27 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bamb_0229  CDS  NC_008390  264604  265524  +  921  LysR family transcriptional regulator  YP_772123  unclonable  0.00000000369009  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0364  CDS  NC_008390  404330  405241  +  912  hypothetical protein  YP_772258  unclonable  0.00000000627109  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0468  CDS  NC_008390  531100  532296  +  1197  cell division protein FtsZ  YP_772361  unclonable  0.0000000208487  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0975  CDS  NC_008390  1064836  1065159  -  324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_772868  unclonable  0.000000000429324  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1260  CDS  NC_008390  1376276  1380223  +  3948  cellulose synthase domain-containing protein  YP_773152  unclonable  0.00414022  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1934  CDS  NC_008390  2131194  2132249  +  1056  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  YP_773824  unclonable  0.0000000179366  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_2288  CDS  NC_008390  2524217  2524594  -  378  preprotein translocase subunit SecG  YP_774178  unclonable  0.000000000673415  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4120  CDS  NC_008391  1041944  1042435  +  492  hypothetical protein  YP_776007  unclonable  0.000000000109013  hitchhiker  0.0081168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4350  CDS  NC_008391  1277797  1278123  +  327  hypothetical protein  YP_776236  normal  1  unclonable  0.00000333846  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4351  CDS  NC_008391  1278139  1279320  -  1182  cytochrome P450-like protein  YP_776237  normal  1  unclonable  0.00000524199  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4352  CDS  NC_008391  1279485  1279748  -  264  hypothetical protein  YP_776238  normal  1  unclonable  0.00000403824  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4353  CDS  NC_008391  1280081  1280941  -  861  PEP phosphonomutase  YP_776239  normal  1  unclonable  0.00000493526  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4354  CDS  NC_008391  1281342  1282202  -  861  RpiR family transcriptional regulator  YP_776240  normal  0.339513  unclonable  0.00000424592  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4355  CDS  NC_008391  1282258  1282611  -  354  hypothetical protein  YP_776241  normal  0.0513241  unclonable  0.00000351015  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4356  CDS  NC_008391  1282837  1283499  +  663  two component transcriptional regulator  YP_776242  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4357  CDS  NC_008391  1283496  1284872  +  1377  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_776243  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4358  CDS  NC_008391  1285083  1285529  +  447  MarR family transcriptional regulator  YP_776244  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4359  CDS  NC_008391  1285568  1285936  +  369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  YP_776245  decreased coverage  0.0000000189574  unclonable  0.00000450981  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4360  CDS  NC_008391  1286725  1287618  -  894  Beta-lactamase  YP_776246  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4434  CDS  NC_008391  1370047  1371603  +  1557  hypothetical protein  YP_776319  unclonable  0.0000000330507  unclonable  0.0000165626  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4655  CDS  NC_008391  1637826  1638377  -  552  HD phosphohydrolase-like protein  YP_776539  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4656  CDS  NC_008391  1638382  1639836  -  1455  aldehyde dehydrogenase  YP_776540  unclonable  0.0000000188591  normal  0.0270817  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0007  rRNA  NC_008390  290626  292151  +  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  0.000000074395  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0034  tRNA  NC_008390  1064655  1064730  -  76  tRNA-Asn    unclonable  0.000000000129233  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0067  rRNA  NC_008390  2491545  2493070  -  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  0.0000000751539  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0068  tRNA  NC_008390  2524022  2524106  -  85  tRNA-Leu    unclonable  0.000000000144281  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0084  rRNA  NC_008391  1635784  1637309  -  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  0.0000000608912  normal  0.0264011  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>