76 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ppro_0175  CDS  NC_008609  179738  180544  +  807  DNA/RNA non-specific endonuclease  YP_899869  unclonable  0.000000000379253  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0441  CDS  NC_008609  462505  463758  -  1254  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_900132  unclonable  0.00000000726931  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0516  CDS  NC_008609  542371  544392  +  2022  TPR repeat-containing protein  YP_900205  unclonable  0.000000776603  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0521  CDS  NC_008609  552505  553899  -  1395  LamB porin family protein, putative  YP_900210  unclonable  0.0000000174972  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0523  CDS  NC_008609  554932  556587  -  1656  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  YP_900212  unclonable  0.000000113835  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0524  CDS  NC_008609  556899  557462  -  564  XRE family transcriptional regulator  YP_900213  unclonable  0.0000000000827128  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0525  CDS  NC_008609  557699  558985  -  1287  hypothetical protein  YP_900214  unclonable  0.00000000837043  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0526  CDS  NC_008609  559194  560552  +  1359  transposase, IS4 family protein  YP_900215  unclonable  0.0000000180348  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0733  CDS  NC_008609  771322  772023  -  702  hypothetical protein  YP_900422  unclonable  0.000000000336107  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0734  CDS  NC_008609  772422  773594  -  1173  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  YP_900423  unclonable  0.00000000812093  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0735  CDS  NC_008609  773764  774858  -  1095  phosphoserine aminotransferase  YP_900424  unclonable  0.00000000198961  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0861  CDS  NC_008609  903800  905158  -  1359  transposase, IS4 family protein  YP_900548  unclonable  0.0000000191702  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0896  CDS  NC_008609  942843  944201  +  1359  transposase, IS4 family protein  YP_900583  unclonable  0.0000000120479  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1099  CDS  NC_008609  1145450  1146811  -  1362  signal recognition particle protein  YP_900782  unclonable  0.00000000944997  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1107  CDS  NC_008609  1151436  1152794  +  1359  transposase, IS4 family protein  YP_900790  unclonable  0.0000000102477  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1128  CDS  NC_008609  1169600  1170958  +  1359  transposase, IS4 family protein  YP_900810  unclonable  0.0000000155023  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1167  CDS  NC_008609  1217853  1219199  -  1347  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  YP_900848  unclonable  0.0000000118063  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1168  CDS  NC_008609  1219357  1219761  -  405  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_900849  unclonable  0.000000000039809  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1169  CDS  NC_008609  1219934  1221598  +  1665  peptidoglycan-binding LysM  YP_900850  unclonable  0.0000000824633  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1221  CDS  NC_008609  1275079  1276713  -  1635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_900900  unclonable  0.000000143655  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1328  CDS  NC_008609  1403688  1404545  -  858  putative orphan protein  YP_901006  unclonable  0.000000000965444  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1480  CDS  NC_008609  1584062  1585420  +  1359  transposase, IS4 family protein  YP_901154  unclonable  0.0000000216314  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1541  CDS  NC_008609  1643912  1645909  -  1998  TonB-dependent receptor  YP_901214  unclonable  0.000000885863  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1649  CDS  NC_008609  1768702  1770060  -  1359  transposase, IS4 family protein  YP_901321  unclonable  0.000000032724  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1934  CDS  NC_008609  2083392  2084366  +  975  bile acid:sodium symporter  YP_901601  unclonable  0.00000000370816  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1973  CDS  NC_008609  2117476  2118051  +  576  iron-sulfur cluster-binding protein  YP_901639  unclonable  0.0000000000537641  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_1995  CDS  NC_008609  2141706  2143025  -  1320  diaminopimelate decarboxylase  YP_901661  unclonable  0.0000000281435  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2196  CDS  NC_008609  2367216  2367692  +  477  hypothetical protein  YP_901861  unclonable  0.0000000000618592  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2252  CDS  NC_008609  2431668  2433533  +  1866  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_901917  unclonable  0.000000390574  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2262  CDS  NC_008609  2441380  2442594  +  1215  aspartate kinase  YP_901927  unclonable  0.0000000147386  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2263  CDS  NC_008609  2442680  2443321  -  642  hypothetical protein  YP_901928  unclonable  0.000000000459083  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2327  CDS  NC_008609  2512327  2513280  -  954  malate dehydrogenase  YP_901992  unclonable  0.00000000213554  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2328  CDS  NC_008609  2513642  2514346  -  705  peptidoglycan-binding LysM  YP_901993  unclonable  0.000000000346433  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2488  CDS  NC_008609  2695283  2695990  -  708  carbonic anhydrase  YP_902151  unclonable  0.000000000357075  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2491  CDS  NC_008609  2699207  2699710  +  504  MucR family transcriptional regulator  YP_902154  unclonable  0.000000000203493  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2560  CDS  NC_008609  2773871  2775592  +  1722  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  YP_902222  unclonable  0.000000271615  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2580  CDS  NC_008609  2796154  2797512  +  1359  transposase, IS4 family protein  YP_902242  unclonable  0.000000022544  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2649  CDS  NC_008609  