15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pput_0074  CDS  NC_009512  80465  81250  786  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_001265433  unclonable  0.0000000000185774  normal  0.109161  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0178  CDS  NC_009512  183347  184567  1221  Formyl-CoA transferase  YP_001265537  unclonable  0.0000000000710796  normal  0.705206  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0335  CDS  NC_009512  382083  382910  828  hypothetical protein  YP_001265692  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0384  CDS  NC_009512  446377  447264  888  transporter DMT superfamily protein  YP_001265741  unclonable  0.0000000000682799  normal  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0469  CDS  NC_009512  538063  539262  1200  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_001265823  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0632  CDS  NC_009512  709827  710513  687  short chain dehydrogenase  YP_001265984  unclonable  0.0000000000159867  normal  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0633  CDS  NC_009512  710882  711466  585  hypothetical protein  YP_001265985  unclonable  0.0000000000102941  normal  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0682  CDS  NC_009512  766285  767151  867  hypothetical protein  YP_001266031  unclonable  0.0000000000215879  normal  0.0246998  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_1900  CDS  NC_009512  2176490  2177395  906  LysR family transcriptional regulator  YP_001267232  unclonable  0.0000000000662496  normal  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_1992  CDS  NC_009512  2256105  2256419  315  hypothetical protein  YP_001267316  unclonable  0.00000000000239023  decreased coverage  0.00000882432  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_3214  CDS  NC_009512  3626571  3627377  807  HNH endonuclease  YP_001268524  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_3448  CDS  NC_009512  3852964  3853215  252  outer membrane lipoprotein OprI  YP_001268758  unclonable  0.000000000000811412  hitchhiker  0.0000187275  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_4357  CDS  NC_009512  4875889  4876266  378  hypothetical protein  YP_001269664  unclonable  0.00000000000135149  normal  0.0272701  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_4639  CDS  NC_009512  5204199  5205152  954  histone deacetylase superfamily protein  YP_001269943  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_4740  CDS  NC_009512  5307172  5307936  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001270044  unclonable  0.0000000000261149  unclonable  0.000000000503217  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>