294 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sbal195_0001  CDS  NC_009997  382  1770  1389  chromosomal replication initiation protein  YP_001552443  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0002  CDS  NC_009997  1790  2890  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001552444  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0038  CDS  NC_009997  41892  42329  438  globin  YP_001552480  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0039  CDS  NC_009997  42483  43331  849  shikimate 5-dehydrogenase  YP_001552481  hitchhiker  0.00000317979  unclonable  0.000011065  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0040  CDS  NC_009997  43337  43612  276  hypothetical protein  YP_001552482  unclonable  0.0000000215973  unclonable  0.0000087148  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0041  CDS  NC_009997  43732  44280  549  carbonic anhydrase  YP_001552483  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0042  CDS  NC_009997  50388  50576  189  hypothetical protein  YP_001552484  normal  0.0871438  unclonable  0.0000116494  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0043  CDS  NC_009997  50599  51054  456  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001552485  normal  0.0465453  unclonable  0.0000121376  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0044  CDS  NC_009997  51029  51784  756  protein of unknown function DUF610 YibQ  YP_001552486  normal  0.244614  unclonable  0.0000129234  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0045  CDS  NC_009997  51797  53002  1206  carboxyl-terminal protease  YP_001552487  normal  unclonable  0.0000144504  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0046  CDS  NC_009997  53035  54123  1089  peptidase M23B  YP_001552488  normal  unclonable  0.0000129234  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0047  CDS  NC_009997  54182  55726  1545  phosphoglyceromutase  YP_001552489  normal  unclonable  0.0000166466  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0048  CDS  NC_009997  55979  56428  450  rhodanese domain-containing protein  YP_001552490  normal  unclonable  0.0000123958  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0049  CDS  NC_009997  56724  57209  486  preprotein translocase subunit SecB  YP_001552491  normal  unclonable  0.0000126595  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0050  CDS  NC_009997  57214  58230  1017  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_001552492  normal  unclonable  0.0000147486  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0051  CDS  NC_009997  58424  59608  1185  hypothetical protein  YP_001552493  normal  unclonable  0.0000135975  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0052  CDS  NC_009997  60140  61207  1068  hypothetical protein  YP_001552494  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0053  CDS  NC_009997  61204  61872  669  hypothetical protein  YP_001552495  normal  unclonable  0.0000103945  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0054  CDS  NC_009997  62524  63885  1362  TrkH family potassium uptake protein  YP_001552496  normal  unclonable  0.0000122698  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0055  CDS  NC_009997  63887  64585  699  TrkA domain-containing protein  YP_001552497  normal  unclonable  0.00000827601  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0056  CDS  NC_009997  64633  65322  690  two component transcriptional regulator  YP_001552498  normal  unclonable  0.00000725059  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0057  CDS  NC_009997  65323  66369  1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001552499  normal  unclonable  0.0000063575  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0058  CDS  NC_009997  66640  67563  924  pirin domain-containing protein  YP_001552500  normal  unclonable  0.00000580792  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0182  CDS  NC_009997  220440  220904  465  RNP-1 like RNA-binding protein  YP_001552624  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0197  CDS  NC_009997  245529  247625  2097  elongation factor G  YP_001552639  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0198  CDS  NC_009997  247698  248882  1185  elongation factor Tu  YP_001552640  unclonable  0.000000378702  unclonable  0.0000127922  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0199  CDS  NC_009997  249218  249529  312  30S ribosomal protein S10  YP_001552641  unclonable  0.0000000181945  unclonable  0.00000889639  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0200  CDS  NC_009997  249560  250198  639  50S ribosomal protein L3  YP_001552642  unclonable  0.0000000546138  unclonable  0.00000936811  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0201  CDS  NC_009997  250216  250821  606  50S ribosomal protein L4  YP_001552643  unclonable  0.0000000483773  unclonable  0.00000889639  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0202  CDS  NC_009997  250818  251123  306  50S ribosomal protein L23  YP_001552644  hitchhiker  0.000000251497  unclonable  0.00000770372  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0203  CDS  NC_009997  251140  251964  825  50S ribosomal protein L2  YP_001552645  hitchhiker  0.00000173146  unclonable  0.0000103945  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0204  CDS  NC_009997  251979  252257  279  30S ribosomal protein S19  YP_001552646  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0205  CDS  NC_009997  252273  252605  333  50S ribosomal protein L22  YP_001552647  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0206  CDS  NC_009997  