62 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Fnod_0027    NC_009718  31579  32766  -  1188      unclonable  0.000000000714263  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0028  CDS  NC_009718  33078  33278  +  201  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001409557  unclonable  0.00000000000670362  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0046  CDS  NC_009718  48483  49520  +  1038  chemotaxis-specific methylesterase  YP_001409574  unclonable  0.000000000324346  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0113  CDS  NC_009718  115724  116263  +  540  pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase, gamma subunit  YP_001409637  unclonable  0.0000000000876196  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0114  CDS  NC_009718  116470  117618  +  1149  hypothetical protein  YP_001409638  unclonable  0.00000000105969  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0115  CDS  NC_009718  117717  118502  -  786  hypothetical protein  YP_001409639  unclonable  0.000000000160092  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0157  CDS  NC_009718  158176  161511  +  3336  permease YjgP/YjgQ family protein  YP_001409681  unclonable  0.0000684055  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0439  CDS  NC_009718  477028  477288  +  261  stage V sporulation protein S  YP_001409961  unclonable  0.0000000000158934  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0466  CDS  NC_009718  503082  503495  +  414  ferric uptake regulator family protein  YP_001409988  unclonable  0.0000000000190383  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0467  CDS  NC_009718  503597  504100  +  504  rubrerythrin  YP_001409989  unclonable  0.0000000000249666  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0468  CDS  NC_009718  504145  504501  +  357  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  YP_001409990  unclonable  0.0000000000114138  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0469  CDS  NC_009718  504573  505268  -  696  hypothetical protein  YP_001409991  unclonable  0.0000000000429599  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0550  CDS  NC_009718  607557  608732  -  1176  glycosyl transferase family protein  YP_001410070  unclonable  0.00000000102779  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0551  CDS  NC_009718  608846  610069  +  1224  major facilitator transporter  YP_001410071  unclonable  0.00000000114988  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0552  CDS  NC_009718  610105  610335  +  231  hypothetical protein  YP_001410072  unclonable  0.00000000000576672  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0553  CDS  NC_009718  610416  611738  -  1323  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_001410073  unclonable  0.00000000105969  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0574  CDS  NC_009718  635508  635912  -  405  hypothetical protein  YP_001410090  unclonable  0.0000000000404361  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0598  CDS  NC_009718  665999  667282  -  1284  major facilitator transporter  YP_001410110  unclonable  0.00000000170409  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0599  CDS  NC_009718  667466  668494  +  1029  peptidase M42 family protein  YP_001410111  unclonable  0.00000000044001  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0625  CDS  NC_009718  689547  690425  -  879  cytochrome b5  YP_001410137  unclonable  0.000000000173616  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0626  CDS  NC_009718  690704  691930  +  1227  extracellular solute-binding protein  YP_001410138  unclonable  0.000000000892518  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0676  CDS  NC_009718  737441  738646  +  1206  major facilitator transporter  YP_001410188  unclonable  0.0000000012095  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0735  CDS  NC_009718  798356  799390  -  1035  transcription elongation factor NusA  YP_001410247  unclonable  0.000000000302084  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0736  CDS  NC_009718  799431  799889  -  459  hypothetical protein  YP_001410248  unclonable  0.0000000000239746  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0740  CDS  NC_009718  802790  803788  -  999  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  YP_001410252  unclonable  0.000000000397695  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0741  CDS  NC_009718  804109  805053  +  945  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  YP_001410253  unclonable  0.000000000278551  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0781  CDS  NC_009718  858832  860019  -  1188  extracellular solute-binding protein  YP_001410291  unclonable  0.000000000729506  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0835  CDS  NC_009718  913832  914371  +  540  hypothetical protein  YP_001410345  unclonable  0.0000000000635204  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0884  CDS  NC_009718  957804  959540  -  1737  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  YP_001410393  unclonable  0.000000022902  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0950  CDS  NC_009718  1038417  1039529  +  1113  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_001410457  unclonable  0.000000000351749  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0951  CDS  NC_009718  1039513  1041000  +  1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  