15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PputW619_0656  CDS  NC_010501  713519  714433  -  915  histone deacetylase superfamily protein  YP_001747530  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_0685  CDS  NC_010501  755884  757008  -  1125  hypothetical protein  YP_001747559  unclonable  0.00000000242198  unclonable  0.0000000000000118124  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_0686  CDS  NC_010501  757539  758519  -  981  phage integrase  YP_001747560  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_1265  CDS  NC_010501  1404930  1405370  +  441  hypothetical protein  YP_001748139  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_1763  CDS  NC_010501  1960750  1961001  -  252  outer membrane lipoprotein OprI  YP_001748636  unclonable  0.0000000000737751  unclonable  0.0000000000000115764  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_3224  CDS  NC_010501  3558972  3559892  +  921  LysR family transcriptional regulator  YP_001750083  unclonable  0.00000000148321  normal  0.133263  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4030  CDS  NC_010501  4453691  4454758  -  1068  recombinase A  YP_001750879  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4031  CDS  NC_010501  4454862  4455344  -  483  CinA domain-containing protein  YP_001750880  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4032  CDS  NC_010501  4455428  4455904  -  477  phage protein  YP_001750881  normal  0.188318  unclonable  0.0000000000000276525  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4033  CDS  NC_010501  4455901  4456449  -  549  glycoside hydrolase family protein  YP_001750882  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4034  CDS  NC_010501  4456477  4457511  -  1035  late control D family protein  YP_001750883  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4035  CDS  NC_010501  4457516  4457722  -  207  tail X family protein  YP_001750884  normal  0.743163  unclonable  0.0000000000000167658  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4571  CDS  NC_010501  5047999  5048685  +  687  short chain dehydrogenase  YP_001751420  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_4844  CDS  NC_010501  5342413  5343300  +  888  transporter DMT superfamily protein  YP_001751689  unclonable  0.000000000446481  normal  1  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
PputW619_5117  CDS  NC_010501  5676048  5677574  -  1527  transcriptional regulator  YP_001751962  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219  Pseudomonas putida W619  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>