68 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CCV52592_0003  CDS  NC_009715  1646451  1647977  -  1527  flavocytochrome c flavin subunit  YP_001408896  unclonable  0.00000666036  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0045  CDS  NC_009715  1859231  1859500  -  270  hypothetical protein  YP_001409098  unclonable  0.0000000740111  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0100  CDS  NC_009715  119367  119879  -  513  N-terminal methylation domain-containing protein  YP_001407421  unclonable  0.000000252609  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0285  CDS  NC_009715  1301421  1302143  -  723  hypothetical protein  YP_001408560  unclonable  0.000000517518  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0329  CDS  NC_009715  90831  91349  +  519  translation initiation factor IF-3  YP_001407385  unclonable  0.000000359846  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0355  CDS  NC_009715  1532956  1535667  -  2712  translation initiation factor IF-2  YP_001408785  unclonable  0.000123126  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0370  CDS  NC_009715  1521005  1521709  -  705  flagellar biosynthesis sigma factor  YP_001408770  unclonable  0.000000182906  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0376  CDS  NC_009715  304580  305071  +  492  flavodoxin FldA  YP_001407592  unclonable  0.000000140694  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0433  CDS  NC_009715  1693059  1694999  -  1941  fumarate hydratase class II (fumarase C)  YP_001408939  unclonable  0.000013758  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0438  CDS  NC_009715  654052  655347  -  1296  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  YP_001407923  unclonable  0.00000382192  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0551    NC_009715  1713148  1713606  -  459      unclonable  0.0000000971364  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0735    NC_009715  108000  108842  +  843      unclonable  0.000000410197  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0815  CDS  NC_009715  198590  199603  +  1014  iron ABC transporter, solute-binding protein  YP_001407490  unclonable  0.00000212424  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0923  CDS  NC_009715  1422180  1422611  +  432  TerC protein  YP_001408673  unclonable  0.000000173903  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0924  CDS  NC_009715  1422611  1423078  +  468  hypothetical protein  YP_001408674  unclonable  0.000000155714  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1001  CDS  NC_009715  1911396  1912559  +  1164  aminotransferase, class II  YP_001409172  unclonable  0.00000156908  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1002  CDS  NC_009715  1879954  1881252  -  1299  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  YP_001409125  unclonable  0.00000228048  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1032  CDS  NC_009715  1896052  1896630  -  579  50S ribosomal protein L3  YP_001409153  unclonable  0.000000312086  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1038  CDS  NC_009715  342302  343777  +  1476  hydrogenase-4 component F  YP_001407622  unclonable  0.00000418597  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1044  CDS  NC_009715  374689  376149  +  1461  phosphoglyceromutase  YP_001407650  unclonable  0.00000497143  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1077  CDS  NC_009715  974339  979492  -  5154  alpha-2-macroglobulin family protein  YP_001408245  unclonable  0.0094392  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1100    NC_009715  1001057  1002892  +  1836      unclonable  0.0000178966  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1101  CDS  NC_009715  1537264  1538148  -  885  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001408787  unclonable  0.000000321898  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1173  CDS  NC_009715  468936  470672  +  1737  alpha/beta hydrolase fold  YP_001407745  unclonable  0.0000196015  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1223  CDS  NC_009715  419382  420719  +  1338  UDP-glucose 6-dehydrogenase  YP_001407697  unclonable  0.00000260089  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1250  CDS  NC_009715  392770  393645  -  876  putative nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase  YP_001407671  unclonable  0.000000986216  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1262  CDS  NC_009715  382786  383655  +  870  30S ribosomal protein S2  YP_001407659  unclonable  0.000000765471  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1274    NC_009715  865587  868607  +  3021      unclonable  0.000243392  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1311  CDS  NC_009715  1913644  1914570  -  927  para-aminobenzoate synthase component I  YP_001409175  unclonable  0.000000482298  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1312  CDS  NC_009715  1914761  1915411  -  651  superoxide dismutase (Fe)  YP_001409176  unclonable  0.00000018669  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1321  CDS  NC_009715  305273  306814  +  1542  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  YP_001407593  unclonable  0.00000477414  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1334  CDS  NC_009715  680966  681535  -  570  YceI  YP_001407955  unclonable  0.00000025527  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1354  CDS  NC_009715  516868  517986  -  1119  trap-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, periplasmic component  YP_001407794  unclonable  0.00000150608  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1362  CDS  NC_009715  796144  797190  +  1047  L-asparaginase II  YP_001408080  unclonable  0.00000230453  