252615  253307  693  30S ribosomal protein S3  YP_001552648  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0207  CDS  NC_009997  253319  253729  411  50S ribosomal protein L16  YP_001552649  hitchhiker  0.0000123968  unclonable  0.00000845197  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0208  CDS  NC_009997  253729  253920  192  50S ribosomal protein L29  YP_001552650  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0209  CDS  NC_009997  253920  254168  249  30S ribosomal protein S17  YP_001552651  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0210  CDS  NC_009997  254349  254717  369  50S ribosomal protein L14  YP_001552652  unclonable  0.00000000995848  unclonable  0.00000819027  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0211  CDS  NC_009997  254729  255043  315  50S ribosomal protein L24  YP_001552653  hitchhiker  0.000000151512  unclonable  0.00000802476  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0212  CDS  NC_009997  255056  255595  540  50S ribosomal protein L5  YP_001552654  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0213  CDS  NC_009997  255606  255911  306  30S ribosomal protein S14  YP_001552655  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0234  CDS  NC_009997  269161  271140  1980  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  YP_001552676  unclonable  0.0000102489  normal  0.153231  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0237  CDS  NC_009997  272179  272766  588  redoxin domain-containing protein  YP_001552679  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0355  CDS  NC_009997  402287  403231  945  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  YP_001552796  unclonable  0.000000157551  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0416  CDS  NC_009997  474009  475244  1236  cell division protein FtsA  YP_001552857  hitchhiker  0.00000530477  unclonable  0.0000068927  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0417  CDS  NC_009997  475278  476465  1188  cell division protein FtsZ  YP_001552858  decreased coverage  0.00000886919  unclonable  0.00000557557  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0418  CDS  NC_009997  476646  477566  921  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001552859  hitchhiker  0.000000145224  unclonable  0.00000465328  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0419  CDS  NC_009997  477579  478025  447  hypothetical protein  YP_001552860  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0420  CDS  NC_009997  478053  478952  900  peptidase M23B  YP_001552861  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0421  CDS  NC_009997  479013  481739  2727  preprotein translocase subunit SecA  YP_001552862  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0486  CDS  NC_009997  556943  558118  1176  diaminopimelate decarboxylase  YP_001552924  unclonable  0.000000602971  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0518  CDS  NC_009997  593337  594386  1050  rod shape-determining protein MreB  YP_001552956  unclonable  0.000000418886  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0709  CDS  NC_009997  861898  862590  693  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_001553147  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0739  CDS  NC_009997  888726  890168  1443  major facilitator transporter  YP_001553177  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0746  CDS  NC_009997  895378  896784  1407  replicative DNA helicase  YP_001553184  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0751  CDS  NC_009997  903207  903692  486  hypothetical protein  YP_001553189  normal  0.907741  unclonable  0.0000108368  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0752  CDS  NC_009997  904490  904759  270  hypothetical protein  YP_001553190  normal  0.271458  unclonable  0.0000108368  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0753  CDS  NC_009997  904756  905286  531  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001553191  normal  0.240345  unclonable  0.0000115311  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0754  CDS  NC_009997  905612  906427  816  hypothetical protein  YP_001553192  normal  0.157976  unclonable  0.0000126595  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0755  CDS  NC_009997  906513  906800  288  hypothetical protein  YP_001553193  normal  0.0593938  unclonable  0.00000997439  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0756  CDS  NC_009997  906881  907054  174  hypothetical protein  YP_001553194  normal  0.0450935  unclonable  0.00000936811  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0757  CDS  NC_009997  907120  907413  294  hypothetical protein  YP_001553195  normal  0.0281955  unclonable  0.00000986897  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0758  CDS  NC_009997  907410  907730  321  GP46  YP_001553196  hitchhiker  0.00217936  unclonable  0.00000966346  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0759  CDS  NC_009997  907727  907957  231  hypothetical protein  YP_001553197  hitchhiker  0.00176998  unclonable  0.00000997439  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0760  CDS  NC_009997  907954  908232  279  hypothetical protein  YP_001553198  hitchhiker  0.000660204  unclonable  0.0000103945  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0761  CDS  NC_009997  908233  908526  294  hypothetical protein  YP_001553199  hitchhiker  0.000626283  unclonable  0.0000109526  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0762  CDS  NC_009997  908557  908904  348  hypothetical protein  YP_001553200  hitchhiker  0.0000433319  unclonable  