164 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Glov_0002  CDS  NC_010814  1870  2988  +  1119  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001950261  unclonable  0.00000138199  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0027  CDS  NC_010814  28298  30844  +  2547  DNA gyrase, A subunit  YP_001950285  unclonable  0.000124476  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0211  CDS  NC_010814  196004  197455  +  1452  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  YP_001950462  unclonable  0.00000324038  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0223  CDS  NC_010814  205816  206403  +  588  transcriptional regulator, TetR family  YP_001950474  unclonable  0.0000000853805  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0346  CDS  NC_010814  317317  318105  -  789  tRNA pseudouridine synthase A  YP_001950594  unclonable  0.000000224311  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0347  CDS  NC_010814  318224  319324  -  1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_001950595  unclonable  0.00000114034  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0348  CDS  NC_010814  319392  320483  -  1092  3-isopropylmalate dehydrogenase  YP_001950596  unclonable  0.00000128786  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0364  CDS  NC_010814  336214  337830  -  1617  MscS Mechanosensitive ion channel  YP_001950612  unclonable  0.00000549474  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0399  CDS  NC_010814  376846  378036  -  1191  beta-lactamase domain protein  YP_001950647  unclonable  0.00000165819  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0400  CDS  NC_010814  378223  379575  +  1353  DNA repair protein RadA  YP_001950648  unclonable  0.00000197198  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0401  CDS  NC_010814  379651  380007  +  357  transcriptional regulator, TraR/DksA family  YP_001950649  unclonable  0.000000019993  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0415  CDS  NC_010814  396089  396412  -  324  protein of unknown function YGGT  YP_001950663  unclonable  0.0000000337721  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0416  CDS  NC_010814  396573  397364  +  792  Inositol-phosphate phosphatase  YP_001950664  unclonable  0.000000198572  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0417  CDS  NC_010814  397361  397696  +  336  hypothetical protein  YP_001950665  unclonable  0.0000000409151  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0484  CDS  NC_010814  460420  461586  -  1167  2-alkenal reductase  YP_001950732  unclonable  0.00000148342  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0499  CDS  NC_010814  474287  475618  +  1332  hypothetical protein  YP_001950747  unclonable  0.00000165819  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0501  CDS  NC_010814  476820  477650  -  831  Uroporphyrinogen-III synthase  YP_001950749  unclonable  0.000000190734  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0554  CDS  NC_010814  523321  524178  -  858  peptidase M48 Ste24p  YP_001950802  unclonable  0.000000177743  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0665  CDS  NC_010814  671690  672925  -  1236  cell division protein FtsA  YP_001950911  unclonable  0.00000156077  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0692  CDS  NC_010814  703019  703564  +  546  cob(I)alamin adenosyltransferase  YP_001950938  unclonable  0.000000096318  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0693  CDS  NC_010814  703672  704070  +  399  hypothetical protein  YP_001950939  unclonable  0.0000000515646  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0699  CDS  NC_010814  708771  709688  -  918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001950945  unclonable  0.00000032571  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0700  CDS  NC_010814  709791  713288  -  3498  transcription-repair coupling factor  YP_001950946  unclonable  0.00154056  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0753  CDS  NC_010814  763197  764399  -  1203  putative PAS/PAC sensor protein  YP_001950999  unclonable  0.00000171105  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0754  CDS  NC_010814  764579  767035  +  2457  penicillin-binding protein, 1A family  YP_001951000  unclonable  0.000281003  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0756  CDS  NC_010814  774047  776272  +  2226  ribonuclease, Rne/Rng family  YP_001951002  unclonable  0.000069675  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0763  CDS  NC_010814  783641  784093  +  453  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_001951009  unclonable  0.0000000366044  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0838    NC_010814  858742  862056  -  3315      unclonable  0.00135022  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0980  CDS  NC_010814  1018753  1019796  -  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_001951223  unclonable  0.00000066828  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0981  CDS  NC_010814  1019968  1022742  +  2775  isoleucyl-tRNA synthetase  YP_001951224  unclonable  0.000415379  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0982  CDS  NC_010814  1022744  1023232  +  489  lipoprotein signal peptidase  YP_001951225  unclonable  0.000000103329  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0983  CDS  NC_010814  1023331  1023540  +  210  hypothetical protein  YP_001951226  unclonable  0.0000000400943  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0984  CDS  NC_010814  1023611  1024021  -  411  hypothetical protein  YP_001951227  unclonable  0.0000000605763  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0985  CDS  NC_010814  1024091  1024987  +  897  HhH-GPD family protein  YP_001951228  unclonable  0.000000391323  