67 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Cyan7425_0266  CDS  NC_011884  68344  69024  +  681  protein of unknown function DUF820  YP_002481022  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0288  CDS  NC_011884  89856  93674  +  3819  replicative DNA helicase  YP_002481043  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0631  CDS  NC_011884  436554  437198  +  645  hypothetical protein  YP_002481380  unclonable  0.000000769552  normal  0.221346  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0632  CDS  NC_011884  437290  437916  +  627  acyltransferase, putative  YP_002481381  unclonable  0.000000552746  normal  0.226749  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0633  CDS  NC_011884  437863  438414  -  552  transposase  YP_002481382  unclonable  0.000000452222  normal  0.45297  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0634  CDS  NC_011884  438428  438808  -  381  transposase  YP_002481383  unclonable  0.000000359175  normal  0.423888  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0861  CDS  NC_011884  682304  683836  +  1533  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  YP_002481608  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1004  CDS  NC_011884  820997  821611  -  615  30S ribosomal protein S4  YP_002481751  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1068  CDS  NC_011884  886341  887141  -  801  transposase IS4 family protein  YP_002481815  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1069  CDS  NC_011884  887607  889583  +  1977  Carbohydrate-selective porin OprB  YP_002481816  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1251  CDS  NC_011884  1090397  1091047  -  651  Methyltransferase type 11  YP_002481991  unclonable  0.000000494899  normal  0.377886  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1252  CDS  NC_011884  1091227  1091970  +  744  protein of unknown function DUF820  YP_002481992  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1416  CDS  NC_011884  1249745  1250362  -  618  protein of unknown function UPF0016  YP_002482150  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1471  CDS  NC_011884  1311262  1311894  +  633  protein of unknown function DUF552  YP_002482202  unclonable  0.000000569683  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1497  CDS  NC_011884  1333565  1335634  -  2070  ABC-1 domain protein  YP_002482228  unclonable  0.0000360105  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1498  CDS  NC_011884  1335841  1336923  -  1083  photosystem q(b) protein  YP_002482229  unclonable  0.00000298258  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1575  CDS  NC_011884  1420359  1422413  -  2055  histidine kinase  YP_002482306  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1717  CDS  NC_011884  1557128  1559347  +  2220  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  YP_002482447  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1734  CDS  NC_011884  1577055  1578089  -  1035  rod shape-determining protein MreB  YP_002482464  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1888  CDS  NC_011884  1773541  1775076  +  1536  Peptidase M23  YP_002482616  unclonable  0.00000847553  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2214  CDS  NC_011884  2128191  2130122  -  1932  S-layer domain protein  YP_002482936  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2265  CDS  NC_011884  2186514  2187077  -  564  hypothetical protein  YP_002482986  unclonable  0.000000761756  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2266  CDS  NC_011884  2187092  2187745  -  654  hypothetical protein  YP_002482987  unclonable  0.00000094113  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2433  CDS  NC_011884  2380435  2381193  -  759  hypothetical protein  YP_002483152  unclonable  0.000001996  hitchhiker  0.000000966182  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2434  CDS  NC_011884  2381321  2382349  -  1029  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  YP_002483153  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2435  CDS  NC_011884  2382932  2383954  +  1023  transport system permease protein  YP_002483154  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2436  CDS  NC_011884  2383951  2384985  +  1035  transport system permease protein  YP_002483155  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2437  CDS  NC_011884  2385104  2386918  +  1815  ABC transporter related  YP_002483156  normal  1  unclonable  0.000000000799452  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2620  CDS  NC_011884  2573135  2573632  +  498  hypothetical protein  YP_002483336  unclonable  0.00000113889  normal  0.730297  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2621  CDS  NC_011884  2573725  2574873  -  1149  integrase family protein  YP_002483337  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2704  CDS  NC_011884  2655525  2656568  +  1044  hypothetical protein  YP_002483412  unclonable  0.0000017343  hitchhiker  0.00000000244824  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2705  CDS  NC_011884  2656603  2657229  -  627  Peptidase M23  YP_002483413  unclonable  0.00000078524  unclonable  0.0000000000857144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2706  CDS  NC_011884  2657397  2658314  -  918  histone deacetylase superfamily  YP_002483414  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2707  CDS  NC_011884  2658453  2659826  -  1374  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  YP_002483415  normal  0.0226952  unclonable  0.000000000187188  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3125  CDS  NC_011884  3102471  