75 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Cyan8802_0053  CDS  NC_013161  55855  57237  -  1383  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  YP_003135860  unclonable  0.00000498494  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0063  CDS  NC_013161  64971  65942  +  972  NmrA family protein  YP_003135869  unclonable  0.00000216715  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0064  CDS  NC_013161  65970  66887  +  918  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  YP_003135870  unclonable  0.00000162022  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0156  CDS  NC_013161  160794  161573  +  780  protein serine/threonine phosphatase  YP_003135961  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0157  CDS  NC_013161  161925  162698  +  774  protein of unknown function DUF820  YP_003135962  unclonable  0.00000154086  normal  0.0157865  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0213  CDS  NC_013161  209617  210048  -  432  protein of unknown function DUF29  YP_003136017  unclonable  0.000000762882  decreased coverage  0.000484269  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0418  CDS  NC_013161  413320  414123  +  804  protein of unknown function DUF1555  YP_003136212  unclonable  0.00000311091  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0442  CDS  NC_013161  436861  438285  +  1425  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_003136236  unclonable  0.0000112468  normal  0.115527  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0443  CDS  NC_013161  438743  440743  +  2001  Carbohydrate-selective porin OprB  YP_003136237  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0519  CDS  NC_013161  511604  512416  +  813  Squalene/phytoene synthase  YP_003136302  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0897  CDS  NC_013161  911877  912758  -  882  peptidase S13 D-Ala-D-Ala carboxypeptidase C  YP_003136668  unclonable  0.00000340535  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0971  CDS  NC_013161  995028  995477  +  450  protein of unknown function DUF29  YP_003136740  unclonable  0.000000575835  normal  0.0486362  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0972  CDS  NC_013161  995533  996582  -  1050  recombinase A  YP_003136741  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1045  CDS  NC_013161  1068447  1069628  -  1182  DNA polymerase III subunit beta  YP_003136812  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1046  CDS  NC_013161  1070710  1071672  +  963  ABC transporter related  YP_003136813  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1047  CDS  NC_013161  1071702  1072487  +  786  ABC-2 type transporter  YP_003136814  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1048  CDS  NC_013161  1072527  1074338  +  1812  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  YP_003136815  normal  0.110621  unclonable  0.00000000484608  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1187  CDS  NC_013161  1210881  1211588  +  708  protein of unknown function DUF820  YP_003136951  unclonable  0.00000133784  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1188  CDS  NC_013161  1211680  1213167  +  1488  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B  YP_003136952  unclonable  0.00000948034  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1267  CDS  NC_013161  1289375  1290445  +  1071  photosystem q(b) protein  YP_003137025  unclonable  0.00000399793  hitchhiker  0.00458282  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1268  CDS  NC_013161  1290598  1291179  -  582  protein of unknown function DUF820  YP_003137026  unclonable  0.00000136516  hitchhiker  0.00936719  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1269  CDS  NC_013161  1291340  1291507  +  168  hypothetical protein  YP_003137027  unclonable  0.000000421626  hitchhiker  0.00880749  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1345  CDS  NC_013161  1370116  1370961  -  846  protein of unknown function DUF820  YP_003137103  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1983  CDS  NC_013161  2004549  2004797  -  249  30S ribosomal protein S16  YP_003137709  unclonable  0.000000439019  normal  0.0268459  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1984  CDS  NC_013161  2004951  2005553  -  603  protein of unknown function DUF218  YP_003137710  unclonable  0.00000111651  normal  0.0299035  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1985  CDS  NC_013161  2005727  2006011  +  285  hypothetical protein  YP_003137711  unclonable  0.000000669596  normal  0.0279875  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1986  CDS  NC_013161  2006061  2006330  -  270  hypothetical protein  YP_003137712  unclonable  0.000000656198  normal  0.027281  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_1987  CDS  NC_013161  2006599  2007657  +  1059  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  YP_003137713  unclonable  0.00000347488  normal  0.0187293  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2041  CDS  NC_013161  2059092  2060162  +  1071  photosystem q(b) protein  YP_003137767  unclonable  0.00000221141  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2208  CDS  NC_013161  2216990  2220646  -  3657  hypothetical protein  YP_003137924  unclonable  0.00220427  normal  0.956264  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2270  CDS  NC_013161  2285872  2288055  +  2184  Peptidase M23  YP_003137984  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2714  CDS  NC_013161  2745203  2745700  +  498  photosystem I reaction center protein PsaF subunit III  YP_003138409  unclonable  0.000000762882  normal  0.402807  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2715  CDS  NC_013161  2745801  2745929  +  129  photosystem I reaction center subunit IX  YP_003138410  unclonable  0.000000294033  normal  0.375601  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2716  CDS  NC_013161  2746058  2749429  -  3372  putative transcriptional regulator  YP_003138411  unclonable  0.000820476  normal  0.236594  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2737  CDS  NC_013161  2768188  2769687  -  1500  C-3',4' desaturase CrtD  YP_003138431  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2738  CDS  NC_013161  2770060  2770677  +  618  protein of unknown function DUF820  YP_003138432  unclonable  0.00000201977  unclonable  0.00000000257493  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2739    NC_013161  2770700  2770774  -  75      hitchhiker  0.000356275  unclonable  0.00000000198286  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2740  CDS  NC_013161  2770810  2771163  -  354  hypothetical protein  YP_003138433  hitchhiker  