17 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Swit_1539  CDS  NC_009511  1711586  1713793  +  2208  TonB-dependent receptor  YP_001262040  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_1656  CDS  NC_009511  1841254  1843548  -  2295  TonB-dependent receptor  YP_001262157  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_2180  CDS  NC_009511  2443984  2444475  -  492  hypothetical protein  YP_001262677  normal  0.0163358  unclonable  0.000000274139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_2181  CDS  NC_009511  2444536  2445246  -  711  hypothetical protein  YP_001262678  normal  0.104271  unclonable  0.000000288247  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_2182  CDS  NC_009511  2445406  2446089  -  684  hypothetical protein  YP_001262679  normal  0.181107  unclonable  0.00000029708  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_2183  CDS  NC_009511  2446153  2446428  +  276  plasmid maintenance system killer  YP_001262680  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3044  CDS  NC_009511  3339647  3341974  -  2328  TonB-dependent receptor  YP_001263532  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3045  CDS  NC_009511  3342080  3343882  -  1803  monooxygenase, FAD-binding  YP_001263533  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3046  CDS  NC_009511  3343931  3344827  -  897  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001263534  normal  0.0342349  unclonable  0.000000641858  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3047  CDS  NC_009511  3344880  3345716  -  837  phytanoyl-CoA dioxygenase  YP_001263535  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3256  CDS  NC_009511  3584104  3586296  -  2193  TonB-dependent receptor  YP_001263740  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3312  CDS  NC_009511  3641267  3643621  -  2355  TonB-dependent receptor  YP_001263796  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3313  CDS  NC_009511  3643741  3644550  -  810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001263797  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3314  CDS  NC_009511  3644559  3646973  -  2415  TonB-dependent receptor  YP_001263798  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3471  CDS  NC_009511  3816688  3817311  +  624  hypothetical protein  YP_001263955  unclonable  0.0000000000000150109  unclonable  0.000000661648  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3472  CDS  NC_009511  3817319  3818386  +  1068  hypothetical protein  YP_001263956  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4173  CDS  NC_009511  4590627  4592918  +  2292  TonB-dependent receptor  YP_001264651  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>