18 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rfer_0001  CDS  NC_007908  7  1419  +  1413  chromosomal replication initiation protein  YP_521294  unclonable  0.000000852444  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_0013  CDS  NC_007908  14571  15326  -  756  GntR family transcriptional regulator  YP_521306  unclonable  0.0000000501062  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
 
Rfer_0014  CDS  NC_007908  15516  16868  +  1353  fumarate lyase  YP_521307  unclonable  0.000000353189  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_0528  CDS  NC_007908  552646  553662  +  1017  porin  YP_521810  unclonable  0.000000423032  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_0965  CDS  NC_007908  1016453  1017295  +  843  extracellular solute-binding protein  YP_522240  unclonable  0.0000000439884  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
 
Rfer_1099  CDS  NC_007908  1177505  1178767  +  1263  extracellular solute-binding protein  YP_522371  unclonable  0.000000491601  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_1583  CDS  NC_007908  1714025  1715452  -  1428  cytochrome c, class I  YP_522846  unclonable  0.000000740916  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_1746  CDS  NC_007908  1882251  1882997  -  747  PE-PGRS family protein  YP_523006  unclonable  0.0000000877581  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
 
Rfer_2071  CDS  NC_007908  2244661  2246916  +  2256  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  YP_523327  unclonable  0.0000208286  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_2140  CDS  NC_007908  2322234  2322776  -  543  phasin  YP_523395  unclonable  0.0000000178804  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_2176  CDS  NC_007908  2375664  2376200  +  537  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_523431  unclonable  0.0000000532163  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_2739  CDS  NC_007908  3023344  3024759  +  1416  hypothetical protein  YP_523983  unclonable  0.000000852444  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_3798  CDS  NC_007908  4238230  4240332  -  2103  elongation factor G  YP_525029  unclonable  0.0000136641  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_3799  CDS  NC_007908  4240496  4240969  -  474  30S ribosomal protein S7  YP_525030  unclonable  0.0000000156972  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_3800  CDS  NC_007908  4241119  4241496  -  378  30S ribosomal protein S12  YP_525031  unclonable  0.0000000117431  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
 
Rfer_3801  CDS  NC_007908  4241685  4242869  -  1185  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  YP_525032  unclonable  0.000000264221  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_3805  CDS  NC_007908  4245200  4246216  +  1017  delta-aminolevulinic acid dehydratase  YP_525036  unclonable  0.000000100968  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_4080  CDS  NC_007908  4550312  4553122  -  2811  hypothetical protein  YP_525309  unclonable  0.000183317  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>