99 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ent638_0192  CDS  NC_009436  222639  223184  +  546  transcription antitermination protein NusG  YP_001174933  unclonable  0.0000000156554  normal  0.240176  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0336  CDS  NC_009436  385590  386189  -  600  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_001175075  normal  1  unclonable  0.00000245981  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0337  CDS  NC_009436  386453  386770  +  318  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  YP_001175076  normal  1  unclonable  0.00000205037  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0338  CDS  NC_009436  386767  387297  -  531  outer membrane lipoprotein Blc  YP_001175077  normal  1  unclonable  0.00000224655  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0339  CDS  NC_009436  387362  388519  -  1158  beta-lactamase  YP_001175078  normal  1  unclonable  0.00000286576  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0340  CDS  NC_009436  388566  388925  -  360  fumarate reductase subunit D  YP_001175079  normal  1  unclonable  0.00000189015  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0341  CDS  NC_009436  388936  389331  -  396  fumarate reductase subunit C  YP_001175080  normal  1  unclonable  0.00000183303  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0342  CDS  NC_009436  389342  390076  -  735  fumarate reductase iron-sulfur subunit  YP_001175081  normal  1  unclonable  0.00000194904  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0343  CDS  NC_009436  390069  391859  -  1791  fumarate reductase flavoprotein subunit  YP_001175082  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0344  CDS  NC_009436  392168  393145  +  978  lysyl-tRNA synthetase  YP_001175083  normal  1  unclonable  0.00000187091  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0345  CDS  NC_009436  393189  396500  -  3312  hypothetical protein  YP_001175084  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0346  CDS  NC_009436  396514  397551  -  1038  phosphatidylserine decarboxylase  YP_001175085  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0347  CDS  NC_009436  397649  398725  -  1077  ribosome-associated GTPase  YP_001175086  hitchhiker  0.0044619  unclonable  0.00000256254  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0348  CDS  NC_009436  398809  399354  +  546  oligoribonuclease  YP_001175087  hitchhiker  0.00000355346  unclonable  0.00000209228  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0349  CDS  NC_009436  400288  401427  -  1140  putative iron-sulfur cluster binding protein  YP_001175088  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0604  CDS  NC_009436  679631  680452  +  822  Dna-J like membrane chaperone protein  YP_001175342  unclonable  0.0000000356276  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0642  CDS  NC_009436  727497  728414  +  918  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001175380  unclonable  0.0000000274391  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0667  CDS  NC_009436  759607  759969  +  363  hypothetical protein  YP_001175405  unclonable  0.00000000546212  normal  0.390681  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0683  CDS  NC_009436  774280  775593  -  1314  poly(A) polymerase I  YP_001175421  unclonable  0.000000190798  normal  0.448758  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0906  CDS  NC_009436  1007211  1009565  +  2355  DNA-binding ATP-dependent protease La  YP_001175641  unclonable  0.0000110606  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_0928  CDS  NC_009436  1030947  1034033  +  3087  beta-D-galactosidase  YP_001175663  unclonable  0.0000620353  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1007  CDS  NC_009436  1115734  1116024  -  291  hypothetical protein  YP_001175741  decreased coverage  0.00436476  unclonable  0.00000224655  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1008  CDS  NC_009436  1116277  1116507  -  231  hypothetical protein  YP_001175742  decreased coverage  0.00304047  unclonable  0.00000220106  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1009  CDS  NC_009436  1117108  1117347  +  240  hypothetical protein  YP_001175743  normal  0.0276943  unclonable  0.00000241054  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1010  CDS  NC_009436  1117675  1118022  -  348  hypothetical protein  YP_001175744  normal  0.103443  unclonable  0.00000245981  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1011  CDS  NC_009436  1118287  1118943  -  657  putative phage repressor  YP_001175745  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1012  CDS  NC_009436  1119136  1119363  +  228  regulator protein, putative  YP_001175746  normal  0.465437  unclonable  0.00000272413  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1013  CDS  NC_009436  1119478  1119762  +  285  bacteriophage CII family protein  YP_001175747  normal  0.510941  unclonable  0.00000286576  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1014  CDS  NC_009436  1119862  1120788  +  927  phage replication protein O domain-containing protein  YP_001175748  normal  0.167273  unclonable  0.00000357424  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1015  CDS  NC_009436  1120785  1121471  +  687  phage replication protein P  YP_001175749  normal  0.103385  unclonable  0.00000339915  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1189  CDS  NC_009436  1306169  1307833  -  1665  asparagine synthetase B  YP_001175921  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1199  CDS  NC_009436  1319394  1319924  -  531  flavodoxin FldA  YP_001175931  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1200  CDS  NC_009436  1320082  1320369  -  288  LexA regulated