105 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ccel_0164  CDS  NC_011898  187761  188000  -  240  transcriptional regulator, AbrB family  YP_002504532  unclonable  0.000000000069654  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0165  CDS  NC_011898  188368  188955  +  588  nucleoside recognition domain protein  YP_002504533  unclonable  0.000000000554794  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0369  CDS  NC_011898  420696  420959  +  264  hypothetical protein  YP_002504734  unclonable  0.000000000090387  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0438  CDS  NC_011898  501546  503537  -  1992  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  YP_002504800  unclonable  0.000000530778  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0442  CDS  NC_011898  507604  508362  +  759  30S ribosomal protein S2  YP_002504804  unclonable  0.00000000051714  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0450  CDS  NC_011898  513835  515121  +  1287  membrane-associated zinc metalloprotease  YP_002504812  unclonable  0.0000000160258  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0499  CDS  NC_011898  576490  580260  +  3771  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  YP_002504861  unclonable  0.000277776  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0500  CDS  NC_011898  580364  581164  +  801  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  YP_002504862  unclonable  0.00000000106724  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0501  CDS  NC_011898  581303  582103  +  801  hypothetical protein  YP_002504863  unclonable  0.00000000120399  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0513  CDS  NC_011898  592543  593412  -  870  Patatin  YP_002504875  unclonable  0.000000000855028  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0527  CDS  NC_011898  613548  615188  +  1641  SpoIID/LytB domain protein  YP_002504889  unclonable  0.0000000920143  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0528  CDS  NC_011898  615248  616612  -  1365  aspartate kinase  YP_002504890  unclonable  0.0000000180899  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0536  CDS  NC_011898  622362  623687  +  1326  protein-export membrane protein SecD  YP_002504898  unclonable  0.0000000245038  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0597  CDS  NC_011898  689346  689816  +  471  protein of unknown function DUF552  YP_002504958  unclonable  0.000000000329372  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0623  CDS  NC_011898  719243  721087  +  1845  hypothetical protein  YP_002504984  unclonable  0.000000504443  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0699  CDS  NC_011898  807801  809684  +  1884  amino acid transporter-like protein  YP_002505058  unclonable  0.000000494308  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0709  CDS  NC_011898  820611  821957  +  1347  signal recognition particle protein  YP_002505068  unclonable  0.0000000338232  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0739  CDS  NC_011898  860434  862464  +  2031  cellulosome protein dockerin type I  YP_002505097  unclonable  0.000000588173  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0746  CDS  NC_011898  869844  872291  +  2448  copper-translocating P-type ATPase  YP_002505104  unclonable  0.0000116614  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0749  CDS  NC_011898  874457  876088  +  1632  hydroxylamine reductase  YP_002505107  unclonable  0.000000113817  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0750  CDS  NC_011898  876246  877142  +  897  glycoside hydrolase family 11  YP_002505108  unclonable  0.00000000169346  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0794  CDS  NC_011898  915262  915696  +  435  50S ribosomal protein L13  YP_002505152  unclonable  0.000000000346357  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0830  CDS  NC_011898  950124  950450  +  327  SH3 type 3 domain protein  YP_002505187  unclonable  0.000000000124614  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0831  CDS  NC_011898  950550  950801  +  252  hypothetical protein  YP_002505188  unclonable  0.0000000000754763  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0832  CDS  NC_011898  950810  951505  +  696  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  YP_002505189  unclonable  0.000000000773006  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0845  CDS  NC_011898  963262  964020  -  759  Resolvase domain protein  YP_002505200  unclonable  0.000000000678199  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0846  CDS  NC_011898  964057  965040  +  984  hypothetical protein  YP_002505201  unclonable  0.00000000277763  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0897  CDS  NC_011898  1074607  1075968  +  1362  MATE efflux family protein  YP_002505249  unclonable  0.0000000262958  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0906  CDS  NC_011898  1083822  1084859  +  1038  hypothetical protein  YP_002505258  unclonable  0.0000000136327  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1034  CDS  NC_011898  1287008  1287955  +  948  transcriptional regulator, DeoR family  YP_002505376  unclonable  0.00000000316866  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1074  CDS  NC_011898  1328304  1329032  +  729  transcriptional regulator, GntR family  YP_002505413  unclonable  0.00000000120399  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1147  CDS  NC_011898  1410226  1411071  -  846  Bacitracin resistance protein BacA  YP_002505484  unclonable  0.00000000333302  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1238  CDS  NC_011898  1522660  1526028  +  3369  Carbohydrate binding family 6  YP_002505574  unclonable  0.000137164  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1239  