83 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
SaurJH9_0025  CDS  NC_009487  34548  35804  +  1257  hypothetical protein  YP_001245415  unclonable  0.000000509485  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0102  CDS  NC_009487  121392  122384  -  993  periplasmic binding protein  YP_001245485  unclonable  0.00000014163  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0413  CDS  NC_009487  448656  448952  +  297  30S ribosomal protein S6  YP_001245795  unclonable  0.00000000259691  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0414  CDS  NC_009487  448973  449476  +  504  single-strand binding protein  YP_001245796  unclonable  0.00000000719074  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0432  CDS  NC_009487  463592  464548  -  957  hypothetical protein  YP_001245813  unclonable  0.0000000781133  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0480  CDS  NC_009487  513410  514750  +  1341  sodium:neurotransmitter symporter  YP_001245860  unclonable  0.000000696171  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0483  CDS  NC_009487  517299  518327  +  1029  ABC transporter related  YP_001245863  unclonable  0.000000112326  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0519  CDS  NC_009487  561551  561853  +  303  regulatory protein SpoVG  YP_001245899  unclonable  0.0000000118808  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0530  CDS  NC_009487  573358  573759  +  402  hypothetical protein  YP_001245910  unclonable  0.00000000417558  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0816  CDS  NC_009487  897320  898006  +  687  micrococcal nuclease  YP_001246194  unclonable  0.0000000405887  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0943  CDS  NC_009487  988146  989462  +  1317  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_001246320  unclonable  0.000000851242  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0983  CDS  NC_009487  1035242  1036486  +  1245  Beta-ketoacyl synthase-like protein  YP_001246360  unclonable  0.000000162972  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1084  CDS  NC_009487  1127580  1128149  -  570  ComK family protein  YP_001246461  unclonable  0.0000000107464  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1085  CDS  NC_009487  1128359  1128577  +  219  hypothetical protein  YP_001246462  unclonable  0.00000000125015  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1086  CDS  NC_009487  1128658  1129644  -  987  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  YP_001246463  unclonable  0.0000000389692  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1090    NC_009487  1131654  1131935  +  282      unclonable  0.00000000324392  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1091  CDS  NC_009487  1131979  1133943  +  1965  bacteriocin-associated integral membrane protein  YP_001246467  unclonable  0.00000631297  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1092  CDS  NC_009487  1133946  1134266  +  321  hypothetical protein  YP_001246468  unclonable  0.00000000515862  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1093  CDS  NC_009487  1134263  1134904  +  642  ABC transporter related  YP_001246469  unclonable  0.0000000270909  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1094  CDS  NC_009487  1134992  1135282  -  291  hypothetical protein  YP_001246470  unclonable  0.00000000594224  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1095  CDS  NC_009487  1135423  1135560  +  138  hypothetical protein  YP_001246471  unclonable  0.00000000290295  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1096  CDS  NC_009487  1135649  1136005  -  357  DoxX family protein  YP_001246472  unclonable  0.00000000704586  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1107  CDS  NC_009487  1146289  1147317  -  1029  glutamyl endopeptidase  YP_001246483  unclonable  0.000000076539  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1112  CDS  NC_009487  1150984  1154730  -  3747  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase., mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  YP_001246488  unclonable  0.00229916  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1186  CDS  NC_009487  1228272  1228829  +  558  hypothetical protein  YP_001246562  unclonable  0.0000000152824  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1187  CDS  NC_009487  1228909  1229082  +  174  50S ribosomal protein L32  YP_001246563  unclonable  0.00000000373536  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1188  CDS  NC_009487  1229236  1231173  -  1938  cell wall anchor domain-containing protein  YP_001246564  unclonable  0.00000565327  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1189  CDS  NC_009487  1231376  1232428  -  1053  cell wall anchor domain-containing protein  YP_001246565  unclonable  0.000000110062  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1190  CDS  NC_009487  1232637  1233320  +  684  NEAr transporter  YP_001246566  unclonable  0.000000019644  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1244  CDS  NC_009487  1288915  1290327  +  1413  cell division protein FtsA  YP_001246620  unclonable  0.000000360396  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1245  CDS  NC_009487  1290360  1291532  +  1173  cell division protein FtsZ  YP_001246621  unclonable  0.000000130693  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1296  CDS  NC_009487  1346884  1348251  +  1368  signal recognition particle protein  YP_001246671  unclonable  0.000000399025  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1297  CDS  NC_009487  1348686  1348961  +  276  30S ribosomal protein S16  YP_001246672  unclonable  0.0000000043058  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1298  CDS  NC_009487  1349149  1349652  +  504  16S rRNA-processing protein RimM  YP_001246673  unclonable  0.0000000105261  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1299  CDS  NC_009487  1349652  1350389  +  738  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001246674  unclonable  0.0000000315088  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1300  CDS  NC_009487  1350492  1350842  +  351  50S ribosomal protein L19  YP_001246675  unclonable  0.00000000348159  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1301  CDS  NC_009487  1351086  1353692  -  2607  membrane protein-like protein  YP_001246676  unclonable  0.0000816869  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1315  CDS  NC_009487  1368659  1369432  +  774  transcriptional repressor CodY  YP_001246688  unclonable  0.000000018867  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1316  CDS  NC_009487  1369779  1370546  +  768  30S ribosomal protein S2  YP_001246689  unclonable  0.0000000315088  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1385  CDS  NC_009487  1445969  1446541  +  573  thermonuclease  YP_001246755  unclonable  0.0000000128794  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1386  CDS  NC_009487  1446686  1447540  -  855  hypothetical protein  YP_001246756  unclonable  0.0000000328183  