0.000628686  unclonable  0.000000002128  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2741  CDS  NC_013161  2771273  2772274  -  1002  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  YP_003138434  hitchhiker  0.00698708  unclonable  0.00000000287618  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2742  CDS  NC_013161  2772337  2773371  -  1035  protein of unknown function UPF0118  YP_003138435  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2743  CDS  NC_013161  2773384  2773593  -  210  hypothetical protein  YP_003138436  normal  1  unclonable  0.00000000172345  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2744  CDS  NC_013161  2773613  2775055  -  1443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  YP_003138437  normal  1  unclonable  0.00000000314973  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2863  CDS  NC_013161  2890968  2891579  -  612  protein of unknown function DUF820  YP_003138548  unclonable  0.00000118606  decreased coverage  0.0000938837  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_2915  CDS  NC_013161  2952434  2953756  +  1323  Extracellular ligand-binding receptor  YP_003138598  unclonable  0.0000111325  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3051  CDS  NC_013161  3084580  3086106  -  1527  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  YP_003138732  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3119  CDS  NC_013161  3188964  3189557  -  594  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  YP_003138795  unclonable  0.00000112797  normal  0.654316  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3147  CDS  NC_013161  3217240  3217566  -  327  Rare lipoprotein A  YP_003138821  unclonable  0.000000599592  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3148  CDS  NC_013161  3217778  3218527  +  750  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_003138822  unclonable  0.00000145051  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3474  CDS  NC_013161  3543070  3543213  -  144  hypothetical protein  YP_003139133  unclonable  0.000000174771  normal  0.190022  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3475  CDS  NC_013161  3543771  3544352  +  582  protein of unknown function DUF820  YP_003139134  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3732  CDS  NC_013161  3820293  3821309  +  1017  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_003139379  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3733  CDS  NC_013161  3821393  3822271  +  879  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  YP_003139380  unclonable  0.00000311091  normal  0.111305  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3734  CDS  NC_013161  3822566  3823357  +  792  protein of unknown function DUF1555  YP_003139381  unclonable  0.00000234967  normal  0.106444  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3921  CDS  NC_013161  4035396  4036094  +  699  hypothetical protein  YP_003139560  unclonable  0.00000140733  normal  0.231164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3945  CDS  NC_013161  4065124  4065711  -  588  protein of unknown function DUF820  YP_003139584  unclonable  0.00000129802  normal  0.0173908  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_3980  CDS  NC_013161  4094525  4095523  -  999  phosphoribulokinase  YP_003139618  unclonable  0.00000234967  decreased coverage  0.00010781  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4170  CDS  NC_013161  4303230  4304279  -  1050  rod shape-determining protein MreB  YP_003139797  unclonable  0.00000201977  normal  1  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4244  CDS  NC_013161  4382709  4385138  +  2430  GTPase (dynamin-related)-like protein  YP_003139866  unclonable  0.000109098  hitchhiker  0.00000166794  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4245  CDS  NC_013161  4385377  4385715  +  339  KGK family protein  YP_003139867  unclonable  0.000000786451  hitchhiker  0.000000469629  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4246  CDS  NC_013161  4385877  4386140  +  264  hypothetical protein  YP_003139868  unclonable  0.000000581747  hitchhiker  0.0000000407614  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4247  CDS  NC_013161  4386206  4386448  +  243  HNH endonuclease  YP_003139869  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4248  CDS  NC_013161  4386449  4387390  -  942  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_003139870  unclonable  0.00000223411  unclonable  0.00000000287618  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4249  CDS  NC_013161  4387530  4388282  -  753  protein of unknown function DUF820  YP_003139871  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4316  CDS  NC_013161  4461232  4462524  +  1293  carboxyl-terminal protease  YP_003139937  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4324  CDS  NC_013161  4468450  4468917  -  468  RNP-1 like RNA-binding protein  YP_003139945  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4376  CDS  NC_013161  4526624  4526956  -  333  hypothetical protein  YP_003139996  unclonable  0.0000005005  unclonable  0.00000000143863  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4377  CDS  NC_013161  4526957  4527268  -  312  protein of unknown function DUF433  YP_003139997  unclonable  0.000000485502  unclonable  0.00000000140954  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4378  CDS  NC_013161  4527308  4527532  -  225  protein of unknown function UPF0150  YP_003139998  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4379  CDS  NC_013161  4527548  4527772  -  225  YcfA family protein  YP_003139999  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4380  CDS  NC_013161  4527765  4527992  -  228  protein of unknown function UPF0150  YP_003140000  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4381  CDS  NC_013161  4528093  4528542  -  450  hypothetical protein  YP_003140001  unclonable  0.000000786451  unclonable  0.00000000200322  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4382  CDS  NC_013161  4528849  4532841  +  3993  magnesium chelatase subunit H  YP_003140002  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4383  CDS  NC_013161  4532901  4533245  +  345  hypothetical protein  YP_003140003  normal  0.307645  unclonable  0.00000000287618  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4384  CDS  NC_013161  4533242  4533451  +  210  hypothetical protein  YP_003140004  normal  0.635735  unclonable  0.00000000254877  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_4591  CDS  NC_013163  6533  7483  -  951  integrase family protein  YP_003142307  unclonable  0.00000000427706  n/a    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>