18 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bcen2424_0920  CDS  NC_008542  1028847  1029791  -  945  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_834566  unclonable  0.0000000000171601  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_1288  CDS  NC_008542  1415473  1417050  +  1578  lytic transglycosylase, catalytic  YP_834933  unclonable  0.000000000451956  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_1321  CDS  NC_008542  1453012  1454283  -  1272  RelA/SpoT domain-containing protein  YP_834966  unclonable  0.000000000180036  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_2520  CDS  NC_008542  2792692  2792895  +  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_836163  unclonable  0.000000000000151269  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3153  CDS  NC_008542  3473574  3473987  +  414  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_836794  unclonable  0.0000000000010528  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4933  CDS  NC_008543  1932186  1939226  -  7041  outer membrane autotransporter  YP_838560  normal  0.348524  unclonable  0.000124828  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4934  CDS  NC_008543  1939587  1939832  -  246  hypothetical protein  YP_838561  normal  0.0136868  unclonable  0.0000182876  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4935  CDS  NC_008543  1940001  1940693  -  693  hypothetical protein  YP_838562  normal  1  unclonable  0.0000188472  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4936  CDS  NC_008543  1940861  1941895  -  1035  rod shape-determining protein MreB  YP_838563  normal  1  unclonable  0.0000194239  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4937  CDS  NC_008543  1942167  1944578  +  2412  patatin  YP_838564  normal  1  unclonable  0.0000295709  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4938  CDS  NC_008543  1944678  1945808  -  1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_838565  normal  1  unclonable  0.0000179203  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4939  CDS  NC_008543  1945873  1946601  -  729  two component transcriptional regulator  YP_838566  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4940  CDS  NC_008543  1946803  1947717  +  915  glutaminase  YP_838567  normal  1  unclonable  0.000018103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4941  CDS  NC_008543  1947951  1948856  -  906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_838568  normal  0.89804  unclonable  0.0000194239  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4942  CDS  NC_008543  1949386  1949760  +  375  hypothetical protein  YP_838569  normal  0.140936  unclonable  0.0000158871  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4943  CDS  NC_008543  1949898  1950380  -  483  cupin 2 domain-containing protein  YP_838570  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_R0031  tRNA  NC_008542  1210435  1210510  -  76  tRNA-Asn    unclonable  0.0000000000000420525  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_R0032  tRNA  NC_008542  1210583  1210658  -  76  tRNA-Asn    unclonable  0.0000000000000399959  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>