46 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Msed_0015  CDS  NC_009440  12337  13350  -  1014  adenylosuccinate synthetase  YP_001190116  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0070  CDS  NC_009440  65368  66018  +  651  50S ribosomal protein L15e  YP_001190171  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0071  CDS  NC_009440  66024  66467  +  444  hypothetical protein  YP_001190172  unclonable  0.0000000000262103  hitchhiker  0.00974404  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0092  CDS  NC_009440  84378  85169  +  792  50S ribosomal protein L4P  YP_001190193  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0093  CDS  NC_009440  85166  85411  +  246  50S ribosomal protein L23P  YP_001190194  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0094  CDS  NC_009440  85421  86137  +  717  50S ribosomal protein L2P  YP_001190195  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0095  CDS  NC_009440  86170  86592  +  423  30S ribosomal protein S19P  YP_001190196  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0096  CDS  NC_009440  86598  87068  +  471  50S ribosomal protein L22P  YP_001190197  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0097  CDS  NC_009440  87072  87794  +  723  30S ribosomal protein S3P  YP_001190198  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0098  CDS  NC_009440  87775  87981  +  207  50S ribosomal protein L29P  YP_001190199  hitchhiker  0.0000000337188  unclonable  0.000000412154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0099  CDS  NC_009440  87968  88222  +  255  ribonuclease P, Rpp29  YP_001190200  hitchhiker  0.0000000456403  unclonable  0.000000438583  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0100  CDS  NC_009440  88227  88562  +  336  30S ribosomal protein S17P  YP_001190201  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0101  CDS  NC_009440  88569  88985  +  417  50S ribosomal protein L14P  YP_001190202  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0102  CDS  NC_009440  88995  89330  +  336  KOW domain-containing protein  YP_001190203  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0103  CDS  NC_009440  89327  90052  +  726  30S ribosomal protein S4e  YP_001190204  hitchhiker  0.00000000259785  unclonable  0.000000558992  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0104  CDS  NC_009440  90054  90578  +  525  50S ribosomal protein L5P  YP_001190205  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0105  CDS  NC_009440  90589  90753  +  165  30S ribosomal protein S14P  YP_001190206  unclonable  0.000000000005595  unclonable  0.000000383631  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0106  CDS  NC_009440  90759  91160  +  402  30S ribosomal protein S8P  YP_001190207  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0107  CDS  NC_009440  91170  91715  +  546  50S ribosomal protein L6P  YP_001190208  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0108  CDS  NC_009440  91715  92119  +  405  50S ribosomal protein L32e  YP_001190209  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0109  CDS  NC_009440  92122  92577  +  456  50S ribosomal protein L19e  YP_001190210  unclonable  0.0000000000123544  unclonable  0.000000342934  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0110  CDS  NC_009440  92584  93171  +  588  50S ribosomal protein L18P  YP_001190211  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0111  CDS  NC_009440  93171  93815  +  645  30S ribosomal protein S5P  YP_001190212  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0112  CDS  NC_009440  93823  94284  +  462  50S ribosomal protein L30P  YP_001190213  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0114  CDS  NC_009440  94737  96128  +  1392  preprotein translocase subunit SecY  YP_001190215  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0115  CDS  NC_009440  96131  96715  +  585  adenylate kinase  YP_001190216  unclonable  0.0000000000149459  hitchhiker  0.0000475665  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0116  CDS  NC_009440  96717  97160  +  444  hypothetical protein  YP_001190217  unclonable  0.00000000000755569  hitchhiker  0.0000438676  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0117  CDS  NC_009440  97168  97416  +  249  ribosomal protein L34e  YP_001190218  unclonable  0.00000000000303876  hitchhiker  0.0000372706  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0118  CDS  NC_009440  97413  97955  +  543  cytidylate kinase  YP_001190219  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0119  CDS  NC_009440  97974  98210  +  237  hypothetical protein  YP_001190220  unclonable  0.00000000000261436  hitchhiker  0.0000379633  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0514  CDS  NC_009440  470094  471260  -  1167  peptidase U32  YP_001190613  unclonable  0.000000000252039  hitchhiker  0.000774187  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0687  CDS  NC_009440  627777  628766  +  990  FAD dependent oxidoreductase  YP_001190786  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0688  CDS  NC_009440  628763  629230  +  468  AsnC family transcriptional regulator  YP_001190787  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0689  CDS  NC_009440  629264  630073  +  810  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  YP_001190788  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_0690  CDS  NC_009440  630070  630813  +  744  hypothetical protein  YP_001190789  hitchhiker  0.000505457  unclonable  0.000000253293  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_1134  CDS  NC_009440  1066056  1070423  -  4368  hypothetical protein  YP_001191219  unclonable  0.0000377058  normal  1  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_1390  CDS  NC_009440  1363859  1364758  +  900  hexokinase  YP_001191472  normal  0.637507  unclonable  0.000000391885  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_1391  CDS  NC_009440  1364799  1365278  -  480  deoxyUTP pyrophosphatase  YP_001191473  normal  0.45866  unclonable  0.000000274623  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_1392  CDS  NC_009440  1365319  1365861  -  543  hypothetical protein  YP_001191474  normal  0.158541  unclonable  0.000000285952  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_1393  CDS  NC_009440  1365939  1367024  -  1086  peptidase M28  YP_001191475  normal  0.0177008  unclonable  0.000000310034  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_2134  CDS  NC_009440  2054536  2055498  -  963  glycosyl transferase family protein  YP_001192197  normal  0.127687  unclonable  0.000000669525  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_2145  CDS  NC_009440  2061782  2062570  -  789  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  YP_001192208  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_2146  CDS  NC_009440  2062572  2062970  -  399  30S ribosomal protein S11P  YP_001192209  unclonable  0.00000000001001  hitchhiker  0.000312913  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_2153  CDS  NC_009440  2067211  2068452  +  1242  DNA primase  YP_001192216  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_2226  CDS  NC_009440  2131226  2131786  +  561  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  YP_001192288  normal  1  unclonable  0.000000226618  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Msed_2227  CDS  NC_009440  2131844  2132812  -  969  aldo/keto reductase  YP_001192289  normal  1  unclonable  0.00000023844  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>