33 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Tmel_0001  CDS  NC_009616  162  1475  +  1314  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001305268  unclonable  0.000000928481  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0002  CDS  NC_009616  1517  1699  +  183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001305269  unclonable  0.00000000942879  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0024  CDS  NC_009616  25504  27960  -  2457  ATPase  YP_001305289  unclonable  0.0000951044  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0142  CDS  NC_009616  151944  153473  -  1530  abortive infection protein  YP_001305404  unclonable  0.00000324505  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0143  CDS  NC_009616  153522  153917  -  396  hypothetical protein  YP_001305405  unclonable  0.0000000333578  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0144  CDS  NC_009616  154175  155788  -  1614  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001305406  unclonable  0.00000389108  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0176  CDS  NC_009616  187844  188875  -  1032  S-layer domain-containing protein  YP_001305438  unclonable  0.000000342894  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0278  CDS  NC_009616  287418  287615  -  198  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001305535  unclonable  0.0000000141015  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0504  CDS  NC_009616  538026  538568  -  543  50S ribosomal protein L10  YP_001305756  unclonable  0.0000000340487  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0564  CDS  NC_009616  598091  599914  -  1824  extracellular solute-binding protein  YP_001305816  unclonable  0.000010438  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0565  CDS  NC_009616  600064  600618  +  555  putative methyltransferase  YP_001305817  unclonable  0.0000000647034  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0566  CDS  NC_009616  600586  601356  -  771  ornithine carbamoyltransferase  YP_001305818  unclonable  0.000000138704  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0828  CDS  NC_009616  868442  869527  -  1086  permease  YP_001306074  unclonable  0.000000427926  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0829  CDS  NC_009616  869604  869867  -  264  regulatory protein, ArsR  YP_001306075  unclonable  0.0000000111816  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0830  CDS  NC_009616  869976  871313  +  1338  MATE efflux family protein  YP_001306076  unclonable  0.000000918772  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0953  CDS  NC_009616  988633  989250  +  618  50S ribosomal protein L3  YP_001306199  unclonable  0.0000000660439  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_0954  CDS  NC_009616  989288  989953  +  666  50S ribosomal protein L4  YP_001306200  unclonable  0.000000111144  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1080  CDS  NC_009616  1104588  1104920  +  333  hypothetical protein  YP_001306325  unclonable  0.0000000117667  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1118  CDS  NC_009616  1144401  1144946  -  546  hypothetical protein  YP_001306358  unclonable  0.0000000479092  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1166  CDS  NC_009616  1187403  1187774  +  372  RNA-binding S1 domain-containing protein  YP_001306406  unclonable  0.0000000391852  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1188  CDS  NC_009616  1207476  1208975  +  1500  extracellular solute-binding protein  YP_001306427  unclonable  0.0000019193  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1416  CDS  NC_009616  1416318  1417421  +  1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  YP_001306648  unclonable  0.000000679599  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1585  CDS  NC_009616  1573288  1574511  +  1224  Beta-ketoacyl synthase-like protein  YP_001306814  unclonable  0.000000659177  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1586  CDS  NC_009616  1574514  1574921  +  408  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  YP_001306815  unclonable  0.0000000239696  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1758  CDS  NC_009616  1746374  1747339  -  966  peptidase M23B  YP_001306982  unclonable  0.000000326005  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1759  CDS  NC_009616  1747336  1748421  -  1086  small GTP-binding protein  YP_001306983  unclonable  0.000000555556  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1806  CDS  NC_009616  1789010  1790317  -  1308  signal recognition particle protein  YP_001307026  unclonable  0.0000012194  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1837  CDS  NC_009616  1820001  1822139  -  2139  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  YP_001307057  unclonable  0.0000332783  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1849  CDS  NC_009616  1834363  1836207  -  1845  extracellular solute-binding protein  YP_001307069  unclonable  0.0000095247  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_1850  CDS  NC_009616  1836312  1836806  -  495  hypothetical protein  YP_001307070  unclonable  0.0000000464698  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_R0043  tRNA  NC_009616  679120  679206  +  87  tRNA-Tyr    unclonable  0.0000000118909  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_R0050  tRNA  NC_009616  961018  961092  +  75  tRNA-Glu    unclonable  0.00000000933029  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Tmel_R0051  tRNA  NC_009616  961096  961170  +  75  tRNA-Arg    unclonable  0.000000011528  n/a    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>