22 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BURPS1106A_0087  CDS  NC_009076  81137  82036  +  900  methionine sulfoxide reductase A  YP_001064372  unclonable  0.000549703  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0131  CDS  NC_009076  125590  126006  -  417  glyoxalase family protein  YP_001064416  unclonable  0.0000275668  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0475  CDS  NC_009076  439979  441694  +  1716  acetate permease  YP_001064758  unclonable  0.00592631  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0780  CDS  NC_009076  761194  762624  -  1431  cytochrome c family protein  YP_001065062  unclonable  0.00190536  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0961  CDS  NC_009076  941558  943168  +  1611  multicopper oxidase family protein  YP_001065242  unclonable  0.00373181  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_2016  CDS  NC_009076  1978941  1980155  +  1215  argininosuccinate synthase  YP_001066281  unclonable  0.000804601  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_2476  CDS  NC_009076  2429420  2430235  +  816  hypothetical protein  YP_001066735  unclonable  0.00018837  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_2875  CDS  NC_009076  2829472  2829795  +  324  putative ferredoxin  YP_001067122  unclonable  0.0000165492  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_2876  tRNA  NC_009076  2829904  2829979  +  76  tRNA-Asn    unclonable  0.00000608308  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_3007  CDS  NC_009076  2944615  2944818  -  204  cold-shock domain-contain protein  YP_001067250  unclonable  0.0000126299  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_3008  CDS  NC_009076  2945221  2945484  +  264  hypothetical protein  YP_001067251  unclonable  0.0000223422  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_3206  CDS  NC_009076  3123069  3124049  +  981  LysR family transcriptional regulator  YP_001067444  unclonable  0.000350263  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_3326  CDS  NC_009076  3249671  3250870  -  1200  flavohemoprotein  YP_001067563  unclonable  0.000871976  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_3570  CDS  NC_009076  3479506  3479622  -  117  hypothetical protein  YP_001067801  unclonable  0.00000889887  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_3572  CDS  NC_009076  3479919  3480032  +  114  hypothetical protein  YP_001067802  unclonable  0.00000758102  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_3859  CDS  NC_009076  3761285  3762223  -  939  LysR family transcriptional regulator  YP_001068080  unclonable  0.000387155  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_A0079  CDS  NC_009078  67360  67686  -  327  H-NS histone family protein  YP_001074122  unclonable  0.0000151227  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_A2173  CDS  NC_009078  2127590  2129362  -  1773  type IVB pilus formation outer membrane protein  YP_001076206  unclonable  0.00887816  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_A2745  CDS  NC_009078  2682332  2683894  -  1563  putative inner membrane glycosyl transferase  YP_001076775  unclonable  0.00354883  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_A2836  CDS  NC_009078  2779743  2780822  -  1080  ImpA-related N-terminal family protein  YP_001076865  unclonable  0.000685446  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_A2887  CDS  NC_009078  2823322  2823492  +  171  hypothetical protein  YP_001076916  unclonable  0.00000805092  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_A2888  CDS  NC_009078  2823739  2824239  -  501  hypothetical protein  YP_001076917  unclonable  0.0000473114  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>