48 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
YpAngola_0109  CDS  NC_010158  87911  90277  -  2367  cobT family protein  YP_001604619  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0110  CDS  NC_010158  90387  90599  -  213  hypothetical protein  YP_001604620  hitchhiker  6.02223e-111  unclonable  5.443910000000001e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0112    NC_010158  90862  91248  +  387      unclonable  1.0507799999999999e-112  hitchhiker  7.414119999999999e-138  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0301  CDS  NC_010159  319227  319442  +  216  30S ribosomal protein S21  YP_001604918  unclonable  0.000000000000915609  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0302  CDS  NC_010159  319578  321326  +  1749  DNA primase  YP_001604919  unclonable  0.000000000195537  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0321  CDS  NC_010159  335873  336400  +  528  flavodoxin FldA  YP_001604935  unclonable  0.00000000000460147  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0410  CDS  NC_010159  425588  426967  +  1380  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_001605016  unclonable  0.000000000134785  hitchhiker  0.000369784  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0444  CDS  NC_010159  465979  466518  -  540  attachment invasion locus protein  YP_001605049  unclonable  0.00000000000196272  hitchhiker  0.00000073955  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0755  CDS  NC_010159  767150  768556  -  1407  replicative DNA helicase  YP_001605331  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1105  CDS  NC_010159  1144240  1145544  +  1305  putative hexuronate MFS transporter ExuT  YP_001605651  unclonable  0.0000000000998284  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1106  CDS  NC_010159  1145807  1146601  +  795  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  YP_001605652  unclonable  0.0000000000240199  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1211  CDS  NC_010159  1259378  1260445  +  1068  tRNA-dihydrouridine synthase B  YP_001605752  unclonable  0.000000000054155  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1378  CDS  NC_010159  1434864  1435442  +  579  heat shock protein GrpE  YP_001605904  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1658  CDS  NC_010159  1712903  1714984  +  2082  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  YP_001606158  unclonable  0.000000000881395  normal  0.485091  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1659  CDS  NC_010159  1715206  1715484  +  279  hypothetical protein  YP_001606159  unclonable  0.00000000000155874  normal  0.221825  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1660  CDS  NC_010159  1715706  1716545  -  840  23S rRNA methyltransferase A  YP_001606160  unclonable  0.00000000000847833  normal  0.340035  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1661  CDS  NC_010159  1716919  1717674  +  756  hypothetical protein  YP_001606161  unclonable  0.00000000000830855  normal  0.376389  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1662  CDS  NC_010159  1718017  1718133  -  117  hypothetical protein  YP_001606162  unclonable  0.00000000000154288  normal  0.321948  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1768  CDS  NC_010159  1831583  1832464  +  882  threonine and homoserine efflux system  YP_001606257  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1769  CDS  NC_010159  1832480  1832977  +  498  acetyltransferase  YP_001606258  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1852  CDS  NC_010159  1920130  1921332  +  1203  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  YP_001606339  unclonable  0.0000000000648798  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1942  CDS  NC_010159  2014794  2015312  -  519  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_001606416  unclonable  0.00000000000534857  normal  0.179593  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1943  CDS  NC_010159  2015381  2017132  -  1752  hypothetical protein  YP_001606417  unclonable  0.000000000294909  normal  0.195502  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2054  CDS  NC_010159  2141382  2141930  +  549  phosphatidylglycerophosphate synthetase  YP_001606523  unclonable  0.00000000000503595  hitchhiker  0.00039337  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2055  tRNA  NC_010159  2142075  2142150  +  76  tRNA-Gly    unclonable  0.00000000000108601  hitchhiker  0.000600208  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2056  tRNA  NC_010159  2142202  2142277  +  76  tRNA-Cys    unclonable  0.000000000000925021  hitchhiker  0.000585084  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2057  tRNA  NC_010159  2142287  2142372  +  86  tRNA-Leu    unclonable  0.000000000000934529  hitchhiker  0.00059391  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2058    NC_010159  2142513  2142737  -  225      unclonable  0.00000000000131446  hitchhiker  0.000669909  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2059    NC_010159  2143296  2143523  +  228      unclonable  0.00000000000177553  hitchhiker  0.000168119  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2625  CDS  NC_010159  2747746  2749674  -  1929  threonyl-tRNA synthetase  YP_001607032  unclonable  0.000000000821618  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2745  CDS  NC_010159  2870070  2871056  -  987  cell division protein ZipA  YP_001607139  unclonable  0.0000000000202555  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2799  tRNA  NC_010159  2932412  2932489  +  78  tRNA-Thr    unclonable  0.00000000000124978  normal  0.096994  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2800  tRNA  NC_010159  2932507  2932591  +  85  tRNA-Tyr    unclonable  0.00000000000115343  normal  0.0987715  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2912  CDS  NC_010159  3058801  3059736  -  936  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001607290  unclonable  0.0000000000327717  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3055  CDS  NC_010159  3230475  3231779  -  1305  trigger factor  YP_001607421  unclonable  0.000000000166473  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3100  CDS  NC_010159  3275556  3276953  -  1398  multidrug efflux system protein MdtE  YP_001607464  unclonable  0.00000000024134  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3199  CDS  NC_010159  3390831  3391892  -  1062  outer membrane protein A  YP_001607555  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3242  CDS  NC_010159  3439055  3439741  +  687  DNA mismatch repair protein  YP_001607593  unclonable  0.0000000000170849  normal  0.0183168  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3675  CDS  NC_010159  3898900  3901008  -  2109  elongation factor G  YP_001607995  unclonable  0.00000000179981  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3825  CDS  NC_010159  4059698  4060027  -  330  Z-ring-associated protein  YP_001608134  unclonable  0.0000000000023514  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3974  CDS  NC_010159  4229722  4230033  +  312  50S ribosomal protein L21  YP_001608270  unclonable  0.00000000000270537  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3975  CDS  NC_010159  4230053  4230310  +  258  50S ribosomal protein L27  YP_001608271  unclonable  0.00000000000219143  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3976  CDS  NC_010159  4230398  4231336  +  939  hypothetical protein  YP_001608272  unclonable  0.0000000000242668  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A4178  CDS  NC_010159  4470966  4471106  +  141  50S ribosomal protein L34  YP_001608449  unclonable  0.00000000000372649  normal  0.0228547  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A4179  CDS  NC_010159  4471161  4471289  -  129  hypothetical protein  YP_001608450  unclonable  0.0000000000039985  normal  0.0230304  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A4180  CDS  NC_010159  4471371  4471484  +  114  ribonuclease P protein component  YP_001608451  unclonable  0.0000000000040396  normal  0.023392  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A4182  CDS  NC_010159  4471708  4473348  +  1641  putative inner membrane protein translocase component YidC  YP_001608452  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A4241  misc_RNA  NC_010159  4059461  4059642  -  182  6S / SsrS RNA    unclonable  0.00000000000128814  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>