31 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Maqu_0001  CDS  NC_008740  466  1929  +  1464  chromosomal replication initiation protein  YP_957296  unclonable  0.0000189853  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0002  CDS  NC_008740  1990  3093  +  1104  DNA polymerase III, beta subunit  YP_957297  unclonable  0.00000348538  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0559  CDS  NC_008740  634382  636478  +  2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_957847  unclonable  0.000154535  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0611  CDS  NC_008740  700231  702867  +  2637  regulatory protein, LuxR  YP_957899  unclonable  0.000972895  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0697  CDS  NC_008740  797075  798277  +  1203  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_957982  unclonable  0.00000250226  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0717  CDS  NC_008740  829164  830360  +  1197  elongation factor Tu  YP_958001  unclonable  0.00000389336  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0773  CDS  NC_008740  875018  876019  +  1002  outer membrane protein (porin)  YP_958057  unclonable  0.00000136886  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0887  CDS  NC_008740  1009097  1009717  +  621  ferric reductase domain-containing protein  YP_958170  unclonable  0.000000512451  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1092  CDS  NC_008740  1242801  1243814  -  1014  extracellular solute-binding protein  YP_958371  unclonable  0.00000221625  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1530  CDS  NC_008740  1708927  1709988  -  1062  putative periplasmic protease  YP_958801  unclonable  0.00000285162  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1578  CDS  NC_008740  1765597  1766445  -  849  hypothetical protein  YP_958849  unclonable  0.000000645416  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1613  CDS  NC_008740  1806139  1808052  -  1914  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_958884  unclonable  0.0000410993  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1697  CDS  NC_008740  1902668  1903444  -  777  tetratricopeptide domain-containing protein  YP_958968  unclonable  0.000000538849  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1707  CDS  NC_008740  1910545  1912344  -  1800  aspartyl-tRNA synthetase  YP_958978  unclonable  0.0000468378  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1730  CDS  NC_008740  1933872  1935746  +  1875  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_959001  unclonable  0.0000665124  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1731  CDS  NC_008740  1936060  1936269  +  210  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_959002  unclonable  0.0000000915529  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2192  CDS  NC_008740  2453284  2455461  -  2178  TonB-dependent siderophore receptor  YP_959458  unclonable  0.000215305  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2415  CDS  NC_008740  2699860  2700210  -  351  iojap-like protein  YP_959677  unclonable  0.0000000527491  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2444  CDS  NC_008740  2729335  2730291  -  957  peptidase M23B  YP_959706  unclonable  0.00000108635  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2483  CDS  NC_008740  2773336  2773647  -  312  hypothetical protein  YP_959745  unclonable  0.000000152567  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2637  CDS  NC_008740  2967023  2968513  +  1491  hypothetical protein  YP_959899  unclonable  0.0000108196  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2695  CDS  NC_008740  3020555  3022402  -  1848  hypothetical protein  YP_959957  unclonable  0.0000566517  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2728  CDS  NC_008740  3051817  3052860  -  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_959990  unclonable  0.000000992624  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2750  CDS  NC_008740  3077679  3079478  -  1800  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_960012  unclonable  0.000084613  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2921  CDS  NC_008740  3263942  3264529  +  588  hypothetical protein  YP_960182  unclonable  0.000000407066  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2932  CDS  NC_008740  3272384  3272875  +  492  hypothetical protein  YP_960193  unclonable  0.000000232307  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2975  CDS  NC_008740  3306568  3307128  +  561  hypothetical protein  YP_960236  unclonable  0.000000170346  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_R0006  rRNA  NC_008740  798762  800294  +  1533  16S ribosomal RNA    unclonable  0.0000147722  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_R0016  rRNA  NC_008740  1010143  1011675  +  1533  16S ribosomal RNA    unclonable  0.0000272502  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_R0038  tRNA  NC_008740  1902479  1902554  -  76  tRNA-Lys    unclonable  0.0000000329533  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_R0059  rRNA  NC_008740  2768183  2769715  -  1533  16S ribosomal RNA    unclonable  0.0000114912  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>