protein  YP_001175932  unclonable  0.0000000088434  hitchhiker  0.000162968  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1201  CDS  NC_009436  1320498  1321271  -  774  hypothetical protein  YP_001175933  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1202  CDS  NC_009436  1321311  1321997  +  687  replication initiation regulator SeqA  YP_001175934  unclonable  0.0000000402071  hitchhiker  0.000209881  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1240  CDS  NC_009436  1365035  1365829  +  795  tol-pal system protein YbgF  YP_001175972  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1270  CDS  NC_009436  1397296  1398018  -  723  ABC transporter related  YP_001176002  unclonable  0.0000000211424  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1466  CDS  NC_009436  1621455  1621973  -  519  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_001176197  unclonable  0.0000000112473  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1467  CDS  NC_009436  1622042  1623802  -  1761  putative ATP-dependent protease  YP_001176198  unclonable  0.00000104055  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1603  CDS  NC_009436  1756151  1756672  +  522  hypothetical protein  YP_001176333  unclonable  0.0000000120656  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1604  CDS  NC_009436  1756689  1756862  +  174  50S ribosomal protein L32  YP_001176334  unclonable  0.00000000354666  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1605  CDS  NC_009436  1756888  1757976  +  1089  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX  YP_001176335  unclonable  0.0000000772854  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1606  CDS  NC_009436  1757983  1758936  +  954  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  YP_001176336  unclonable  0.0000000532359  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1609  CDS  NC_009436  1760903  1761139  +  237  acyl carrier protein  YP_001176339  unclonable  0.00000000323844  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1610  CDS  NC_009436  1761231  1762472  +  1242  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  YP_001176340  unclonable  0.0000000973391  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1615  CDS  NC_009436  1766073  1766867  +  795  putative metallodependent hydrolase  YP_001176345  unclonable  0.0000000236116  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1741  CDS  NC_009436  1889913  1891898  -  1986  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  YP_001176471  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1766  CDS  NC_009436  1919556  1920569  +  1014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001176496  hitchhiker  0.00000276408  unclonable  0.00000169171  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1767  CDS  NC_009436  1920634  1920870  -  237  LPP repeat-containing protein  YP_001176497  unclonable  0.00000000800001  unclonable  0.00000127827  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1768  CDS  NC_009436  1921178  1922599  -  1422  pyruvate kinase  YP_001176498  unclonable  0.000000514797  unclonable  0.00000209228  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1799  CDS  NC_009436  1956901  1957146  +  246  hypothetical protein  YP_001176529  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_1800  CDS  NC_009436  1957195  1958091  +  897  aldo/keto reductase  YP_001176530  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2196  CDS  NC_009436  2385621  2388218  -  2598  DNA topoisomerase I  YP_001176922  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2258  CDS  NC_009436  2442583  2442738  -  156  DNA polymerase III subunit theta  YP_001176980  hitchhiker  0.000273189  unclonable  0.00000264119  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2259  CDS  NC_009436  2443277  2443537  -  261  hypothetical protein  YP_001176981  hitchhiker  0.0000215122  unclonable  0.00000269578  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2260  CDS  NC_009436  2443524  2443958  -  435  hypothetical protein  YP_001176982  hitchhiker  0.000000902201  unclonable  0.00000269578  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2261  CDS  NC_009436  2443973  2444437  -  465  putative phage replication protein  YP_001176983  hitchhiker  0.00000554062  unclonable  0.00000245981  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2262  CDS  NC_009436  2444430  2445362  -  933  Pyocin large subunit-like protein  YP_001176984  decreased coverage  0.00000537713  unclonable  0.00000275213  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2263  CDS  NC_009436  2445433  2445987  -  555  bacteriophage regulatory protein CII  YP_001176985  hitchhiker  0.0000107948  unclonable  0.00000220106  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2264    NC_009436  2446044  2446223  -  180      hitchhiker  0.00000327263  unclonable  0.00000202904  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2265  CDS  NC_009436  2446310  2446747  +  438  XRE family transcriptional regulator  YP_001176986  hitchhiker  0.00000780415  unclonable  0.00000217866  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2266    NC_009436  2447452  2447622  +  171      hitchhiker  0.00000205244  unclonable  0.00000202904  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2267  CDS  NC_009436  2447859  2450363  +  2505  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  YP_001176987  hitchhiker  0.00156112  unclonable  0.00000492559  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2499  CDS  NC_009436  2697165  2697713  -  549  phosphatidylglycerophosphate synthetase  YP_001177219  unclonable  0.0000000123121  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2848  CDS  NC_009436  3088064  3088618  -  555  NUDIX