YP_001410458  unclonable  0.00000000274042  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1007  CDS  NC_009718  1102616  1103977  -  1362  protease Do  YP_001410514  unclonable  0.00000000215082  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1008  CDS  NC_009718  1104257  1105336  +  1080  TPR repeat-containing protein  YP_001410515  unclonable  0.000000000389173  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1055  CDS  NC_009718  1150278  1151045  +  768  hypothetical protein  YP_001410561  unclonable  0.000000000305289  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1134  CDS  NC_009718  1221126  1221413  -  288  30S ribosomal protein S19  YP_001410638  unclonable  0.00000000000887938  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1135  CDS  NC_009718  1221430  1222257  -  828  50S ribosomal protein L2  YP_001410639  unclonable  0.0000000000903374  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1136  CDS  NC_009718  1222271  1222573  -  303  ribosomal protein L25/L23  YP_001410640  unclonable  0.00000000000719358  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1137  CDS  NC_009718  1222570  1223241  -  672  50S ribosomal protein L4  YP_001410641  unclonable  0.0000000000824266  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1138  CDS  NC_009718  1223349  1223972  -  624  50S ribosomal protein L3  YP_001410642  unclonable  0.0000000000858376  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1139  CDS  NC_009718  1223993  1224301  -  309  30S ribosomal protein S10  YP_001410643  unclonable  0.0000000000305109  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1140  CDS  NC_009718  1224401  1225603  -  1203  elongation factor Tu  YP_001410644  unclonable  0.0000000019246  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1141  CDS  NC_009718  1225673  1227748  -  2076  elongation factor G  YP_001410645  unclonable  0.000000161111  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1142  CDS  NC_009718  1227802  1228269  -  468  30S ribosomal protein S7  YP_001410646  unclonable  0.0000000000563067  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1143  CDS  NC_009718  1228285  1228689  -  405  30S ribosomal protein S12  YP_001410647  unclonable  0.0000000000369356  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1208  CDS  NC_009718  1299403  1300395  -  993  cell envelope-related transcriptional attenuator  YP_001410712  unclonable  0.000000000721845  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1209  CDS  NC_009718  1300507  1302297  -  1791  molecular chaperone DnaK  YP_001410713  unclonable  0.0000000215559  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1238  CDS  NC_009718  1335468  1336247  +  780  30S ribosomal protein S2  YP_001410742  unclonable  0.000000000341164  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1265  CDS  NC_009718  1364471  1369030  -  4560  type II and III secretion system protein  YP_001410769  unclonable  0.00244048  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1468  CDS  NC_009718  1592010  1593119  +  1110  extracellular ligand-binding receptor  YP_001410968  unclonable  0.000000000538626  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1490  CDS  NC_009718  1618319  1619038  -  720  two component transcriptional regulator  YP_001410990  unclonable  0.000000000120928  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1525  CDS  NC_009718  1654000  1656777  +  2778  excinuclease ABC subunit A  YP_001411025  unclonable  0.00000267289  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1724  CDS  NC_009718  1879706  1881031  +  1326  S-layer domain-containing protein  YP_001411216  unclonable  0.00000000217367  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1725  CDS  NC_009718  1881183  1882532  +  1350  hypothetical protein  YP_001411217  unclonable  0.00000000146424  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1726  CDS  NC_009718  1882696  1883991  -  1296  phosphopyruvate hydratase  YP_001411218  unclonable  0.00000000127224  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1729  CDS  NC_009718  1887297  1889144  +  1848  extracellular solute-binding protein  YP_001411221  unclonable  0.0000000266848  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1730  CDS  NC_009718  1889271  1889540  +  270  CopG/DNA-binding domain-containing protein  YP_001411222  unclonable  0.0000000000142301  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1731  CDS  NC_009718  1889527  1889967  +  441  PilT domain-containing protein  YP_001411223  unclonable  0.0000000000308343  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1732  CDS  NC_009718  1890025  1890225  -  201  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001411224  unclonable  0.0000000000101176  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1733  CDS  NC_009718  1890385  1891062  +  678  HhH-GPD family protein  YP_001411225  unclonable  0.000000000108213  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1762  CDS  NC_009718  1917465  1918559  +  1095  peptide chain release factor 2  YP_001411252  unclonable  0.000000000512072  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_R0024  tRNA  NC_009718  926951  927037  -  87  tRNA-Tyr    unclonable  0.00000000000291994  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_R0025  tRNA  NC_009718  927069  927144  -  76  tRNA-Thr    unclonable  0.0000000000025626  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>