23 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Amuc_0075  CDS  NC_010655  97286  98353  -  1068  PfkB domain protein  YP_001876701  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0198  CDS  NC_010655  247900  248247  -  348  ribosomal protein L19  YP_001876823  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0281  CDS  NC_010655  341069  341374  +  306  histone family protein DNA-binding protein  YP_001876904  unclonable  0.00000000512973  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0308  CDS  NC_010655  363808  364191  -  384  30S ribosomal protein S12  YP_001876931  unclonable  0.00000000773303  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0371  CDS  NC_010655  439476  442052  -  2577  two component regulator propeller domain protein  YP_001876991  unclonable  0.00000833804  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0544  CDS  NC_010655  642890  646123  -  3234  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_001877163  unclonable  0.0000321228  normal  0.11155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0799  CDS  NC_010655  937083  940661  +  3579  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  YP_001877414  unclonable  0.000076441  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0824  CDS  NC_010655  969353  973147  +  3795  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  YP_001877438  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1048  CDS  NC_010655  1249991  1251175  -  1185  elongation factor Tu  YP_001877655  unclonable  0.0000000767064  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1085  CDS  NC_010655  1296592  1297809  +  1218  Carbohydrate-selective porin OprB  YP_001877692  unclonable  0.000000116954  decreased coverage  8.02155e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1086  CDS  NC_010655  1298356  1298763  +  408  hypothetical protein  YP_001877693  unclonable  0.00000000829745  hitchhiker  1.57217e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1255  CDS  NC_010655  1514755  1515003  -  249  protein of unknown function DUF37  YP_001877861  unclonable  0.00000000204155  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1256  CDS  NC_010655  1515000  1515347  -  348  ribonuclease P protein component  YP_001877862  unclonable  0.00000000286956  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1257  CDS  NC_010655  1515436  1515621  -  186  ribosomal protein L34  YP_001877863  unclonable  0.00000000162136  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1364  CDS  NC_010655  1633843  1634412  -  570  hypothetical protein  YP_001877969  hitchhiker  0.0000132195  unclonable  9.753820000000001e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1365  CDS  NC_010655  1634688  1635446  -  759  hypothetical protein  YP_001877970  hitchhiker  0.000000479833  unclonable  1.94638e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1366  CDS  NC_010655  1635562  1635774  +  213  hypothetical protein  YP_001877971  hitchhiker  0.0000000668463  unclonable  6.93938e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1367  CDS  NC_010655  1635927  1636721  +  795  prophage antirepressor  YP_001877972  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1539  CDS  NC_010655  1849845  1851008  -  1164  homoserine O-acetyltransferase  YP_001878141  unclonable  0.000000120571  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1710  CDS  NC_010655  2076603  2078753  +  2151  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  YP_001878309  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1714  CDS  NC_010655  2082977  2084275  +  1299  Histidinol dehydrogenase  YP_001878313  unclonable  0.00000013465  hitchhiker  0.000000000040894  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1769  CDS  NC_010655  2151739  2155254  -  3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  YP_001878368  unclonable  0.0000889358  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_1813  CDS  NC_010655  2199958  2201343  -  1386  MATE efflux family protein  YP_001878412  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>