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1422  CDS  NC_009715  851559  852770  +  1212  threonine dehydratase  YP_001408134  unclonable  0.00000212424  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1439  CDS  NC_009715  1519905  1521005  -  1101  flagellar motor switch protein FliM  YP_001408769  unclonable  0.000000909071  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1480  CDS  NC_009715  119976  120896  -  921  permeases of the drug/metabolite transporter  YP_001407422  unclonable  0.00000101724  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1549  CDS  NC_009715  181346  182716  +  1371  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  YP_001407479  unclonable  0.00000282303  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1551  CDS  NC_009715  182729  183346  +  618  transcription regulator protein  YP_001407480  unclonable  0.000000200418  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1645  CDS  NC_009715  352138  354459  +  2322  signal transduction protein  YP_001407632  unclonable  0.000104597  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1651  CDS  NC_009715  1642348  1642863  -  516  hypothetical protein  YP_001408892  unclonable  0.000000147979  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1757  CDS  NC_009715  1540559  1542838  +  2280  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  YP_001408790  unclonable  0.0000442418  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1758  CDS  NC_009715  1908701  1909453  -  753  hook assembly protein, flagella  YP_001409168  unclonable  0.000000345404  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1776  CDS  NC_009715  183606  184745  +  1140  CmeA  YP_001407481  unclonable  0.00000125677  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1787  CDS  NC_009715  1648103  1649008  +  906  LysR family transcriptional regulator  YP_001408897  unclonable  0.000000671509  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1818  CDS  NC_009715  1187178  1188554  -  1377  sodium-dependent transporter  YP_001408448  unclonable  0.00000435894  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1861  CDS  NC_009715  1143908  1145530  +  1623  sodium/hydrogen exchanger family protein  YP_001408404  unclonable  0.000013758  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1864    NC_009715  1003002  1004180  +  1179      unclonable  0.00000192115  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1904  CDS  NC_009715  1040997  1043573  -  2577  chaperone ClpB 1  YP_001408297  unclonable  0.0000835524  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1905  CDS  NC_009715  381043  381258  +  216  acetyltransferase  YP_001407657  unclonable  0.0000000747904  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1906  CDS  NC_009715  380314  381015  +  702  hypothetical protein  YP_001407656  unclonable  0.000000349044  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1941  CDS  NC_009715  1423089  1423631  +  543  SCO1/SenC family protein  YP_001408675  unclonable  0.000000240174  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2015  CDS  NC_009715  40089  40226  -  138  hypothetical protein  YP_001407342  unclonable  0.000000075578  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2086  CDS  NC_009715  1943670  1945667  -  1998  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001409208  unclonable  0.0000285057  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2107  CDS  NC_009715  1929630  1932281  +  2652  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  YP_001409193  unclonable  0.000158508  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2123  CDS  NC_009715  1915632  1916624  +  993  C4-dicarboxylate-binding periplasmic protein  YP_001409177  unclonable  0.000000773537  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2131  CDS  NC_009715  91452  91922  +  471  diamine acetyltransferase 2  YP_001407386  unclonable  0.000000287953  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2144    NC_009715  381331  382095  +  765      unclonable  0.000000422893  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2145  CDS  NC_009715  382134  382694  +  561  Sel1 repeat-containing protein  YP_001407658  unclonable  0.00000020662  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2147  CDS  NC_009715  511408  511875  +  468  ferric uptake regulation protein  YP_001407788  unclonable  0.000000154091  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2150  CDS  NC_009715  567315  567935  +  621  acetyltransferase  YP_001407840  unclonable  0.000000318542  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2152  CDS  NC_009715  666472  666735  -  264  hypothetical protein  YP_001407937  unclonable  0.0000000643116  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2224  CDS  NC_009715  1538208  1539578  -  1371  peptidase M23B  YP_001408788  unclonable  0.00000268272  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2225  CDS  NC_009715  1539637  1540467  -  831  prephenate dehydrogenase  YP_001408789  unclonable  0.000000370984  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2236  CDS  NC_009715  1896649  1897029  -  381  30S ribosomal protein S10  YP_001409154  unclonable  0.000000196356  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2238  CDS  NC_009715  1909484  1909660  +  177  hypothetical protein  YP_001409169  unclonable  0.0000000457534  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2239  CDS  NC_009715  1909613  1910386  -  774  flagellar hook protein FlgE  YP_001409170  unclonable  0.000000435982  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2240  CDS  NC_009715  1910521  1911357  +  837  hypothetical protein  YP_001409171  unclonable  0.000000449475  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>