CDS  NC_011898  1526092  1529139  +  3048  Carbohydrate binding family 6  YP_002505575  unclonable  0.0000298242  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1249  CDS  NC_011898  1546692  1548752  +  2061  glycoside hydrolase family 9  YP_002505585  unclonable  0.00000227885  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1277  CDS  NC_011898  1580898  1581779  +  882  porphobilinogen deaminase  YP_002505613  unclonable  0.00000000211617  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1298  CDS  NC_011898  1602832  1604265  +  1434  glycoside hydrolase family 8  YP_002505633  unclonable  0.0000000471564  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1335  CDS  NC_011898  1634247  1634501  +  255  hypothetical protein  YP_002505669  unclonable  0.0000000000547457  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1373  CDS  NC_011898  1670929  1672866  +  1938  threonyl-tRNA synthetase  YP_002505707  unclonable  0.000000340223  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1374  CDS  NC_011898  1672973  1673401  +  429  hypothetical protein  YP_002505708  unclonable  0.000000000310104  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1375  CDS  NC_011898  1673504  1674103  -  600  hypothetical protein  YP_002505709  unclonable  0.000000000863864  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1376  CDS  NC_011898  1674323  1676107  +  1785  S-layer domain protein  YP_002505710  unclonable  0.000000547431  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1384  CDS  NC_011898  1682919  1684475  +  1557  ABC transporter related  YP_002505718  unclonable  0.0000000721481  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1399  CDS  NC_011898  1699847  1702033  +  2187  DNA gyrase/topoisomerase IV subunit A  YP_002505733  unclonable  0.00000271013  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1462  CDS  NC_011898  1776537  1776962  +  426  thioesterase superfamily protein  YP_002505796  unclonable  0.000000000224992  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1463  CDS  NC_011898  1777067  1777630  +  564  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  YP_002505797  unclonable  0.00000000060117  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1643  CDS  NC_011898  1979837  1980799  -  963  inner-membrane translocator  YP_002505974  unclonable  0.00000000313624  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1898  CDS  NC_011898  2254559  2255419  -  861  ATP-NAD/AcoX kinase  YP_002506226  unclonable  0.00000000307238  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1981  CDS  NC_011898  2344037  2345404  +  1368  MATE efflux family protein  YP_002506309  unclonable  0.0000000219259  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2064  CDS  NC_011898  2422211  2423353  -  1143  cell division protein FtsZ  YP_002506390  unclonable  0.0000000128315  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2065  CDS  NC_011898  2423511  2424755  -  1245  cell division protein FtsA  YP_002506391  unclonable  0.0000000182823  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2078  CDS  NC_011898  2437671  2437940  -  270  Coat F domain protein  YP_002506403  unclonable  0.0000000000495082  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2079  CDS  NC_011898  2437953  2438150  -  198  hypothetical protein  YP_002506404  unclonable  0.0000000000318495  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2080  CDS  NC_011898  2438409  2439752  +  1344  potassium uptake protein, TrkH family  YP_002506405  unclonable  0.0000000161963  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2119  CDS  NC_011898  2483235  2486063  -  2829  excinuclease ABC, A subunit  YP_002506444  unclonable  0.0000168396  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2135  CDS  NC_011898  2501237  2501734  -  498  protein of unknown function DUF177  YP_002506459  unclonable  0.000000000607383  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2136  CDS  NC_011898  2501858  2503051  -  1194  acetate kinase  YP_002506460  unclonable  0.0000000219259  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2222  CDS  NC_011898  2597164  2598099  -  936  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  YP_002506544  unclonable  0.000000000908669  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2358  CDS  NC_011898  2778025  2779227  -  1203  Ig domain protein group 2 domain protein  YP_002506672  unclonable  0.0000000103831  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2364  CDS  NC_011898  2784217  2788482  -  4266  S-layer domain protein  YP_002506677  unclonable  0.00153299  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2421  CDS  NC_011898  2923432  2923989  -  558  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  YP_002506731  unclonable  0.000000000812868  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2422  CDS  NC_011898  2924003  2924845  -  843  fumarate hydratase  YP_002506732  unclonable  0.00000000432763  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2423  CDS  NC_011898  2925069  2925452  +  384  UspA domain protein  YP_002506733  unclonable  0.000000000266759  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2442  CDS  NC_011898  2943945  2946557  -  2613  cellulosome protein dockerin type I  YP_002506751  unclonable  0.0000150479  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2453  CDS  NC_011898  2962883  2964721  -  1839  histidine kinase  YP_002506762  unclonable  0.000000429093  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2545  CDS  NC_011898  3069973  3071367  -  1395  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  YP_002506853  unclonable  0.000000029955  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2558  CDS  NC_011898  3079822  3080622  -  801  septum site-determining protein