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0986  CDS  NC_010814  1024971  1026143  -  1173  hypothetical protein  YP_001951229  unclonable  0.00000103126  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0987  CDS  NC_010814  1026279  1026794  +  516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  YP_001951230  unclonable  0.0000000637333  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0988  CDS  NC_010814  1026871  1027374  -  504  hypothetical protein  YP_001951231  unclonable  0.0000000515646  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0990  CDS  NC_010814  1028559  1029893  -  1335  protein of unknown function DUF512  YP_001951233  unclonable  0.000000932101  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0991  CDS  NC_010814  1029960  1030190  -  231  RNA chaperone Hfq  YP_001951234  unclonable  0.00000000748773  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1044  CDS  NC_010814  1084893  1086149  -  1257  hypothetical protein  YP_001951287  unclonable  0.00000096075  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1091  CDS  NC_010814  1138940  1140598  -  1659  hypothetical protein  YP_001951334  unclonable  0.00000808246  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1149  CDS  NC_010814  1200315  1202885  -  2571  molybdopterin oxidoreductase  YP_001951391  unclonable  0.000213682  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1176  CDS  NC_010814  1229111  1230004  +  894  transcriptional regulator, LysR family  YP_001951418  unclonable  0.00000040335  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1206  CDS  NC_010814  1251605  1252498  +  894  transcriptional regulator, LysR family  YP_001951448  unclonable  0.00000040335  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1207  CDS  NC_010814  1252535  1253206  +  672  exsB protein  YP_001951449  unclonable  0.000000226628  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1208  CDS  NC_010814  1253590  1254936  +  1347  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  YP_001951450  unclonable  0.00000278283  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1269  CDS  NC_010814  1319196  1320191  +  996  hypothetical protein  YP_001951511  unclonable  0.00000022202  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1270  CDS  NC_010814  1320283  1321107  +  825  hypothetical protein  YP_001951512  unclonable  0.000000179578  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1313  CDS  NC_010814  1358186  1359124  +  939  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  YP_001951554  unclonable  0.000000261036  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1314  CDS  NC_010814  1359158  1359793  +  636  Fibronectin type III domain protein  YP_001951555  unclonable  0.000000146829  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1315  CDS  NC_010814  1359991  1360998  -  1008  hypothetical protein  YP_001951556  unclonable  0.000000524828  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1316  CDS  NC_010814  1361187  1362014  +  828  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  YP_001951557  unclonable  0.000000271836  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1329  CDS  NC_010814  1373679  1375277  +  1599  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  YP_001951570  unclonable  0.00000533085  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1330  CDS  NC_010814  1375372  1376229  +  858  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  YP_001951571  unclonable  0.000000387324  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1341  CDS  NC_010814  1390817  1391188  +  372  30S ribosomal protein S12  YP_001951582  unclonable  0.0000000369822  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1454  CDS  NC_010814  1506896  1510183  -  3288  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  YP_001951693  unclonable  0.000744178  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1457  CDS  NC_010814  1515876  1518698  -  2823  hypothetical protein  YP_001951696  unclonable  0.000415379  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1514  CDS  NC_010814  1586485  1588113  +  1629  hypothetical protein  YP_001951750  unclonable  0.0000154767  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1515  CDS  NC_010814  1588177  1590786  +  2610  polysaccharide export protein  YP_001951751  unclonable  0.000317972  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1598  CDS  NC_010814  1689795  1691135  +  1341  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  YP_001951834  unclonable  0.00000269909  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1605  CDS  NC_010814  1697546  1698964  +  1419  Phosphoglucomutase  YP_001951841  unclonable  0.00000165819  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1615  CDS  NC_010814  1718459  1718866  -  408  hypothetical protein  YP_001951851  unclonable  0.0000000553478  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1616  CDS  NC_010814  1719111  1720115  +  1005  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  YP_001951852  unclonable  0.000000514015  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1673  CDS  NC_010814  1782387  1782653  +  267  30S ribosomal protein S15  YP_001951909  unclonable  0.0000000247174  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1721  CDS  NC_010814  1822836  1826807  -  3972  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_001951957  unclonable  0.00699469  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1743  CDS  NC_010814  1854753  1855223  -  471  hypothetical protein  YP_001951979  unclonable  0.0000000691154  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1744  CDS  NC_010814  1855348  1856478  -  1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  YP_001951980  unclonable  0.00000105238  