41 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Cpha266_0131  CDS  NC_008639  153669  154037  +  369  hypothetical protein  YP_910625  unclonable  0.00000000424664  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0309  CDS  NC_008639  343261  343833  -  573  outer surface protein, putative  YP_910795  unclonable  0.0000000102603  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0418  CDS  NC_008639  461536  463311  +  1776  30S ribosomal protein S1  YP_910900  unclonable  0.00000167097  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0419  CDS  NC_008639  463386  464303  -  918  GTP-binding protein Era  YP_910901  unclonable  0.0000000385747  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0420  CDS  NC_008639  464415  465641  +  1227  cell cycle protein  YP_910902  unclonable  0.000000126174  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0714  CDS  NC_008639  814523  815656  -  1134  hypothetical protein  YP_911193  unclonable  0.0000000860982  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0788  CDS  NC_008639  897813  901118  +  3306  TPR repeat-containing protein  YP_911264  unclonable  0.000957174  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0823  CDS  NC_008639  936297  937367  +  1071  pentapeptide repeat-containing protein  YP_911298  unclonable  0.0000000611936  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_0924  CDS  NC_008639  1052621  1053034  +  414  NUDIX hydrolase  YP_911396  unclonable  0.00000000333933  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1043  CDS  NC_008639  1180237  1180968  +  732  phosphate uptake regulator, PhoU  YP_911514  unclonable  0.0000000148702  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1064  CDS  NC_008639  1204781  1206238  -  1458  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  YP_911530  unclonable  0.000000351305  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1069  CDS  NC_008639  1209785  1210603  +  819  acid phosphatase class B  YP_911534  unclonable  0.0000000258294  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1070  CDS  NC_008639  1210738  1211097  +  360  hypothetical protein  YP_911535  unclonable  0.00000000317533  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1071  CDS  NC_008639  1211171  1212028  +  858  hypothetical protein  YP_911536  unclonable  0.0000000240573  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1084  CDS  NC_008639  1225645  1226556  -  912  ribokinase-like domain-containing protein  YP_911549  unclonable  0.0000000291332  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1093  CDS  NC_008639  1237613  1238314  -  702  hypothetical protein  YP_911558  unclonable  0.0000000166052  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1094  CDS  NC_008639  1238568  1239008  +  441  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  YP_911559  unclonable  0.00000000660088  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1097  CDS  NC_008639  1242262  1243065  -  804  hypothetical protein  YP_911562  unclonable  0.0000000255633  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1273  CDS  NC_008639  1452109  1452381  +  273  RNP-1 like RNA-binding protein  YP_911730  unclonable  0.00000000138361  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1356  CDS  NC_008639  1553070  1554191  -  1122  glycosyl transferase, group 1  YP_911811  unclonable  0.000000136781  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1413  CDS  NC_008639  1609139  1609561  +  423  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_911866  unclonable  0.00000000210655  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1525  CDS  NC_008639  1732576  1733925  -  1350  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  YP_911971  unclonable  0.000000514832  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1564  CDS  NC_008639  1778450  1779559  -  1110  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_912010  unclonable  0.000000112948  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1565  CDS  NC_008639  1779677  1780180  -  504  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  YP_912011  unclonable  0.00000000701157  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1600  CDS  NC_008639  1815258  1816637  -  1380  hypothetical protein  YP_912045  unclonable  0.000000221209  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1610  CDS  NC_008639  1831235  1832317  -  1083  hypothetical protein  YP_912055  unclonable  0.0000000510762  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1699  CDS  NC_008639  1923051  1923536  -  486  transposase IS3/IS911 family protein  YP_912141  unclonable  0.00000000451085  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1717  CDS  NC_008639  1945513  1946235  -  723  curli production assembly/transport component CsgG  YP_912159  unclonable  0.00000000937383  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_1801  CDS  NC_008639  2053271  2055370  -  2100  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  YP_912242  unclonable  0.00000631548  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_2014  CDS  NC_008639  2326764  2327837  +  1074  hypothetical protein  YP_912450  unclonable  0.000000063714  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_2022  CDS  NC_008639  2333665  2334252  -  588  LemA family protein  YP_912458  unclonable  0.0000000112346  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_2023  CDS  NC_008639  2334331  2336532  -  2202  metal dependent phosphohydrolase  YP_912459  unclonable  0.00000900888  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_2043  CDS  NC_008639  2363044  2364114  +  1071  hypothetical protein  YP_912479  unclonable  0.0000000980864  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_2300  CDS  NC_008639  2633406  2633825  -  420  chlorosome envelope protein C  YP_912716  unclonable  0.00000000562289  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_2523  CDS  NC_008639  2887701  2888465  +  765  Type II site-specific deoxyribonuclease  YP_912935  unclonable  0.0000000252998  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_2596  CDS  NC_008639  2975351  2976103  -  753  hypothetical protein  YP_913008  unclonable  0.0000000102603  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_R0019  tRNA  NC_008639  1053155  1053227  +  73  tRNA-Pro    unclonable  0.00000000077385  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_R0020  tRNA  NC_008639  1053256  1053331  +  76  tRNA-Arg    unclonable  0.000000000806008  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_R0021  tRNA  NC_008639  1053357  1053430  +  74  tRNA-His    unclonable  0.00000000077385  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_R0022  tRNA  NC_008639  1053442  1053513  +  72  tRNA-Glu    unclonable  0.000000000692994  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Cpha266_R0048  rRNA  NC_008639  2898750  2900243  -  1494  16S ribosomal RNA    unclonable  0.000000451742  n/a    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>