18 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Noc_0443  CDS  NC_007484  479823  479963  -  141  hypothetical protein  YP_342497  unclonable  0.000000000000795345  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0677  CDS  NC_007484  734486  734965  +  480  hypothetical protein  YP_342726  unclonable  0.00000000000364222  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0888  CDS  NC_007484  969458  969727  +  270  acylphosphatase  YP_342930  unclonable  0.0000000000010114  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Noc_0889  CDS  NC_007484  970002  970457  +  456  multicopper oxidase, type 3  YP_342931  unclonable  0.00000000000356897  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0993  CDS  NC_007484  1100150  1100668  -  519  hypothetical protein  YP_343032  unclonable  0.00000000000379205  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_1816  CDS  NC_007484  2057810  2058631  -  822  hemolysin-type calcium-binding region  YP_343816  unclonable  0.0000000000360233  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Noc_1817  CDS  NC_007484  2058831  2060198  -  1368  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  YP_343817  unclonable  0.000000000964329  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_1990  CDS  NC_007484  2288077  2289069  +  993  hypothetical protein  YP_343982  unclonable  0.000000000122481  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2250  CDS  NC_007484  2598576  2599994  -  1419  glutamyl-tRNA synthetase  YP_344238  unclonable  0.000000000347292  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2501  CDS  NC_007484  2845776  2846966  -  1191  monooxygenase subunit B protein  YP_344484  unclonable  0.000000000158949  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2502  CDS  NC_007484  2847092  2847835  -  744  ammonia monooxygenase  YP_344485  unclonable  0.0000000000136472  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Noc_2503  CDS  NC_007484  2848145  2848930  -  786  ammonia monooxygenase/methane monooxygenase, subunit C  YP_344486  unclonable  0.000000000017705  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Noc_2532  CDS  NC_007484  2884629  2885588  +  960  OmpA/MotB  YP_344515  unclonable  0.0000000000651702  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Noc_2601  CDS  NC_007484  2954247  2955578  -  1332  hypothetical protein  YP_344584  unclonable  0.000000000556017  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2651  CDS  NC_007484  3004009  3004485  +  477  hypothetical protein  YP_344634  unclonable  0.00000000000472667  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2769  CDS  NC_007484  3142269  3142628  +  360  RNA-binding protein, RNP-1  YP_344746  unclonable  0.00000000000135251  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2826  CDS  NC_007484  3201672  3202544  -  873  phosphoribulokinase  YP_344803  unclonable  0.0000000000454104  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2922  CDS  NC_007484  3305750  3306040  -  291  co-chaperonin GroES  YP_344898  unclonable  0.00000000000127335  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>