0.0000106133  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0763  CDS  NC_009997  908930  909190  261  hypothetical protein  YP_001553201  hitchhiker  0.0000422507  unclonable  0.0000111786  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0764  CDS  NC_009997  909187  909540  354  hypothetical protein  YP_001553202  unclonable  0.0000000592368  unclonable  0.0000111786  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0765  CDS  NC_009997  910685  911704  1020  hypothetical protein  YP_001553203  hitchhiker  0.000418038  unclonable  0.0000125283  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0766  CDS  NC_009997  911814  912572  759  hypothetical protein  YP_001553204  normal  0.0138376  unclonable  0.0000135975  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0767  CDS  NC_009997  912572  913138  567  hypothetical protein  YP_001553205  hitchhiker  0.00881796  unclonable  0.0000125283  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0811  CDS  NC_009997  950086  951054  969  hypothetical protein  YP_001553249  unclonable  0.000000176131  normal  0.246096  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0812  CDS  NC_009997  951057  951794  738  hypothetical protein  YP_001553250  unclonable  0.0000000586351  normal  0.244718  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0813  CDS  NC_009997  951883  953190  1308  outer membrane channel protein  YP_001553251  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0821  CDS  NC_009997  961557  962654  1098  porin  YP_001553259  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0832  CDS  NC_009997  974389  975639  1251  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001553270  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0882  CDS  NC_009997  1043035  1044576  1542  poly(A) polymerase  YP_001553319  unclonable  0.00000307041  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0884  CDS  NC_009997  1045674  1046117  444  TraR/DksA family transcriptional regulator  YP_001553321  unclonable  0.0000000326518  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0915  CDS  NC_009997  1080637  1081188  552  SH3 type 3 domain-containing protein  YP_001553351  unclonable  0.0000000529775  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1054  CDS  NC_009997  1248413  1250503  2091  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  YP_001553490  unclonable  0.0000147815  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1102  CDS  NC_009997  1303840  1304145  306  hypothetical protein  YP_001553538  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1118  CDS  NC_009997  1318555  1319316  762  putative lipoprotein  YP_001553554  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1149  CDS  NC_009997  1363580  1364353  774  hypothetical protein  YP_001553585  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1259  CDS  NC_009997  1498336  1499403  1068  putative adenylate/guanylate cyclase  YP_001553694  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1260  CDS  NC_009997  1499526  1500197  672  DNA mismatch repair protein  YP_001553695  unclonable  0.0000000473996  normal  0.12603  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1261  CDS  NC_009997  1500888  1501412  525  dinucleoside polyphosphate hydrolase  YP_001553696  unclonable  0.0000000399476  normal  0.124645  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1285  CDS  NC_009997  1523011  1523799  789  cytochrome c assembly protein  YP_001553720  unclonable  0.0000000446299  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1404  CDS  NC_009997  1682323  1683621  1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_001553838  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1482  CDS  NC_009997  1784447  1785298  852  elongation factor Ts  YP_001553915  unclonable  0.000000112791  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1483  CDS  NC_009997  1785367  1786104  738  uridylate kinase  YP_001553916  unclonable  0.0000000885565  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1484  CDS  NC_009997  1786126  1786683  558  ribosome recycling factor  YP_001553917  unclonable  0.0000000709639  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1602  CDS  NC_009997  1929993  1930949  957  hypothetical protein  YP_001554035  unclonable  0.000000235837  normal  0.253608  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1613  CDS  NC_009997  1946135  1948327  2193  decaheme cytochrome c  YP_001554046  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1624  CDS  NC_009997  1961848  1963227  1380  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_001554057  unclonable  0.00000105095  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1625  CDS  NC_009997  1963384  1964238  855  bifunctional 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/ 5,10-methylene-tetrahydrofolate cyclohydrolase  YP_001554058  unclonable  0.000000188982  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1626  CDS  NC_009997  1965125  1966429  1305  trigger factor  YP_001554059  unclonable  0.000000959254  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1629  CDS  NC_009997  1968625  1970982  2358  ATP-dependent protease La  YP_001554062  unclonable  0.0000414531  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1630  CDS  NC_009997  1971242  1971514  273  histone family protein DNA-binding protein  YP_001554063  unclonable  0.0000000159632  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_1654  CDS  NC_009997  1997194  1998405  1212  porin  YP_001554087  unclonable  0.000000730706  normal  0.12603  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>