hydrolase  YP_001177564  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2931  CDS  NC_009436  3181901  3183316  -  1416  glutamyl-tRNA synthetase  YP_001177646  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_2940  CDS  NC_009436  3191978  3192931  -  954  cell division protein ZipA  YP_001177655  unclonable  0.000000042713  normal  0.111677  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3236  CDS  NC_009436  3523991  3526222  -  2232  GDP/GTP pyrophosphokinase  YP_001177951  unclonable  0.00000465507  normal  0.0411901  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3272  CDS  NC_009436  3573500  3574030  -  531  dinucleoside polyphosphate hydrolase  YP_001177987  unclonable  0.0000000105899  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3329  CDS  NC_009436  3634218  3634547  +  330  Z-ring-associated protein  YP_001178043  unclonable  0.00000000688409  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3349  CDS  NC_009436  3655784  3656491  +  708  deoxyribonuclease I  YP_001178062  unclonable  0.0000000315843  decreased coverage  0.00212113  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3458  CDS  NC_009436  3767988  3768611  +  624  putative signal transduction protein  YP_001178168  unclonable  0.0000000279998  normal  0.164628  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3470  CDS  NC_009436  3777054  3778067  -  1014  putative DNA-binding/iron metalloprotein/AP endonuclease  YP_001178180  unclonable  0.00000009834  normal  0.209181  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3471  CDS  NC_009436  3778419  3778634  +  216  30S ribosomal protein S21  YP_001178181  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3621  CDS  NC_009436  3927428  3927685  -  258  50S ribosomal protein L27  YP_001178329  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3622  CDS  NC_009436  3927705  3928016  -  312  50S ribosomal protein L21  YP_001178330  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3739  CDS  NC_009436  4047040  4047579  -  540  50S ribosomal protein L5P  YP_001178447  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3740  CDS  NC_009436  4047594  4047908  -  315  50S ribosomal protein L24  YP_001178448  unclonable  0.00000000337214  hitchhiker  0.00363811  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3741  CDS  NC_009436  4047919  4048290  -  372  50S ribosomal protein L14  YP_001178449  unclonable  0.0000000040815  hitchhiker  0.0036093  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3757  CDS  NC_009436  4056439  4058553  -  2115  elongation factor G  YP_001178464  unclonable  0.00000182593  decreased coverage  0.00156911  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3758  CDS  NC_009436  4058653  4059123  -  471  30S ribosomal protein S7  YP_001178465  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_3759  CDS  NC_009436  4059220  4059594  -  375  30S ribosomal protein S12  YP_001178466  unclonable  0.00000000474528  hitchhiker  0.00357898  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_4019  CDS  NC_009436  4366047  4366898  -  852  glutamate racemase  YP_001178725  unclonable  0.0000000394018  decreased coverage  0.00413197  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_4102  CDS  NC_009436  4459400  4462192  -  2793  DNA polymerase I  YP_001178807  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_4125  CDS  NC_009436  4490619  4490999  +  381  F0F1 ATP synthase subunit I  YP_001178829  unclonable  0.00000000524554  normal  0.148775  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_4152  CDS  NC_009436  4518545  4518685  -  141  50S ribosomal protein L34  YP_001178856  unclonable  0.00000000170449  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0012  tRNA  NC_009436  399597  399672  +  76  tRNA-Gly    hitchhiker  0.000000103528  unclonable  0.00000189015  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0013  tRNA  NC_009436  399769  399844  +  76  tRNA-Gly    hitchhiker  0.0000000958382  unclonable  0.00000189015  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0014  tRNA  NC_009436  399941  400016  +  76  tRNA-Gly    unclonable  0.00000000460398  unclonable  0.00000183303  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0034  tRNA  NC_009436  1305775  1305859  -  85  tRNA-Leu    unclonable  0.00000000358312  hitchhiker  0.000769415  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0035  tRNA  NC_009436  1305869  1305945  -  77  tRNA-Met    unclonable  0.00000000330461  hitchhiker  0.000751114  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0036  tRNA  NC_009436  1365991  1366066  +  76  tRNA-Lys    unclonable  0.00000000225732  normal  0.109866  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0037  tRNA  NC_009436  1366189  1366264  +  76  tRNA-Val    unclonable  0.00000000198123  normal  0.111595  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0038  tRNA  NC_009436  1366268  1366343  +  76  tRNA-Lys    unclonable  0.00000000184687  normal  0.110517  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0049  tRNA  NC_009436  2696719  2696804  -  86  tRNA-Leu    unclonable  0.00000000237414  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0050  tRNA  NC_009436  2696817  2696890  -  74  tRNA-Cys    unclonable  0.00000000242266  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0051  tRNA  NC_009436  2696937  2697012  -  76  tRNA-Gly    unclonable  0.00000000228053  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0073  tRNA  NC_009436  3454107  3454183  -  77  tRNA-Arg    unclonable  0.00000000674469  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Ent638_R0074  tRNA  NC_009436  3454188  3454280  -  93  tRNA-Ser    unclonable  0.00000000641426  normal  1  Enterobacter sp. 638  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>