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1754  CDS  NC_010814  1864619  1865884  +  1266  acetate kinase  YP_001951990  unclonable  0.00000122438  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1776  CDS  NC_010814  1892984  1894960  +  1977  sodium/hydrogen exchanger  YP_001952012  unclonable  0.0000381991  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1777  CDS  NC_010814  1895051  1896082  +  1032  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_001952013  unclonable  0.00000124944  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1875  CDS  NC_010814  1997061  1997354  +  294  hypothetical protein  YP_001952111  unclonable  0.0000000193919  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1876  CDS  NC_010814  1997422  1998570  -  1149  class II aldolase/adducin family protein  YP_001952112  unclonable  0.000000546395  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1877  CDS  NC_010814  1998570  1999391  -  822  Peptidase M23  YP_001952113  unclonable  0.000000121356  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1878  CDS  NC_010814  1999527  2000246  +  720  type IV pilus assembly PilZ  YP_001952114  unclonable  0.00000011309  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1879  CDS  NC_010814  2000450  2000788  +  339  nitrogen regulatory protein P-II  YP_001952115  unclonable  0.0000000257329  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1880  CDS  NC_010814  2000819  2002231  +  1413  glutamine synthetase, type I  YP_001952116  unclonable  0.00000193133  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1881  CDS  NC_010814  2002361  2003038  +  678  peptidase M50  YP_001952117  unclonable  0.000000148344  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1887  CDS  NC_010814  2007767  2010298  +  2532  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  YP_001952123  unclonable  0.000227098  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1920  CDS  NC_010814  2044807  2046174  -  1368  carboxyl-terminal protease  YP_001952156  unclonable  0.00000216068  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1921  CDS  NC_010814  2046270  2047466  -  1197  Peptidase M23  YP_001952157  unclonable  0.00000118753  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1926  CDS  NC_010814  2050524  2050802  -  279  histone family protein DNA-binding protein  YP_001952162  unclonable  0.0000000201993  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1927  CDS  NC_010814  2050897  2052156  -  1260  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  YP_001952163  unclonable  0.000000922573  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1928  CDS  NC_010814  2052158  2052751  -  594  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  YP_001952164  unclonable  0.0000000803868  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1929  CDS  NC_010814  2052765  2054087  -  1323  trigger factor  YP_001952165  unclonable  0.00000216068  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1932  CDS  NC_010814  2058009  2059256  -  1248  serine hydroxymethyltransferase  YP_001952168  unclonable  0.00000167671  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1933  CDS  NC_010814  2059351  2059800  -  450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  YP_001952169  unclonable  0.0000000691154  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1936  CDS  NC_010814  2061495  2062232  -  738  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_001952172  unclonable  0.000000245701  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1937  CDS  NC_010814  2062255  2062692  -  438  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_001952173  unclonable  0.0000000779901  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1970  CDS  NC_010814  2092591  2093637  -  1047  hypothetical protein  YP_001952206  unclonable  0.000000904058  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2018  CDS  NC_010814  2147480  2148355  +  876  hypothetical protein  YP_001952254  unclonable  0.00000040335  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2071  CDS  NC_010814  2206946  2207356  +  411  PilT protein domain protein  YP_001952307  unclonable  0.0000000612015  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2076  CDS  NC_010814  2210020  2210973  -  954  protein of unknown function DUF1566  YP_001952312  unclonable  0.000000300588  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2077  CDS  NC_010814  2211361  2211570  -  210  hypothetical protein  YP_001952313  unclonable  0.0000000111793  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2078  CDS  NC_010814  2211583  2212059  -  477  transcription elongation factor GreA  YP_001952314  unclonable  0.0000000287405  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2097  CDS  NC_010814  2235180  2236820  -  1641  4-phytase  YP_001952333  unclonable  0.00000775897  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2098  CDS  NC_010814  2236817  2238517  -  1701  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_001952334  unclonable  0.0000120088  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2107  CDS  NC_010814  2246472  2247092  +  621  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  YP_001952343  unclonable  0.000000116567  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2108  CDS  NC_010814  2247195  2247458  +  264  30S ribosomal protein S20  YP_001952344  unclonable  0.0000000204078  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2109  CDS  NC_010814  2247629  2250136  +  2508  Spore coat protein CotH  YP_001952345  unclonable  0.00013644  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2145  CDS  NC_010814  2291004  2292725  -  1722  ribosomal protein S1  YP_001952381  unclonable  0.0000142665  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>