31 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bmul_0197  CDS  NC_010084  220876  221289  +  414  hypothetical protein  YP_001578389  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0198  CDS  NC_010084  221426  222010  +  585  phosphoheptose isomerase  YP_001578390  normal  0.435023  unclonable  0.00000000000588239  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0199  CDS  NC_010084  222028  222825  +  798  transport-associated protein  YP_001578391  normal  0.89233  unclonable  0.00000000000748386  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0200  CDS  NC_010084  222822  223193  +  372  cytochrome c class I  YP_001578392  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0201  CDS  NC_010084  223429  224826  -  1398  glucarate dehydratase  YP_001578393  normal  0.203534  unclonable  0.0000000000115228  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0202  CDS  NC_010084  224885  226225  -  1341  d-galactonate transporter  YP_001578394  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0203  CDS  NC_010084  226516  227151  +  636  hypothetical protein  YP_001578395  normal  0.847024  unclonable  0.00000000000631089  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0204  CDS  NC_010084  227176  228342  -  1167  hypothetical protein  YP_001578396  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0205  CDS  NC_010084  228353  229507  -  1155  hypothetical protein  YP_001578397  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0206  CDS  NC_010084  229529  230227  -  699  ABC transporter related  YP_001578398  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0207  CDS  NC_010084  230229  231431  -  1203  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001578399  normal  1  unclonable  0.0000000000100142  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0208  CDS  NC_010084  231742  232008  +  267  hypothetical protein  YP_001578400  normal  0.423236  unclonable  0.00000000000582295  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0209  CDS  NC_010084  232083  232823  -  741  hypothetical protein  YP_001578401  normal  0.121486  unclonable  0.00000000000711775  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0210  CDS  NC_010084  232938  233807  +  870  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  YP_001578402  normal  0.0476258  unclonable  0.00000000000787005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0211  CDS  NC_010084  233884  234522  +  639  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001578403  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0212  CDS  NC_010084  234598  235881  -  1284  major facilitator transporter  YP_001578404  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0213  CDS  NC_010084  235979  236908  +  930  LysR family transcriptional regulator  YP_001578405  hitchhiker  0.0000000000718825  unclonable  0.0000000000104245  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0214  CDS  NC_010084  237122  237955  -  834  OmpW family protein  YP_001578406  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0215  CDS  NC_010084  237971  239218  -  1248  hypothetical protein  YP_001578407  hitchhiker  0.000119575  unclonable  0.0000000000118774  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0216  CDS  NC_010084  239359  240792  -  1434  hypothetical protein  YP_001578408  normal  0.0142102  unclonable  0.0000000000138018  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_2204  CDS  NC_010084  2421137  2421460  +  324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001580386  unclonable  0.0000000000000766618  normal  0.357698  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_2831  CDS  NC_010084  3083990  3085186  -  1197  cell division protein FtsZ  YP_001581012  unclonable  0.0000000000122218  normal  1  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_2850  CDS  NC_010084  3114012  3114788  -  777  enoyl-CoA hydratase  YP_001581031  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_3143  CDS  NC_010084  3435272  3436885  -  1614  glutamate--cysteine ligase  YP_001581324  normal  1  unclonable  0.00000000000827615  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_3144  CDS  NC_010084  3437179  3438150  -  972  alcohol dehydrogenase  YP_001581325  hitchhiker  0.000700738  unclonable  0.00000000000553722  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_3145  CDS  NC_010084  3438147  3439244  -  1098  AraC family transcriptional regulator  YP_001581326  hitchhiker  0.0000000198948  unclonable  0.00000000000612342  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_3146  CDS  NC_010084  3439623  3440036  +  414  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001581327  unclonable  0.0000000000000451164  unclonable  0.00000000000414135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_3165  CDS  NC_010086  9304  9771  -  468  hypothetical protein  YP_001583141  unclonable  1.04223e-16  normal  0.925717  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_R0003  tRNA  NC_010084  223294  223369  +  76  tRNA-Ala    normal  0.245807  unclonable  0.00000000000471702  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_R0019  rRNA  NC_010084  1155520  1157045  +  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  0.0000000000989523  normal  1  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_R0028  tRNA  NC_010084  1342121  1342196  +  76  tRNA-Ala    unclonable  0.0000000000000054137  normal  0.608945  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>