2876913  2877650  -  738  FAD-dependent thymidylate synthase  YP_902311  unclonable  0.000000000329367  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2650  CDS  NC_008609  2877733  2877933  -  201  50S ribosomal protein L31  YP_902312  unclonable  0.0000000000189789  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2651  CDS  NC_008609  2878038  2879285  -  1248  transcription termination factor Rho  YP_902313  unclonable  0.0000000111099  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2656  CDS  NC_008609  2890021  2891727  -  1707  TPR repeat-containing protein  YP_902317  unclonable  0.000000162187  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2730  CDS  NC_008609  2986962  2987531  +  570  peptidylprolyl isomerase  YP_902388  unclonable  0.0000000000677022  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2731  CDS  NC_008609  2987603  2988340  +  738  competence protein F, putative  YP_902389  unclonable  0.000000000243751  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2733  CDS  NC_008609  2989042  2992536  -  3495  SNF2-related protein  YP_902391  unclonable  0.000591247  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2734  CDS  NC_008609  2992707  2992985  +  279  hypothetical protein  YP_902392  unclonable  0.000000000024868  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2735  CDS  NC_008609  2993002  2994948  +  1947  L-lactate transport  YP_902393  unclonable  0.000000895009  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2803  CDS  NC_008609  3069338  3069625  -  288  co-chaperonin GroES  YP_902460  unclonable  0.0000000000132343  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2957  CDS  NC_008609  3228586  3229257  -  672  two component transcriptional regulator  YP_902612  unclonable  0.000000000406961  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2958  CDS  NC_008609  3229254  3230096  -  843  hypothetical protein  YP_902613  unclonable  0.00000000086443  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2959  CDS  NC_008609  3230242  3231171  +  930  ribosomal protein L11 methyltransferase  YP_902614  unclonable  0.00000000148567  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2963  CDS  NC_008609  3234505  3235434  +  930  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  YP_902618  unclonable  0.000000000291973  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_2987  CDS  NC_008609  3256555  3257703  -  1149  Na+/H+ antiporter NhaA  YP_902642  unclonable  0.00000000224561  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3086  CDS  NC_008609  3375681  3376109  -  429  50S ribosomal protein L13  YP_902739  unclonable  0.0000000000435691  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3095  CDS  NC_008609  3384764  3385201  +  438  TraR/DksA family transcriptional regulator  YP_902748  unclonable  0.0000000000335768  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3115  CDS  NC_008609  3417935  3418753  -  819  hypothetical protein  YP_902766  unclonable  0.000000000743254  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3228  CDS  NC_008609  3545803  3547161  +  1359  transposase, IS4 family protein  YP_902879  unclonable  0.0000000223138  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3243  CDS  NC_008609  3562887  3563735  -  849  peptidase M48, Ste24p  YP_902894  unclonable  0.000000000873344  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3252  CDS  NC_008609  3573251  3574630  -  1380  hypothetical protein  YP_902903  unclonable  0.0000000270257  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3284  CDS  NC_008609  3619394  3620632  -  1239  cell division protein FtsA  YP_902934  unclonable  0.00000000382408  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3479  CDS  NC_008609  3841182  3842540  -  1359  transposase, IS4 family protein  YP_903129  unclonable  0.0000000173185  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3501  CDS  NC_008609  3870144  3871172  +  1029  putative lipoprotein  YP_903151  unclonable  0.00000000161066  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3504  CDS  NC_008609  3873701  3875059  -  1359  transposase, IS4 family protein  YP_903154  unclonable  0.0000000103535  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3515  CDS  NC_008609  3885388  3888252  +  2865  excinuclease ABC, A subunit  YP_903165  unclonable  0.0000620303  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3534  CDS  NC_008609  3905316  3906674  +  1359  transposase, IS4 family protein  YP_903184  unclonable  0.0000000144429  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3566  CDS  NC_008609  3940372  3941325  -  954  import inner membrane translocase, subunit Tim44  YP_903215  unclonable  0.00000000205074  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3594  CDS  NC_008609  3974034  3975080  -  1047  rod shape-determining protein MreB  YP_903243  unclonable  0.0000000028278  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3604  CDS  NC_008609  3986997  3987194  -  198  hypothetical protein  YP_903253  unclonable  0.0000000000133707  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3663  CDS  NC_008607  40565  41128  -  564  nuclease  YP_899508  unclonable  0.00000641477  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3664  CDS  NC_008607  41908  42561  +  654  hypothetical protein  YP_899509  unclonable  0.0000112118  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3682  CDS  NC_008607  62963  63742  -  780  hypothetical protein  YP_899526  unclonable  0.0000140139  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3683  CDS  NC_008607  63778  66153  -  2376  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_899527  unclonable  0.00270096  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3751  CDS  NC_008607  127538  128215  +  678  hypothetical protein  YP_899595  unclonable  0.0000130592  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3763  CDS  NC_008607  137854  138381  -  528  membrane-bound metal-dependent hydrolase  YP_899605  unclonable  0.00000367548  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3764  CDS  NC_008607  138363  138947  -  585  peptidase M23B  YP_899606  unclonable  0.00000390707  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3806  CDS  NC_008607  185069  185515  -  447  MucR family transcriptional regulator  YP_899647  unclonable  0.00000654618  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3859    NC_008609  2117107  2117358  -  252      unclonable  0.00000000000594503  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>