194 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Cphy_0020  CDS  NC_010001  33777  34718  +  942  RelA/SpoT domain-containing protein  YP_001557150  unclonable  0.00000000113301  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0109  CDS  NC_010001  146427  146708  +  282  SpoVG family protein  YP_001557237  unclonable  0.0000000000363253  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0110  CDS  NC_010001  147354  148388  +  1035  polysaccharide deacetylase  YP_001557238  unclonable  0.00000000182672  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0120  CDS  NC_010001  161160  161375  +  216  heavy metal transport/detoxification protein  YP_001557248  unclonable  0.0000000000378265  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0192  CDS  NC_010001  238298  240091  -  1794  ABC transporter related  YP_001557318  unclonable  0.00000020543  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0222  CDS  NC_010001  273457  275457  +  2001  UvrD/REP helicase  YP_001557348  unclonable  0.00000045018  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0223  CDS  NC_010001  275696  276031  -  336  hypothetical protein  YP_001557349  unclonable  0.0000000000612373  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0226  CDS  NC_010001  280345  282126  +  1782  hypothetical protein  YP_001557352  unclonable  0.0000000930043  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0235  CDS  NC_010001  291402  291824  +  423  30S ribosomal protein S12  YP_001557361  unclonable  0.0000000000397858  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0251  CDS  NC_010001  310038  310751  -  714  acyl-ACP thioesterase  YP_001557377  unclonable  0.000000000581314  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0277  CDS  NC_010001  345854  346531  +  678  hypothetical protein  YP_001557403  unclonable  0.000000000465928  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0282  CDS  NC_010001  350094  351305  +  1212  hypothetical protein  YP_001557408  unclonable  0.00000000783437  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0283  CDS  NC_010001  351565  352659  +  1095  hypothetical protein  YP_001557409  unclonable  0.00000000235038  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0325  CDS  NC_010001  404694  406298  -  1605  CTP synthetase  YP_001557451  unclonable  0.0000000736967  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0326  CDS  NC_010001  406898  408943  +  2046  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_001557452  unclonable  0.000000432409  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0369  CDS  NC_010001  470342  470923  +  582  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  YP_001557495  unclonable  0.0000000002351  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0370  CDS  NC_010001  470940  471434  +  495  phosphodiesterase  YP_001557496  unclonable  0.000000000132589  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0414  CDS  NC_010001  525835  526911  +  1077  peptide chain release factor 1  YP_001557540  unclonable  0.00000000401474  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0415  CDS  NC_010001  527112  528479  +  1368  H(+)-transporting two-sector ATPase  YP_001557541  unclonable  0.0000000197091  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0428  CDS  NC_010001  542541  544196  -  1656  hypothetical protein  YP_001557554  unclonable  0.0000000496305  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0429  CDS  NC_010001  544531  545874  -  1344  uracil-xanthine permease  YP_001557555  unclonable  0.0000000136785  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0442  CDS  NC_010001  562582  564438  +  1857  ABC transporter related  YP_001557568  unclonable  0.000000293437  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0443  CDS  NC_010001  564450  566216  +  1767  ABC transporter related  YP_001557569  unclonable  0.000000201252  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0444  CDS  NC_010001  566471  567052  +  582  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001557570  unclonable  0.000000000510063  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0498  CDS  NC_010001  638612  641344  -  2733  glycosyl transferase family protein  YP_001557624  unclonable  0.0000157387  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0624  CDS  NC_010001  810523  812793  +  2271  endo-1,4-beta-xylanase  YP_001557750  unclonable  0.00000271039  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0644  CDS  NC_010001  837749  837949  -  201  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001557770  unclonable  0.0000000000253244  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0651  CDS  NC_010001  848249  850870  +  2622  pyruvate phosphate dikinase  YP_001557777  unclonable  0.00000914255  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0664  CDS  NC_010001  866795  867769  +  975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001557790  unclonable  0.00000000161767  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0665  CDS  NC_010001  867787  868674  +  888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001557791  unclonable  0.00000000136095  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0715  CDS  NC_010001  926840  927283  +  444  hypothetical protein  YP_001557841  unclonable  0.000000000163777  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0730  CDS  NC_010001  944280  945086  -  807  AraC family transcriptional regulator  YP_001557856  unclonable  0.00000000385534  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0812  CDS  NC_010001  1038064  1040445  +  2382  extracellular solute-binding protein  YP_001557938  unclonable  0.00000378939  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0908  CDS  NC_010001  1161112  1161885  +  774  hypothetical