15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pisl_0205  CDS  NC_008701  194309  195508  +  1200  hydrogenase formation HypD protein  YP_929730  unclonable  0.0000000749019  normal  0.0529868  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0206  CDS  NC_008701  195510  195857  +  348  hypothetical protein  YP_929731  unclonable  0.00000000527651  normal  0.0573438  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0474  CDS  NC_008701  445354  446358  -  1005  inner-membrane translocator  YP_929995  unclonable  0.000000132511  normal  1  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0624  CDS  NC_008701  572542  572772  +  231  hypothetical protein  YP_930145  unclonable  0.0000000136501  hitchhiker  0.000000147655  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0625  CDS  NC_008701  572797  574569  +  1773  putative ATPase RIL  YP_930146  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0626  CDS  NC_008701  574572  575039  +  468  hypothetical protein  YP_930147  unclonable  0.0000000162031  hitchhiker  0.000000457675  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0627  CDS  NC_008701  575032  575487  +  456  hypothetical protein  YP_930148  unclonable  0.0000000160341  hitchhiker  0.000000430067  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0628  CDS  NC_008701  575469  576095  +  627  hypothetical protein  YP_930149  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0638  CDS  NC_008701  582204  583850  +  1647  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_930159  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1024  CDS  NC_008701  923999  925210  +  1212  FAD dependent oxidoreductase  YP_930541  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1025  CDS  NC_008701  925207  925374  +  168  hypothetical protein  YP_930542  decreased coverage  0.00000152486  unclonable  2.33838e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1026  CDS  NC_008701  925430  926578  +  1149  succinyl-CoA synthetase subunit beta  YP_930543  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1245  CDS  NC_008701  1129330  1133043  +  3714  reverse gyrase  YP_930753  unclonable  0.000744005  normal  1  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1506  CDS  NC_008701  1374604  1375911  +  1308  sulfatase  YP_931005  unclonable  0.00000053867  normal  0.747943  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1507  CDS  NC_008701  1376110  1376295  +  186  hypothetical protein  YP_931006  unclonable  0.0000000139327  normal  0.569122  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>