13 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pden_0111  CDS  NC_008686  102697  103602  -  906  hypothetical protein  YP_913924  unclonable  0.0000000000253104  decreased coverage  0.00222502  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_1825  CDS  NC_008686  1822871  1823380  -  510  CarD family transcriptional regulator  YP_915618  unclonable  0.00000000000495809  normal  0.361852  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_2052  CDS  NC_008686  2060592  2060891  +  300  hypothetical protein  YP_915840  hitchhiker  0.00391376  unclonable  0.000018842  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_2053  CDS  NC_008686  2060891  2061109  +  219  hypothetical protein  YP_915841  hitchhiker  0.00283188  unclonable  0.000018842  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_2054  CDS  NC_008686  2061405  2062328  +  924  hypothetical protein  YP_915842  decreased coverage  0.00000013578  unclonable  0.0000242077  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_2055  CDS  NC_008686  2063243  2063758  +  516  hypothetical protein  YP_915843  normal  0.0592426  unclonable  0.0000237237  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_2056  CDS  NC_008686  2063766  2065175  -  1410  hypothetical protein  YP_915844  normal  0.0826059  unclonable  0.0000278509  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3266  CDS  NC_008687  430569  431600  +  1032  hypothetical protein  YP_917040  normal  1  unclonable  0.0000301763  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3267  CDS  NC_008687  431624  432613  +  990  amidohydrolase 2  YP_917041  normal  1  unclonable  0.0000314139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3268  CDS  NC_008687  432650  434680  +  2031  hypothetical protein  YP_917042  normal  1  unclonable  0.0000411591  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3772  CDS  NC_008687  910818  911285  -  468  hypothetical protein  YP_917534  hitchhiker  0.00000130829  unclonable  0.0000152701  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3773  CDS  NC_008687  911496  911693  -  198  hypothetical protein  YP_917535  hitchhiker  0.0000000161337  unclonable  0.0000132701  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3774  CDS  NC_008687  911697  911996  -  300  Arc domain-containing protein  YP_917536  hitchhiker  0.00000000331674  unclonable  0.0000139531  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>