17 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BamMC406_0237  CDS  NC_010551  272170  273090  +  921  LysR family transcriptional regulator  YP_001806954  hitchhiker  0.0000000618389  unclonable  0.0000000000250683  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0238  CDS  NC_010551  273296  274129  -  834  OmpW family protein  YP_001806955  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0277  CDS  NC_010551  328607  329227  +  621  50S ribosomal protein L4  YP_001806994  unclonable  0.00000000000696788  normal  0.0754371  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0474  CDS  NC_010551  530231  531007  +  777  enoyl-CoA hydratase  YP_001807187  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_1177  CDS  NC_010551  1298799  1300388  +  1590  lytic transglycosylase catalytic  YP_001807884  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_1862  CDS  NC_010551  2077416  2079935  -  2520  1A family penicillin-binding protein  YP_001808560  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2435  CDS  NC_010551  2703348  2704727  -  1380  amino acid permease-associated region  YP_001809129  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2436  CDS  NC_010551  2704830  2707130  -  2301  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  YP_001809130  normal  0.0100444  unclonable  0.0000000000629584  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2437  CDS  NC_010551  2707127  2707441  -  315  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  YP_001809131  hitchhiker  0.00000147491  unclonable  0.0000000000178377  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2438  CDS  NC_010551  2707991  2708194  +  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001809132  unclonable  0.00000000000180609  unclonable  0.0000000000176576  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2439  CDS  NC_010551  2708442  2710655  -  2214  YadA domain-containing protein  YP_001809133  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2440  CDS  NC_010551  2711074  2712672  -  1599  multicopper oxidase type 3  YP_001809134  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2441  CDS  NC_010551  2713336  2713560  +  225  hypothetical protein  YP_001809135  normal  0.343046  unclonable  0.0000000000151958  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_2442  CDS  NC_010551  2713690  2715918  -  2229  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  YP_001809136  normal  1  unclonable  0.0000000000648853  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_R0017  rRNA  NC_010551  531562  533087  +  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  0.000000000948011  normal  0.820797  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_R0058  tRNA  NC_010551  2181343  2181418  -  76  tRNA-Ala    unclonable  0.000000000000613252  normal  0.244453  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_R0067  rRNA  NC_010551  2384659  2386184  -  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  0.00000000059225  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>