36 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Nmul_A0055  CDS  NC_007614  61303  62151  +  849  integrase catalytic subunit  YP_410756  unclonable  0.000000315593  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0158  CDS  NC_007614  165600  166439  -  840  hypothetical protein  YP_410858  unclonable  0.000000130307  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0262  CDS  NC_007614  283861  284481  +  621  hypothetical protein  YP_410962  unclonable  0.000000101412  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0276  CDS  NC_007614  296883  298358  +  1476  hypothetical protein  YP_410976  unclonable  0.00000556159  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0483  CDS  NC_007614  540160  542055  +  1896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_411183  unclonable  0.0000161272  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0562  CDS  NC_007614  647597  648469  +  873  phosphoribulokinase  YP_411262  unclonable  0.000000247732  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0673  CDS  NC_007614  772035  772838  +  804  RNA methyltransferase TrmH, group 1  YP_411372  unclonable  0.0000000736147  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0798  CDS  NC_007614  913519  914349  +  831  ammonia monooxygenase/methane monooxygenase, subunit C  YP_411497  unclonable  0.00000020472  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0872  CDS  NC_007614  990746  992275  -  1530  hypothetical protein  YP_411567  unclonable  0.00000269659  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1140  CDS  NC_007614  1312500  1312817  -  318  hypothetical protein  YP_411835  unclonable  0.0000000298564  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1141  CDS  NC_007614  1312849  1313169  +  321  hypothetical protein  YP_411836  unclonable  0.0000000283805  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1142  CDS  NC_007614  1313347  1313667  -  321  hypothetical protein  YP_411837  unclonable  0.0000000225179  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1390  CDS  NC_007614  1581954  1583093  +  1140  hypothetical protein  YP_412085  unclonable  0.000000676729  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1391  CDS  NC_007614  1583207  1583512  +  306  hypothetical protein  YP_412086  unclonable  0.0000000232117  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1398  CDS  NC_007614  1592557  1593132  +  576  hypothetical protein  YP_412093  unclonable  0.0000000313982  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1530  CDS  NC_007614  1750490  1751014  -  525  hypothetical protein  YP_412225  unclonable  0.0000000432543  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1531  CDS  NC_007614  1751511  1752080  +  570  XRE family transcriptional regulator  YP_412226  unclonable  0.0000000256618  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1532  CDS  NC_007614  1752238  1752513  +  276  hypothetical protein  YP_412227  unclonable  0.00000000923745  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1533  CDS  NC_007614  1752600  1752926  +  327  hypothetical protein  YP_412228  unclonable  0.0000000132495  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1534  CDS  NC_007614  1753284  1753541  +  258  hypothetical protein  YP_412229  unclonable  0.0000000131132  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1601  CDS  NC_007614  1834649  1835062  -  414  chain A, red copper protein nitrosocyanin  YP_412294  unclonable  0.0000000567409  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1739  CDS  NC_007614  1991274  1992218  +  945  transcriptional regulator CysB-like protein  YP_412428  unclonable  0.000000279611  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2114  CDS  NC_007614  2409683  2410480  +  798  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_412799  unclonable  0.000000109897  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2215  CDS  NC_007614  2514979  2515674  +  696  hypothetical protein  YP_412899  unclonable  0.000000153024  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2337  CDS  NC_007614  2662757  2663029  -  273  histone-like DNA-binding protein  YP_413020  unclonable  0.0000000498066  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2344  CDS  NC_007614  2671276  2672934  -  1659  chaperonin GroEL  YP_413027  unclonable  0.00000584882  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2345  CDS  NC_007614  2672987  2673277  -  291  co-chaperonin GroES  YP_413028  unclonable  0.0000000286758  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2346  CDS  NC_007614  2673587  2673994  +  408  hypothetical protein  YP_413029  unclonable  0.0000000437044  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2486  CDS  NC_007614  2840623  2841540  -  918  peptidase M23B  YP_413167  unclonable  0.000000462301  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2561  CDS  NC_007614  2933433  2934716  -  1284  porin  YP_413242  unclonable  0.000000690644  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2636  CDS  NC_007614  3022090  3022833  -  744  coenzyme PQQ synthesis C  YP_413315  unclonable  0.000000230903  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2663  CDS  NC_007614  3056810  3057661  -  852  formate/nitrite transporter  YP_413342  unclonable  0.000000134322  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2664  CDS  NC_007614  3057699  3058322  -  624  hypothetical protein  YP_413343  unclonable  0.0000000468896  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2766  CDS  NC_007614  3171483  3172313  -  831  ammonia monooxygenase/methane monooxygenase, subunit C  YP_413445  unclonable  0.000000288228  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2767  CDS  NC_007614  3172696  3173553  -  858  parB-like partition proteins  YP_413446  unclonable  0.000000194668  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_AR0043  tRNA  NC_007614  2662667  2662742  -  76  tRNA-Val    unclonable  0.0000000280883  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>