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1394  CDS  NC_009487  1455022  1456476  -  1455  amino acid permease-associated region  YP_001246764  unclonable  0.00000062877  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1398  CDS  NC_009487  1459317  1460294  +  978  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  YP_001246768  unclonable  0.000000185799  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1684  CDS  NC_009487  1782401  1782823  -  423  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001247050  unclonable  0.00000000480817  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1687  CDS  NC_009487  1785577  1787343  -  1767  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001247053  unclonable  0.00000235097  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1739  CDS  NC_009487  1836860  1838353  -  1494  amino acid permease-associated region  YP_001247105  unclonable  0.000000499031  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1901  CDS  NC_009487  2025271  2025735  -  465  XRE family transcriptional regulator  YP_001247262  unclonable  0.0000000075621  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_1912  CDS  NC_009487  2035212  2036669  -  1458  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_001247273  unclonable  0.000000291813  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2053  CDS  NC_009487  2166852  2167094  -  243  hypothetical protein  YP_001247412  unclonable  0.00000000417558  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2054  CDS  NC_009487  2167258  2167974  +  717  putative phage repressor  YP_001247413  unclonable  0.000000034182  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2055  CDS  NC_009487  2167986  2168840  +  855  HIRAN  YP_001247414  unclonable  0.0000000678108  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2056  CDS  NC_009487  2168914  2169060  +  147  hypothetical protein  YP_001247415  unclonable  0.00000000392964  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2057  CDS  NC_009487  2169057  2169242  +  186  hypothetical protein  YP_001247416  unclonable  0.00000000542695  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2058  CDS  NC_009487  2169313  2169495  +  183  hypothetical protein  YP_001247417  unclonable  0.00000000537104  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2082  CDS  NC_009487  2194383  2195462  -  1080  hypothetical protein  YP_001247440  unclonable  0.000000100553  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2083  CDS  NC_009487  2195766  2196401  -  636  redox-sensing transcriptional repressor Rex  YP_001247441  unclonable  0.0000000159118  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2118  CDS  NC_009487  2242249  2243769  -  1521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_001247476  unclonable  0.000000739492  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2126  CDS  NC_009487  2250970  2251617  +  648  hypothetical protein  YP_001247484  unclonable  0.0000000279259  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2127  CDS  NC_009487  2252530  2253402  -  873  60 kDa inner membrane insertion protein  YP_001247485  unclonable  0.0000000805212  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2246  CDS  NC_009487  2390713  2391516  -  804  tRNA pseudouridine synthase A  YP_001247602  unclonable  0.0000000374145  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2274  CDS  NC_009487  2405647  2406480  -  834  50S ribosomal protein L2  YP_001247630  unclonable  0.0000000299614  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2275  CDS  NC_009487  2406513  2406788  -  276  50S ribosomal protein L23  YP_001247631  unclonable  0.00000000227953  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2276  CDS  NC_009487  2406788  2407411  -  624  50S ribosomal protein L4  YP_001247632  unclonable  0.000000009811  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2277  CDS  NC_009487  2407438  2408100  -  663  50S ribosomal protein L3  YP_001247633  unclonable  0.0000000105261  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2278  CDS  NC_009487  2408128  2408436  -  309  30S ribosomal protein S10  YP_001247634  unclonable  0.00000000204136  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2340  CDS  NC_009487  2471540  2472919  -  1380  amino acid permease-associated region  YP_001247696  unclonable  0.000000488972  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2341  CDS  NC_009487  2473199  2473555  +  357  hypothetical protein  YP_001247697  unclonable  0.00000000582251  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2403  CDS  NC_009487  2535093  2536535  -  1443  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  YP_001247759  unclonable  0.000000860113  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2404  CDS  NC_009487  2536718  2537101  +  384  hypothetical protein  YP_001247760  unclonable  0.0000000139622  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2427  CDS  NC_009487  2563401  2564225  -  825  formate/nitrite transporter  YP_001247782  unclonable  0.0000000401704  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2466  CDS  NC_009487  2603256  2605085  -  1830  hypothetical protein  YP_001247819  unclonable  0.00000341492  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2476  CDS  NC_009487  2615114  2615713  -  600  hypothetical protein  YP_001247829  unclonable  0.0000000134099  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2477  CDS  NC_009487  2615893  2617530  +  1638  amino acid permease-associated region  YP_001247830  unclonable  0.000000817564  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2483  CDS  NC_009487  2623946  2624212  -  267  addiction module antitoxin  YP_001247836  unclonable  0.00000000373536  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_2547  CDS  NC_009487  2695774  2696766  +  993  D-lactate dehydrogenase  YP_001247900  unclonable  0.0000000830333  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_R0010  tRNA  NC_009487  584986  585061  +  76  tRNA-Thr    unclonable  0.00000000409146  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_R0011  tRNA  NC_009487  585068  585140  +  73  tRNA-Lys    unclonable  0.00000000344573  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_R0012  tRNA  NC_009487  585174  585248  +  75  tRNA-Gly    unclonable  0.00000000311563  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_R0013  tRNA  NC_009487  585256  585344  +  89  tRNA-Leu    unclonable  0.00000000293316  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_R0014  tRNA  NC_009487  585350  585426  +  77  tRNA-Arg    unclonable  0.00000000281617  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_R0015  tRNA  NC_009487  585447  585520  +  74  tRNA-Pro    unclonable  0.00000000278716  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_R0016  tRNA  NC_009487  585544  585619  +  76  tRNA-Ala    unclonable  0.00000000267693  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_R0017  rRNA  NC_009487  585740  587294  +  1555  16S ribosomal RNA    unclonable  0.0000010305  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>