protein  YP_001558032  unclonable  0.00000000100336  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0972  CDS  NC_010001  1240295  1240876  +  582  endopeptidase Clp  YP_001558093  unclonable  0.000000000265141  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0998  CDS  NC_010001  1262609  1263250  +  642  hypothetical protein  YP_001558117  unclonable  0.000000000763425  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1003  CDS  NC_010001  1267185  1268915  +  1731  FMN-binding domain-containing protein  YP_001558122  unclonable  0.000000126222  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1029  CDS  NC_010001  1301846  1303036  -  1191  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001558148  unclonable  0.00000000715077  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1057  CDS  NC_010001  1331318  1332256  +  939  ABC transporter related  YP_001558176  unclonable  0.000000000853274  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1064  CDS  NC_010001  1343506  1344645  -  1140  metallophosphoesterase  YP_001558183  unclonable  0.00000000589961  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1065  CDS  NC_010001  1344844  1345083  +  240  hypothetical protein  YP_001558184  unclonable  0.0000000000435652  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1066  CDS  NC_010001  1345519  1347243  +  1725  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_001558185  unclonable  0.000000104071  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1067  CDS  NC_010001  1348080  1349441  +  1362  MATE efflux family protein  YP_001558186  unclonable  0.0000000154468  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1172  CDS  NC_010001  1486134  1487822  +  1689  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001558289  unclonable  0.00000023446  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1252  CDS  NC_010001  1581246  1582583  +  1338  MATE efflux family protein  YP_001558369  unclonable  0.0000000131388  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1256  CDS  NC_010001  1586394  1587647  +  1254  hypothetical protein  YP_001558373  unclonable  0.00000000902575  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1269  CDS  NC_010001  1599234  1600040  +  807  hypothetical protein  YP_001558386  unclonable  0.000000000963526  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1274  CDS  NC_010001  1602923  1604707  +  1785  arginyl-tRNA synthetase  YP_001558391  unclonable  0.000000144018  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1291  CDS  NC_010001  1620273  1620806  +  534  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001558408  unclonable  0.000000000284437  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1318  CDS  NC_010001  1649861  1651192  -  1332  MATE efflux family protein  YP_001558434  unclonable  0.0000000101978  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1328  CDS  NC_010001  1660204  1660731  +  528  hypothetical protein  YP_001558444  unclonable  0.000000000416974  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1338  CDS  NC_010001  1672882  1673334  +  453  NUDIX hydrolase  YP_001558454  unclonable  0.0000000000650565  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1396  CDS  NC_010001  1739448  1740800  +  1353  sodium:dicarboxylate symporter  YP_001558510  unclonable  0.0000000220299  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1447  CDS  NC_010001  1787325  1788239  +  915  hypothetical protein  YP_001558560  unclonable  0.00000000141757  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1455  CDS  NC_010001  1795903  1797531  +  1629  hypothetical protein  YP_001558568  unclonable  0.0000000988618  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1461  CDS  NC_010001  1802168  1803382  -  1215  sodium:dicarboxylate symporter  YP_001558574  unclonable  0.00000000602347  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1498  CDS  NC_010001  1844555  1845838  +  1284  xanthine/uracil/vitamin C permease  YP_001558611  unclonable  0.00000000560897  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1546  CDS  NC_010001  1898594  1899421  -  828  AraC family transcriptional regulator  YP_001558659  unclonable  0.000000000827637  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1562  CDS  NC_010001  1919275  1920270  +  996  hypothetical protein  YP_001558675  unclonable  0.00000000188332  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1593  CDS  NC_010001  1963131  1964513  -  1383  MATE efflux family protein  YP_001558706  unclonable  0.0000000199125  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1594  CDS  NC_010001  1964825  1965385  +  561  hypothetical protein  YP_001558707  unclonable  0.000000000225825  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1595  CDS  NC_010001  1965566  1966474  +  909  hypothetical protein  YP_001558708  unclonable  0.00000000126668  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1596  CDS  NC_010001  1966899  1969457  +  2559  glycoside hydrolase family 3 protein  YP_001558709  unclonable  0.00000479393  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1614  CDS  NC_010001  1991341  1991967  +  627  glycosyl transferase family protein  YP_001558727  unclonable  0.000000000284437  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1730  CDS  NC_010001  2131517  2133430  +  1914  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_001558841  unclonable  0.00000040262  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1782  CDS  NC_010001  2196182  2197801  -  1620  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001558891  unclonable  0.0000000659316  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1783  CDS  NC_010001  2197991  2198899  +  909  MarR family transcriptional regulator  YP_001558892  unclonable  0.00000000134706  