3102698  +  228  hypothetical protein  YP_002483814  unclonable  0.000000355537  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3126  CDS  NC_011884  3102753  3102905  +  153  hypothetical protein  YP_002483815  unclonable  0.000000338135  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3127  CDS  NC_011884  3102988  3103728  +  741  hypothetical protein  YP_002483816  unclonable  0.00000122169  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3128  CDS  NC_011884  3103958  3104317  +  360  hypothetical protein  YP_002483817  unclonable  0.000000642433  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3129  CDS  NC_011884  3104646  3105062  +  417  hypothetical protein  YP_002483818  unclonable  0.00000078524  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3130  CDS  NC_011884  3105149  3105310  +  162  hypothetical protein  YP_002483819  unclonable  0.000000494899  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3131  CDS  NC_011884  3105322  3105804  +  483  hypothetical protein  YP_002483820  unclonable  0.000000970145  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3195  CDS  NC_011884  3158032  3161409  -  3378  adenine specific DNA methyltransferase  YP_002483884  unclonable  0.000607783  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3263  CDS  NC_011884  3225749  3225877  -  129  hypothetical protein  YP_002483951  unclonable  0.000000434411  normal  0.477079  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3447  CDS  NC_011884  3399050  3399988  -  939  hypothetical protein  YP_002484132  unclonable  0.000000913149  unclonable  0.000000000279403  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3448  CDS  NC_011884  3400039  3400641  -  603  protein of unknown function DUF820  YP_002484133  hitchhiker  0.00000860534  unclonable  0.000000000224185  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3649  CDS  NC_011884  3624403  3625626  +  1224  4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase  YP_002484330  unclonable  0.0000025402  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3650  CDS  NC_011884  3625751  3627031  +  1281  carboxyl-terminal protease  YP_002484331  unclonable  0.00000241587  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4006  CDS  NC_011884  4038867  4039358  -  492  hypothetical protein  YP_002484681  unclonable  0.000000739108  unclonable  0.000000000131837  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4007  CDS  NC_011884  4039348  4040217  -  870  hypothetical protein  YP_002484682  unclonable  0.00000201643  unclonable  0.00000000014722  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4008  CDS  NC_011884  4040239  4040634  -  396  hypothetical protein  YP_002484683  hitchhiker  0.00151752  unclonable  0.000000000120446  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4131  CDS  NC_011884  4179068  4179805  +  738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  YP_002484806  unclonable  0.00000103032  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4132  CDS  NC_011884  4179922  4181187  +  1266  S-adenosylmethionine synthetase  YP_002484807  unclonable  0.00000371992  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4240  CDS  NC_011884  4296366  4297370  -  1005  phosphoribulokinase  YP_002484914  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4241  CDS  NC_011884  4297580  4298815  -  1236  domain of unknown function DUF1745  YP_002484915  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4247  CDS  NC_011884  4302428  4304317  +  1890  S-layer domain protein  YP_002484921  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4400  CDS  NC_011884  4467567  4467932  -  366  hypothetical protein  YP_002485071  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4429  CDS  NC_011884  4502101  4503042  +  942  phosphoribulokinase  YP_002485100  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4514  CDS  NC_011884  4590865  4592208  -  1344  carboxyl-terminal protease  YP_002485185  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4519  CDS  NC_011884  4596028  4598472  -  2445  protein of unknown function DUF608  YP_002485190  unclonable  0.0000699051  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4643  CDS  NC_011884  4725251  4726381  -  1131  glycosyl transferase group 1  YP_002485310  unclonable  0.0000017343  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4644  CDS  NC_011884  4726625  4727023  -  399  hypothetical protein  YP_002485311  unclonable  0.000000290983  normal  1  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4754  CDS  NC_011884  4841592  4841804  -  213  hypothetical protein  YP_002485420  hitchhiker  0.00159897  unclonable  0.000000000312004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4755  CDS  NC_011884  4842135  4842944  +  810  hypothetical protein  YP_002485421  unclonable  0.00000267092  unclonable  0.000000000355384  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4756  CDS  NC_011884  4843938  4844138  +  201  hypothetical protein  YP_002485422  normal  0.0124756  unclonable  0.000000000208991  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4789  CDS  NC_011884  4873557  4877138  -  3582  WD-40 repeat protein  YP_002485454  unclonable  0.00121677  normal  0.726129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4822  CDS  NC_011884  4908325  4909407  -  1083  Squalene/phytoene synthase  YP_002485487  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_5093  CDS  NC_011884  5186081  5186617  +  537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  YP_002485748  unclonable  0.00000078524  normal  0.0403651  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>