_010003  336912  337694  +  783  membrane protein-like protein  YP_001567379  unclonable  0.00000003744  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0319  CDS  NC_010003  344052  345371  +  1320  signal recognition particle protein  YP_001567384  unclonable  0.000000288102  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0608  CDS  NC_010003  659744  660571  +  828  hypothetical protein  YP_001567665  unclonable  0.0000000110203  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0709  CDS  NC_010003  759825  760352  +  528  translation initiation factor IF-3  YP_001567757  unclonable  0.00000000966721  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0710  CDS  NC_010003  760376  760588  +  213  ribosomal protein L35  YP_001567758  unclonable  0.00000000179366  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0711  CDS  NC_010003  760634  760999  +  366  50S ribosomal protein L20  YP_001567759  unclonable  0.000000004038  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0712  CDS  NC_010003  761190  761795  +  606  adenylyl-sulfate kinase  YP_001567760  unclonable  0.0000000090997  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0731  CDS  NC_010003  782892  783905  -  1014  permease  YP_001567778  unclonable  0.0000000936228  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1428  CDS  NC_010003  1532278  1534794  -  2517  alpha amylase catalytic region  YP_001568454  unclonable  0.0000263704  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1438  CDS  NC_010003  1548949  1550151  -  1203  extracellular solute-binding protein  YP_001568464  unclonable  0.000000172655  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1539  CDS  NC_010003  1670218  1671456  +  1239  major facilitator transporter  YP_001568563  unclonable  0.000000151531  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1550  CDS  NC_010003  1683735  1684883  +  1149  hypothetical protein  YP_001568574  unclonable  0.000000114409  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1575  CDS  NC_010003  1715536  1717389  +  1854  extracellular solute-binding protein  YP_001568594  unclonable  0.00000589717  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1649  CDS  NC_010003  1804436  1806238  +  1803  molecular chaperone DnaK  YP_001568666  unclonable  0.00000228474  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1806  CDS  NC_010003  1984162  1984377  -  216  50S ribosomal protein L31  YP_001568818  unclonable  0.00000000545345  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1807  CDS  NC_010003  1984444  1984875  -  432  hypothetical protein  YP_001568819  unclonable  0.0000000159704  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1845  CDS  NC_010003  2029416  2030396  +  981  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX  YP_001568857  unclonable  0.0000000845855  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1910  CDS  NC_010003  2114931  2115203  +  273  histone family protein DNA-binding protein  YP_001568920  unclonable  0.00000000311196  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1911  CDS  NC_010003  2115275  2115946  +  672  metallophosphoesterase  YP_001568921  unclonable  0.0000000147352  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1939  CDS  NC_010003  2149251  2150408  +  1158  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_001568949  unclonable  0.000000141215  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1940  CDS  NC_010003  2150405  2151928  +  1524  membrane-associated zinc metalloprotease  YP_001568950  unclonable  0.000000740913  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1960  CDS  NC_010003  2168877  2169353  +  477  glutamine amidotransferase class-II  YP_001568970  unclonable  0.00000000722641  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_R0025  tRNA  NC_010003  660680  660754  -  75  tRNA-Glu    unclonable  0.000000000433123  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>