MinD  YP_002506866  unclonable  0.00000000169346  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2789  CDS  NC_011898  3348169  3349281  -  1113  hypothetical protein  YP_002507067  unclonable  0.00000000791032  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2790  CDS  NC_011898  3349531  3349932  +  402  transcriptional regulator, XRE family  YP_002507068  unclonable  0.000000000203467  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2791  CDS  NC_011898  3349983  3350129  -  147  hypothetical protein  YP_002507069  unclonable  0.0000000000510303  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2792  CDS  NC_011898  3350158  3350967  -  810  hypothetical protein  YP_002507070  unclonable  0.00000000154726  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2796  CDS  NC_011898  3353039  3354250  -  1212  hypothetical protein  YP_002507073  unclonable  0.0000000182823  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2797  CDS  NC_011898  3354392  3354706  -  315  hypothetical protein  YP_002507074  unclonable  0.0000000000922388  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2852  CDS  NC_011898  3405055  3405807  -  753  AntA/AntB antirepressor domain protein  YP_002507126  unclonable  0.00000000203262  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2859  CDS  NC_011898  3411221  3412357  -  1137  hypothetical protein  YP_002507133  unclonable  0.00000000759798  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2860  CDS  NC_011898  3412350  3412673  -  324  rRNA biogenesis protein rrp5, putative  YP_002507134  unclonable  0.000000000122113  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2866  CDS  NC_011898  3416249  3417448  +  1200  Restriction endonuclease MspI  YP_002507140  unclonable  0.0000000194297  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2867  CDS  NC_011898  3417503  3418753  -  1251  DNA-cytosine methyltransferase  YP_002507141  unclonable  0.00000000939229  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2900  CDS  NC_011898  3456381  3457259  -  879  Hsp33 protein  YP_002507174  unclonable  0.00000000174602  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2901  CDS  NC_011898  3457410  3457610  -  201  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_002507175  unclonable  0.0000000000581473  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2921  CDS  NC_011898  3479544  3480287  +  744  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  YP_002507195  unclonable  0.000000000890425  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2940  CDS  NC_011898  3499733  3500530  +  798  NLP/P60 protein  YP_002507214  unclonable  0.00000000104581  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2941  CDS  NC_011898  3500650  3501402  +  753  cell wall hydrolase/autolysin  YP_002507215  unclonable  0.00000000101461  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2997  CDS  NC_011898  3547922  3549310  -  1389  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002507271  unclonable  0.0000000366828  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3080  CDS  NC_011898  3617834  3618268  -  435  RNA binding S1 domain protein  YP_002507352  unclonable  0.000000000220475  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3081  CDS  NC_011898  3618389  3618667  -  279  Septum formation initiator  YP_002507353  unclonable  0.000000000112692  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3122  CDS  NC_011898  3658714  3659283  -  570  hypothetical protein  YP_002507393  unclonable  0.000000000402523  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3185  CDS  NC_011898  3716111  3717286  -  1176  aminotransferase class I and II  YP_002507455  unclonable  0.0000000114817  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3186  CDS  NC_011898  3717532  3718464  +  933  cysteine synthase A  YP_002507456  unclonable  0.00000000213805  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3189  CDS  NC_011898  3720031  3721068  +  1038  biotin synthase  YP_002507459  unclonable  0.00000000310414  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3190  CDS  NC_011898  3721141  3721512  -  372  protein of unknown function DUF1696  YP_002507460  unclonable  0.0000000000611457  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3227  CDS  NC_011898  3765304  3765996  -  693  RelA/SpoT domain protein  YP_002507497  unclonable  0.0000000011111  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3231  CDS  NC_011898  3769904  3770458  -  555  BioY protein  YP_002507501  unclonable  0.000000000266759  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3232  CDS  NC_011898  3770592  3771866  -  1275  hypothetical protein  YP_002507502  unclonable  0.0000000180899  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3318  CDS  NC_011898  3860960  3862231  +  1272  integrase family protein  YP_002507587  unclonable  0.00000001885  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3319  CDS  NC_011898  3862595  3863239  -  645  RNA polymerase factor sigma-70  YP_002507588  unclonable  0.000000000496723  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3332  CDS  NC_011898  3875484  3876764  -  1281  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  YP_002507601  unclonable  0.0000000160258  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3398  CDS  NC_011898  3942231  3945155  -  2925  hypothetical protein  YP_002507666  unclonable  0.0000354514  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3399  CDS  NC_011898  3945454  3948297  -  2844  hypothetical protein  YP_002507667  unclonable  0.0000280168  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3421  CDS  NC_011898  3975550  3976770  +  1221  peptidase M14 carboxypeptidase A  YP_002507689  unclonable  0.0000000158618  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>