39 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Sare_0001  CDS  NC_009953  148  1923  +  1776  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001534928  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0002  CDS  NC_009953  2705  3838  +  1134  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001534929  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0003  CDS  NC_009953  3877  4749  +  873  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_001534930  hitchhiker  0.00595784  unclonable  0.0000000131137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0004  CDS  NC_009953  4766  5896  +  1131  recombination protein F  YP_001534931  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0005  CDS  NC_009953  5889  6494  +  606  hypothetical protein  YP_001534932  normal  1  unclonable  0.0000000127236  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0006  CDS  NC_009953  6485  7066  -  582  hypothetical protein  YP_001534933  normal  1  unclonable  0.000000014647  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1148  CDS  NC_009953  1298597  1299283  -  687  IclR family transcriptional regulator  YP_001536047  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1149  CDS  NC_009953  1299333  1300778  +  1446  isopropylmalate isomerase large subunit  YP_001536048  normal  1  unclonable  0.0000000597548  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1150  CDS  NC_009953  1300794  1301381  +  588  isopropylmalate isomerase small subunit  YP_001536049  normal  1  unclonable  0.0000000354633  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1151  CDS  NC_009953  1301554  1302183  +  630  histone family protein DNA-binding protein  YP_001536050  normal  1  unclonable  0.0000000347409  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1152  CDS  NC_009953  1302306  1303196  -  891  NUDIX hydrolase  YP_001536051  normal  1  unclonable  0.0000000396101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1153  CDS  NC_009953  1303338  1305647  -  2310  polyphosphate kinase  YP_001536052  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1154  CDS  NC_009953  1305701  1305898  -  198  hypothetical protein  YP_001536053  normal  0.212488  unclonable  0.0000000275653  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1155  CDS  NC_009953  1305909  1306553  -  645  hypothetical protein  YP_001536054  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1156  CDS  NC_009953  1306689  1307414  +  726  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_001536055  normal  0.255381  unclonable  0.0000000437844  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1157  CDS  NC_009953  1307411  1308409  +  999  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  YP_001536056  normal  0.0724883  unclonable  0.0000000465009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1158  CDS  NC_009953  1308406  1309527  +  1122  cystathionine gamma-lyase  YP_001536057  normal  0.0760832  unclonable  0.0000000519282  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1159  CDS  NC_009953  1309721  1309921  -  201  hypothetical protein  YP_001536058  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1160  CDS  NC_009953  1309926  1310771  -  846  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001536059  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1161  CDS  NC_009953  1311055  1311273  +  219  hypothetical protein  YP_001536060  normal  0.462417  unclonable  0.0000000347409  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1162  CDS  NC_009953  1311600  1312682  +  1083  D-alanine--D-alanine ligase  YP_001536061  normal  1  unclonable  0.0000000524603  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1163  CDS  NC_009953  1312757  1313431  -  675  hypothetical protein  YP_001536062  normal  1  unclonable  0.000000032705  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1164  CDS  NC_009953  1313441  1313674  -  234  AsnC family transcriptional regulator  YP_001536063  normal  1  unclonable  0.0000000232378  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1165  CDS  NC_009953  1313771  1314724  +  954  thiamine monophosphate kinase  YP_001536064  normal  1  unclonable  0.0000000347409  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1166  CDS  NC_009953  1314753  1315220  +  468  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001536065  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1167  CDS  NC_009953  1315307  1315498  -  192  50S ribosomal protein L28  YP_001536066  normal  0.422025  unclonable  0.0000000208051  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_3343  CDS  NC_009953  3858662  3862942  +  4281  hypothetical protein  YP_001538137  unclonable  0.00184093  hitchhiker  0.000724597  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5101  CDS  NC_009953  5775454  5776767  +  1314  GntR family transcriptional regulator  YP_001539834  normal  1  unclonable  0.0000000307944  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5102  CDS  NC_009953  5776775  5777758  +  984  D-alanine--D-alanine ligase  YP_001539835  normal  0.842129  unclonable  0.0000000223224  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5103  CDS  NC_009953  5777927  5778796  -  870  hypothetical protein  YP_001539836  normal  1  unclonable  0.0000000237165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5104  CDS  NC_009953  5779538  5780545  -  1008  parB-like partition protein  YP_001539837  normal  1  unclonable  0.0000000234759  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5105  CDS  NC_009953  5780573  5781886  -  1314  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001539838  normal  1  unclonable  0.0000000298727  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5106  CDS  NC_009953  5782298  5783026  -  729  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_001539839  normal  1  unclonable  0.0000000203893  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5107  CDS  NC_009953  5783115  5783702  -  588  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  YP_001539840  normal  1  unclonable  0.000000018818  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5108  CDS  NC_009953  5783902  5784918  -  1017  60 kDa inner membrane insertion protein  YP_001539841  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5109  CDS  NC_009953  5784922  5785209  -  288  hypothetical protein  YP_001539842  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5110  CDS  NC_009953  5785206  5785610  -  405  ribonuclease P protein component  YP_001539843  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5111  CDS  NC_009953  5785647  5785784  -  138  50S ribosomal protein L34  YP_001539844  normal  0.0480023  unclonable  0.0000000124693  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_R0023  tRNA  NC_009953  1298413  1298485  +  73  tRNA-Glu    normal  0.294422  unclonable  0.0000000304821  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>