15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pput_0074  CDS  NC_009512  80465  81250  -  786  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_001265433  unclonable  0.0000000000185774  normal  0.109161  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0178  CDS  NC_009512  183347  184567  +  1221  Formyl-CoA transferase  YP_001265537  unclonable  0.0000000000710796  normal  0.705206  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0335  CDS  NC_009512  382083  382910  +  828  hypothetical protein  YP_001265692  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0384  CDS  NC_009512  446377  447264  -  888  transporter DMT superfamily protein  YP_001265741  unclonable  0.0000000000682799  normal  1  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0469  CDS  NC_009512  538063  539262  +  1200  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_001265823  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0632  CDS  NC_009512  709827  710513  -  687  short chain dehydrogenase  YP_001265984  unclonable  0.0000000000159867  normal  1  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0633  CDS  NC_009512  710882  711466  -  585  hypothetical protein  YP_001265985  unclonable  0.0000000000102941  normal  1  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0682  CDS  NC_009512  766285  767151  +  867  hypothetical protein  YP_001266031  unclonable  0.0000000000215879  normal  0.0246998  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_1900  CDS  NC_009512  2176490  2177395  -  906  LysR family transcriptional regulator  YP_001267232  unclonable  0.0000000000662496  normal  1  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_1992  CDS  NC_009512  2256105  2256419  +  315  hypothetical protein  YP_001267316  unclonable  0.00000000000239023  decreased coverage  0.00000882432  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_3214  CDS  NC_009512  3626571  3627377  -  807  HNH endonuclease  YP_001268524  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_3448  CDS  NC_009512  3852964  3853215  +  252  outer membrane lipoprotein OprI  YP_001268758  unclonable  0.000000000000811412  hitchhiker  0.0000187275  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_4357  CDS  NC_009512  4875889  4876266  +  378  hypothetical protein  YP_001269664  unclonable  0.00000000000135149  normal  0.0272701  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_4639  CDS  NC_009512  5204199  5205152  +  954  histone deacetylase superfamily protein  YP_001269943  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_4740  CDS  NC_009512  5307172  5307936  -  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001270044  unclonable  0.0000000000261149  unclonable  0.000000000503217  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>