24 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bphy_0567  CDS  NC_010622  642761  642967  -  207  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001856804  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_1855  CDS  NC_010622  2120192  2120809  +  618  ATP dependent DNA ligase  YP_001858080  unclonable  0.000000000084113  hitchhiker  0.0000000000000191097  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_1856  CDS  NC_010622  2120849  2121064  +  216  YcfA family protein  YP_001858081  unclonable  0.0000000000114921  unclonable  3.10223e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_1857  CDS  NC_010622  2121120  2121536  +  417  hypothetical protein  YP_001858082  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_1858  CDS  NC_010622  2121909  2122289  -  381  hypothetical protein  YP_001858083  hitchhiker  0.00000000572747  unclonable  3.75184e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_2582  CDS  NC_010622  2904069  2917223  -  13155  YadA domain-containing protein  YP_001858800  normal  1  unclonable  0.0000000000293422  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_2668  CDS  NC_010622  3009423  3010616  -  1194  cell division protein FtsZ  YP_001858886  unclonable  0.000000000509241  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_2875  CDS  NC_010622  3229618  3230565  +  948  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  YP_001859093  hitchhiker  0.0000000550108  unclonable  0.00000000000000426492  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_2876  CDS  NC_010622  3231130  3231786  -  657  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001859094  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3089  CDS  NC_010622  3468600  3469013  +  414  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001859303  hitchhiker  0.00000000507937  unclonable  0.00000000000000144798  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3370  CDS  NC_010623  307971  308936  +  966  hypothetical protein  YP_001859570  unclonable  0.000000000701469  unclonable  2.10555e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3371  CDS  NC_010623  308936  309595  +  660  hypothetical protein  YP_001859571  hitchhiker  0.0000316339  unclonable  1.45401e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3372  CDS  NC_010623  309684  310010  +  327  hypothetical protein  YP_001859572  hitchhiker  0.000709587  unclonable  1.05543e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3373  CDS  NC_010623  310206  310604  +  399  hypothetical protein  YP_001859573  hitchhiker  0.00189147  unclonable  1.30239e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3374  CDS  NC_010623  310622  311032  +  411  antirestriction protein  YP_001859574  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3375  CDS  NC_010623  311041  311256  +  216  hypothetical protein  YP_001859575  hitchhiker  0.00112074  unclonable  1.09864e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3984  CDS  NC_010623  961370  961702  +  333  hypothetical protein  YP_001860153  unclonable  0.0000000000163101  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_6047  CDS  NC_010625  590554  592149  +  1596  levansucrase  YP_001862155  unclonable  0.0000000164133  hitchhiker  0.00000266409  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_6642  CDS  NC_010625  1235820  1236980  -  1161  porin  YP_001862716  unclonable  0.000000000730188  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7133  CDS  NC_010625  1788988  1790667  +  1680  hypothetical protein  YP_001863180  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7187  CDS  NC_010625  1839683  1839958  +  276  hypothetical protein  YP_001863234  unclonable  0.00000000000770139  normal  0.990213  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_R0047  tRNA  NC_010622  1544904  1544979  -  76  tRNA-Glu    unclonable  0.00000000000669443  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_R0048  tRNA  NC_010622  1545046  1545122  -  77  tRNA-Asp    unclonable  0.00000000000611669  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_R0049  tRNA  NC_010622  1545199  1545274  -  76  tRNA-Glu    unclonable  0.00000000000656103  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>