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1799  CDS  NC_010001  2214443  2216098  -  1656  glycoside hydrolase family protein  YP_001558907  unclonable  0.0000000760023  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1815  CDS  NC_010001  2241716  2244034  +  2319  leucine-rich repeat-containing protein  YP_001558923  unclonable  0.00000180506  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1816  CDS  NC_010001  2244708  2246063  +  1356  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  YP_001558924  unclonable  0.0000000187232  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1871  CDS  NC_010001  2300628  2301188  +  561  metallophosphoesterase  YP_001558979  unclonable  0.000000000170547  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1872  CDS  NC_010001  2301347  2302306  +  960  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  YP_001558980  unclonable  0.00000000152191  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1873  CDS  NC_010001  2302530  2305805  +  3276  carbohydrate-binding family 6 protein  YP_001558981  unclonable  0.00027012  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1879  CDS  NC_010001  2315244  2316557  +  1314  extracellular solute-binding protein  YP_001558987  unclonable  0.0000000146819  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1907  CDS  NC_010001  2350016  2351425  +  1410  major facilitator transporter  YP_001559015  unclonable  0.0000000193036  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1914  CDS  NC_010001  2361132  2362028  +  897  hypothetical protein  YP_001559022  unclonable  0.00000000138915  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1915  CDS  NC_010001  2362169  2364496  +  2328  AraC family transcriptional regulator  YP_001559023  unclonable  0.00000415573  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1976  CDS  NC_010001  2438851  2440587  -  1737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001559083  unclonable  0.000000151566  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2003  CDS  NC_010001  2471732  2472706  -  975  NLP/P60 protein  YP_001559110  unclonable  0.00000000114468  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2048  CDS  NC_010001  2528018  2528731  +  714  hypothetical protein  YP_001559155  unclonable  0.000000000587304  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2055  CDS  NC_010001  2537233  2538369  -  1137  lipoprotein  YP_001559162  unclonable  0.00000000385534  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2080  CDS  NC_010001  2566265  2567089  +  825  cell wall hydrolase/autolysin  YP_001559187  unclonable  0.000000000802973  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2148  CDS  NC_010001  2657890  2659413  +  1524  DNA-repair protein  YP_001559253  unclonable  0.0000000293029  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2208  CDS  NC_010001  2722427  2723719  -  1293  hypothetical protein  YP_001559313  unclonable  0.00000000512489  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2227  CDS  NC_010001  2747288  2748205  -  918  hypothetical protein  YP_001559331  unclonable  0.00000000184555  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2228  CDS  NC_010001  2748356  2749678  +  1323  transcriptional regulator  YP_001559332  unclonable  0.0000000116408  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2258  CDS  NC_010001  2781202  2783832  -  2631  cell wall hydrolase/autolysin  YP_001559360  unclonable  0.0000147959  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2285  CDS  NC_010001  2818734  2819411  -  678  orotate phosphoribosyltransferase  YP_001559385  unclonable  0.000000000547323  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2286  CDS  NC_010001  2819471  2820373  -  903  dihydroorotate dehydrogenase 1B  YP_001559386  unclonable  0.00000000160117  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2309  CDS  NC_010001  2845275  2846276  -  1002  ribosomal protein L11 methyltransferase  YP_001559409  unclonable  0.00000000281824  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2310  CDS  NC_010001  2846373  2847518  -  1146  chaperone protein DnaJ  YP_001559410  unclonable  0.00000000602347  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2318  CDS  NC_010001  2858396  2858659  +  264  30S ribosomal protein S20  YP_001559418  unclonable  0.0000000000431209  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2352  CDS  NC_010001  2904477  2905811  -  1335  aspartate kinase  YP_001559452  unclonable  0.00000000453597  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2408  CDS  NC_010001  2962791  2963036  -  246  30S ribosomal protein S16  YP_001559508  unclonable  0.0000000000382163  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2437  CDS  NC_010001  2990661  2992094  -  1434  propionyl-CoA carboxylase  YP_001559537  unclonable  0.0000000506601  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2438  CDS  NC_010001  2992459  2993100  -  642  regulatory protein RecX  YP_001559538  unclonable  0.00000000098324  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2439  CDS  NC_010001  2993104  2994147  -  1044  recA protein  YP_001559539  unclonable  0.00000000566681  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2440  CDS  NC_010001  2994740  2994916  +  177  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  YP_001559540  unclonable  0.0000000000802988  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2441  CDS  NC_010001  2995013  2996233  -  1221  threonine dehydratase  YP_001559541  unclonable  0.0000000148333  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2442  CDS  NC_010001  2996412  2997344  -  933  signal recognition particle-docking protein FtsY  YP_001559542  unclonable  0.00000000126668  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>